More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5206 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5206  Triose-phosphate isomerase  100 
 
 		 254 aa  512  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5129  Triose-phosphate isomerase  97.63 
 
 		 254 aa  495  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4666  Triose-phosphate isomerase  97.63 
 
 		 254 aa  495  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3104  Triose-phosphate isomerase  86.11 
 
 		 253 aa  441  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5571  triosephosphate isomerase  68.25 
 
 		 253 aa  330  9e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5400  Triose-phosphate isomerase  66.67 
 
 		 253 aa  321  6e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.344896 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2031  triosephosphate isomerase  59.51 
 
 		 256 aa  291  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3166  Triose-phosphate isomerase  61.79 
 
 		 250 aa  291  7e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136531  normal  0.155629 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1067  triosephosphate isomerase  60.08 
 
 		 256 aa  291  7e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1835  triosephosphate isomerase  61.29 
 
 		 250 aa  288  4e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.83515  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1834  triosephosphate isomerase  58.3 
 
 		 256 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.113682  normal  0.0103278 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4480  triosephosphate isomerase  55.92 
 
 		 251 aa  272  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1736  triosephosphate isomerase  58.47 
 
 		 250 aa  272  5.000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2230  triosephosphate isomerase  56.85 
 
 		 256 aa  270  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4380  Triose-phosphate isomerase  57.32 
 
 		 254 aa  267  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2471  triosephosphate isomerase  58.47 
 
 		 257 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2051  triosephosphate isomerase  54.44 
 
 		 254 aa  267  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3233  Triose-phosphate isomerase  57.26 
 
 		 258 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1138  triosephosphate isomerase  54.03 
 
 		 254 aa  262  4e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1097  triosephosphate isomerase  54.03 
 
 		 254 aa  262  4e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2795  triosephosphate isomerase  56.68 
 
 		 261 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2826  triosephosphate isomerase  55.87 
 
 		 257 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0764  triosephosphate isomerase  56.07 
 
 		 246 aa  251  6e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.641907 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1636  triosephosphate isomerase  54.66 
 
 		 254 aa  248  5e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0528  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 254 aa  248  8e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0508  Triose-phosphate isomerase  54.22 
 
 		 263 aa  247  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.584203 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1889  triosephosphate isomerase  55.87 
 
 		 252 aa  246  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193197  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0343  Triose-phosphate isomerase  56.73 
 
 		 245 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1947  triosephosphate isomerase  55.1 
 
 		 245 aa  245  6e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0598  Triose-phosphate isomerase  55.1 
 
 		 245 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.441113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1450  Triose-phosphate isomerase  51.91 
 
 		 252 aa  242  5e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1733  triosephosphate isomerase  52.65 
 
 		 248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0214124  normal  0.405156 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4305  Triose-phosphate isomerase  54.39 
 
 		 247 aa  232  4.0000000000000004e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2078  triosephosphate isomerase  53.85 
 
 		 247 aa  231  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1236  Triose-phosphate isomerase  52.59 
 
 		 253 aa  228  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2769  Triose-phosphate isomerase  51.61 
 
 		 262 aa  226  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.216684  hitchhiker  0.00002221 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  47.41 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 249 aa  218  5e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1405  triosephosphate isomerase  55.06 
 
 		 256 aa  218  6e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194664  hitchhiker  0.0000346461 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  45.42 
 
 		 251 aa  216  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 253 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  46.64 
 
 		 253 aa  215  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  45.56 
 
 		 251 aa  216  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  45.16 
 
 		 251 aa  214  7e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  45.16 
 
 		 251 aa  214  7e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  45.16 
 
 		 251 aa  214  7e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  44.62 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  45.16 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  45.24 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  44.76 
 
 		 251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  44.76 
 
 		 251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  45.63 
 
 		 248 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  46.15 
 
 		 255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  44.76 
 
 		 251 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  44.76 
 
 		 251 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  46.15 
 
 		 271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2350  triosephosphate isomerase  53.28 
 
 		 250 aa  211  7.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  47.2 
 
 		 261 aa  210  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  43.78 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 		 250 aa  208  8e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  43.78 
 
 		 248 aa  206  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  43.78 
 
 		 248 aa  206  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  44.62 
 
 		 253 aa  205  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2065  triosephosphate isomerase  47.08 
 
 		 270 aa  205  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  43.6 
 
 		 250 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  42.57 
 
 		 250 aa  204  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  44.98 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  43.92 
 
 		 646 aa  202  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4715  triosephosphate isomerase  43.65 
 
 		 251 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151784  hitchhiker  0.00871946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4581  triosephosphate isomerase  43.65 
 
 		 251 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.299699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0947  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 		 249 aa  202  6e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  45.34 
 
 		 251 aa  201  7e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  45.42 
 
 		 252 aa  201  8e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  47.01 
 
 		 253 aa  201  9e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4716  triosephosphate isomerase  43.48 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  43.7 
 
 		 248 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  48.19 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  47.79 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  42.29 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  45.16 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  42.29 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  42.29 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  42.29 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000672651  hitchhiker  0.0000521404 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  42.29 
 
 		 260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000876569  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  42.29 
 
 		 260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084878  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 		 250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  42.29 
 
 		 260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371764  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  40.32 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  42.29 
 
 		 260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121721  unclonable  0.00000000000528037 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  42.29 
 
 		 260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000257421  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0717  triosephosphate isomerase  41.5 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  44 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  44.35 
 
 		 252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1172  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 248 aa  199  5e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162207  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  43.6 
 
 		 251 aa  198  5e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  44.8 
 
 		 257 aa  198  6e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  48.19 
 
 		 254 aa  198  6e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  42.4 
 
 		 250 aa  198  7e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0604  triosephosphate isomerase  41.5 
 
 		 270 aa  197  9e-50  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.783409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>