More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1733 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1733  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 248 aa  491  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0214124  normal  0.405156 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0343  Triose-phosphate isomerase  70.73 
 
 		 245 aa  332  4e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1947  triosephosphate isomerase  70.33 
 
 		 245 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0598  Triose-phosphate isomerase  70.33 
 
 		 245 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.441113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0764  triosephosphate isomerase  66.53 
 
 		 246 aa  324  7e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.641907 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4305  Triose-phosphate isomerase  67.89 
 
 		 247 aa  310  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2078  triosephosphate isomerase  68.7 
 
 		 247 aa  302  4.0000000000000003e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3166  Triose-phosphate isomerase  59.76 
 
 		 250 aa  292  4e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136531  normal  0.155629 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3233  Triose-phosphate isomerase  57.43 
 
 		 258 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2471  triosephosphate isomerase  57.38 
 
 		 257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1835  triosephosphate isomerase  56.91 
 
 		 250 aa  266  2e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.83515  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2826  triosephosphate isomerase  57.26 
 
 		 257 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5400  Triose-phosphate isomerase  59.11 
 
 		 253 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.344896 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2795  triosephosphate isomerase  57.26 
 
 		 261 aa  263  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1736  triosephosphate isomerase  56.63 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5571  triosephosphate isomerase  58.3 
 
 		 253 aa  261  8e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1636  triosephosphate isomerase  56.28 
 
 		 254 aa  261  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4480  triosephosphate isomerase  56.49 
 
 		 251 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1067  triosephosphate isomerase  53.47 
 
 		 256 aa  254  8e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0528  triosephosphate isomerase  53.14 
 
 		 254 aa  251  1e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1889  triosephosphate isomerase  58.54 
 
 		 252 aa  249  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193197  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4380  Triose-phosphate isomerase  54.39 
 
 		 254 aa  248  7e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3104  Triose-phosphate isomerase  53.85 
 
 		 253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2051  triosephosphate isomerase  52.72 
 
 		 254 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1138  triosephosphate isomerase  51.05 
 
 		 254 aa  238  6.999999999999999e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1097  triosephosphate isomerase  51.05 
 
 		 254 aa  238  6.999999999999999e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2230  triosephosphate isomerase  51.01 
 
 		 256 aa  236  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2031  triosephosphate isomerase  51.21 
 
 		 256 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5129  Triose-phosphate isomerase  53.06 
 
 		 254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4666  Triose-phosphate isomerase  53.06 
 
 		 254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5206  Triose-phosphate isomerase  52.65 
 
 		 254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0508  Triose-phosphate isomerase  53.31 
 
 		 263 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.584203 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2769  Triose-phosphate isomerase  54.51 
 
 		 262 aa  231  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.216684  hitchhiker  0.00002221 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2350  triosephosphate isomerase  58.3 
 
 		 250 aa  231  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1834  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 256 aa  229  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.113682  normal  0.0103278 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1236  Triose-phosphate isomerase  54.4 
 
 		 253 aa  229  4e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1405  triosephosphate isomerase  54.1 
 
 		 256 aa  226  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194664  hitchhiker  0.0000346461 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1450  Triose-phosphate isomerase  50.21 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  46.37 
 
 		 257 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1172  triosephosphate isomerase  51.63 
 
 		 248 aa  202  5e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162207  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  46.83 
 
 		 256 aa  198  7.999999999999999e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  44.31 
 
 		 255 aa  198  9e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0100  triosephosphate isomerase  43.6 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0154  Triose-phosphate isomerase  45.97 
 
 		 247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2833  triosephosphate isomerase  46.91 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.091999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  47.77 
 
 		 249 aa  195  6e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  42.75 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2019  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 		 256 aa  192  5e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1401  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 251 aa  192  5e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0615206  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  44.4 
 
 		 255 aa  191  6e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  42.51 
 
 		 250 aa  192  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  46.47 
 
 		 251 aa  191  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  46.47 
 
 		 251 aa  191  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  46.47 
 
 		 251 aa  191  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  44.4 
 
 		 271 aa  191  8e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2168  triosephosphate isomerase  46.89 
 
 		 251 aa  191  9e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00524142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2289  triosephosphate isomerase  46.89 
 
 		 251 aa  191  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785898  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  45.04 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  46.37 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1574  triosephosphate isomerase  42.68 
 
 		 249 aa  189  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0183532  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 251 aa  188  8e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1499  Triose-phosphate isomerase  49.19 
 
 		 248 aa  188  8e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0165539 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  40.08 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  43.25 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3448  triosephosphate isomerase  42.35 
 
 		 256 aa  186  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  44.21 
 
 		 250 aa  186  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  46.06 
 
 		 251 aa  186  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  46.37 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  44.76 
 
 		 252 aa  186  3e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1341  triosephosphate isomerase  45.63 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000463974  normal  0.0307092 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  44.35 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 249 aa  186  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  43.2 
 
 		 252 aa  186  4e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  42.91 
 
 		 250 aa  186  4e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  45.56 
 
 		 249 aa  186  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  44.03 
 
 		 251 aa  185  5e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  41.04 
 
 		 250 aa  185  6e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01285  triosephosphate isomerase  44.81 
 
 		 251 aa  185  6e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  41.46 
 
 		 251 aa  185  6e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1740  triosephosphate isomerase  46.64 
 
 		 245 aa  185  7e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62830  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 		 251 aa  184  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  42.91 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5468  triosephosphate isomerase  44.98 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.50496  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  43.39 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1026  triosephosphate isomerase  45 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00133267  normal  0.306303 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  43.8 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  42.8 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3216  triosephosphate isomerase  46.5 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00012954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  44.17 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0870  triosephosphate isomerase  47.54 
 
 		 250 aa  182  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695096  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  38.82 
 
 		 254 aa  182  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  44.22 
 
 		 253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  43.75 
 
 		 248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0717  triosephosphate isomerase  43.15 
 
 		 251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5608  triosephosphate isomerase  40.94 
 
 		 254 aa  181  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  45.93 
 
 		 249 aa  181  7e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3612  triosephosphate isomerase  43.55 
 
 		 251 aa  180  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>