More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3104 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3104  Triose-phosphate isomerase  100 
 
 		 253 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5206  Triose-phosphate isomerase  86.11 
 
 		 254 aa  441  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4666  Triose-phosphate isomerase  86.51 
 
 		 254 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5129  Triose-phosphate isomerase  86.51 
 
 		 254 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5571  triosephosphate isomerase  72.47 
 
 		 253 aa  345  5e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5400  Triose-phosphate isomerase  72.47 
 
 		 253 aa  345  6e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.344896 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3166  Triose-phosphate isomerase  61.94 
 
 		 250 aa  293  3e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136531  normal  0.155629 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1835  triosephosphate isomerase  60 
 
 		 250 aa  284  9e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.83515  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2031  triosephosphate isomerase  58.94 
 
 		 256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1067  triosephosphate isomerase  58.94 
 
 		 256 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2051  triosephosphate isomerase  56.05 
 
 		 254 aa  276  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1736  triosephosphate isomerase  56.97 
 
 		 250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1834  triosephosphate isomerase  57.32 
 
 		 256 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.113682  normal  0.0103278 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4380  Triose-phosphate isomerase  56.91 
 
 		 254 aa  268  4e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2471  triosephosphate isomerase  58.4 
 
 		 257 aa  269  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2230  triosephosphate isomerase  57.09 
 
 		 256 aa  268  5.9999999999999995e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4480  triosephosphate isomerase  54.73 
 
 		 251 aa  267  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3233  Triose-phosphate isomerase  57.6 
 
 		 258 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1138  triosephosphate isomerase  54.84 
 
 		 254 aa  265  4e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1097  triosephosphate isomerase  54.84 
 
 		 254 aa  265  4e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2795  triosephosphate isomerase  56.63 
 
 		 261 aa  264  8e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2826  triosephosphate isomerase  56.22 
 
 		 257 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0764  triosephosphate isomerase  57.89 
 
 		 246 aa  258  6e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.641907 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1636  triosephosphate isomerase  57.96 
 
 		 254 aa  256  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1947  triosephosphate isomerase  56.68 
 
 		 245 aa  254  7e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0598  Triose-phosphate isomerase  56.68 
 
 		 245 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.441113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0528  triosephosphate isomerase  52.44 
 
 		 254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0343  Triose-phosphate isomerase  57.49 
 
 		 245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1889  triosephosphate isomerase  55.47 
 
 		 252 aa  249  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193197  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0508  Triose-phosphate isomerase  54.98 
 
 		 263 aa  247  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.584203 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4305  Triose-phosphate isomerase  56.68 
 
 		 247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1733  triosephosphate isomerase  53.85 
 
 		 248 aa  242  3.9999999999999997e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0214124  normal  0.405156 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1450  Triose-phosphate isomerase  51.04 
 
 		 252 aa  239  4e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2078  triosephosphate isomerase  53.85 
 
 		 247 aa  231  9e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1236  Triose-phosphate isomerase  53.17 
 
 		 253 aa  226  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2769  Triose-phosphate isomerase  51.43 
 
 		 262 aa  224  8e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.216684  hitchhiker  0.00002221 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2350  triosephosphate isomerase  55.33 
 
 		 250 aa  221  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  49.59 
 
 		 249 aa  221  7e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1405  triosephosphate isomerase  56.85 
 
 		 256 aa  219  3.9999999999999997e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194664  hitchhiker  0.0000346461 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  48.41 
 
 		 256 aa  218  5e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  47.01 
 
 		 251 aa  218  6e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  47.01 
 
 		 251 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  48.61 
 
 		 261 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  46.15 
 
 		 255 aa  216  2e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 251 aa  216  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 251 aa  216  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  46.56 
 
 		 271 aa  217  2e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 251 aa  216  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  47.64 
 
 		 253 aa  216  4e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 		 251 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 		 251 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  48.8 
 
 		 253 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  45.93 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  45.6 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  47.22 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  44.53 
 
 		 250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  46.59 
 
 		 250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0947  triosephosphate isomerase  47.79 
 
 		 249 aa  211  7.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144972  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0604  triosephosphate isomerase  44.35 
 
 		 270 aa  211  1e-53  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.783409  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  47.13 
 
 		 253 aa  210  1e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  45.42 
 
 		 248 aa  209  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0717  triosephosphate isomerase  43.48 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 250 aa  209  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1172  triosephosphate isomerase  52.82 
 
 		 248 aa  209  4e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162207  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1574  triosephosphate isomerase  46.25 
 
 		 249 aa  209  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0183532  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  46.77 
 
 		 257 aa  209  5e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  43.55 
 
 		 250 aa  208  7e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4715  triosephosphate isomerase  47.2 
 
 		 251 aa  207  9e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151784  hitchhiker  0.00871946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4581  triosephosphate isomerase  47.2 
 
 		 251 aa  207  9e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.299699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  45.1 
 
 		 646 aa  207  9e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2065  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 		 270 aa  207  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  45.61 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  44.13 
 
 		 250 aa  206  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4716  triosephosphate isomerase  46.25 
 
 		 251 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  45.34 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  44.05 
 
 		 253 aa  204  8e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  45.88 
 
 		 251 aa  204  9e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  42.68 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  43.95 
 
 		 248 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  43.95 
 
 		 248 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  45.71 
 
 		 250 aa  204  2e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0103  triosephosphate isomerase  45.42 
 
 		 256 aa  202  5e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  42.52 
 
 		 260 aa  201  8e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 		 250 aa  201  8e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  42.52 
 
 		 260 aa  201  8e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  42.52 
 
 		 260 aa  201  8e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  42.52 
 
 		 260 aa  201  8e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000672651  hitchhiker  0.0000521404 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2831  triosephosphate isomerase  41.57 
 
 		 260 aa  201  8e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000042953  hitchhiker  0.00389109 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  42.52 
 
 		 260 aa  201  9e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000876569  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  42.52 
 
 		 260 aa  201  9e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000257421  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  42.52 
 
 		 260 aa  201  9e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084878  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  42.52 
 
 		 260 aa  201  9e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>