More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1401 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1401  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 251 aa  508  1e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0615206  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1499  Triose-phosphate isomerase  80.49 
 
 		 248 aa  389  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0165539 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  66.8 
 
 		 248 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  65.18 
 
 		 248 aa  315  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2064  triosephosphate isomerase  65.31 
 
 		 248 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0168982  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0870  triosephosphate isomerase  64.78 
 
 		 250 aa  302  4.0000000000000003e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695096  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  62.6 
 
 		 245 aa  299  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0955  triosephosphate isomerase  64.78 
 
 		 250 aa  299  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301152 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1287  triosephosphate isomerase  63.1 
 
 		 266 aa  298  6e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  63.1 
 
 		 251 aa  298  8e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  62.3 
 
 		 251 aa  295  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1491  triosephosphate isomerase  62.6 
 
 		 247 aa  295  6e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020715  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  61.79 
 
 		 245 aa  295  6e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  62.3 
 
 		 251 aa  294  9e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  62.3 
 
 		 251 aa  294  9e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1026  triosephosphate isomerase  63.89 
 
 		 251 aa  292  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00133267  normal  0.306303 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2289  triosephosphate isomerase  62.3 
 
 		 251 aa  292  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785898  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2168  triosephosphate isomerase  62.3 
 
 		 251 aa  292  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00524142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1261  triosephosphate isomerase  63.45 
 
 		 251 aa  289  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168128 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2815  triosephosphate isomerase  62.06 
 
 		 270 aa  288  5.0000000000000004e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1127  triosephosphate isomerase  63.1 
 
 		 266 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1296  triosephosphate isomerase  63.1 
 
 		 266 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0740  triosephosphate isomerase  63.1 
 
 		 266 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3216  triosephosphate isomerase  60.63 
 
 		 258 aa  287  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00012954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0410  triosephosphate isomerase  63.1 
 
 		 266 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1832  triosephosphate isomerase  63.1 
 
 		 251 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3512  triosephosphate isomerase  65.2 
 
 		 261 aa  286  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1432  triosephosphate isomerase  63.1 
 
 		 251 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1341  triosephosphate isomerase  60.47 
 
 		 259 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000463974  normal  0.0307092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5182  triosephosphate isomerase  65.59 
 
 		 248 aa  282  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.735069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0947  triosephosphate isomerase  59.04 
 
 		 249 aa  281  5.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  59.84 
 
 		 253 aa  281  7.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1058  triosephosphate isomerase  61.9 
 
 		 251 aa  279  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00483785  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  57.2 
 
 		 250 aa  275  4e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  58.23 
 
 		 253 aa  275  4e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  58.33 
 
 		 246 aa  272  4.0000000000000004e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1422  triosephosphate isomerase  68.66 
 
 		 242 aa  271  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.192091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1140  triosephosphate isomerase  63.31 
 
 		 248 aa  268  5e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.766646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3258  triosephosphate isomerase  68.72 
 
 		 245 aa  268  8e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1740  triosephosphate isomerase  60.41 
 
 		 245 aa  266  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2011  triosephosphate isomerase  57.03 
 
 		 259 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000187443  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  56.05 
 
 		 250 aa  262  3e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2717  triosephosphate isomerase  55.24 
 
 		 246 aa  259  3e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0490631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  52.57 
 
 		 253 aa  258  9e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  56.1 
 
 		 255 aa  255  5e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  56.1 
 
 		 271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2064  triosephosphate isomerase  53.78 
 
 		 250 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  51.6 
 
 		 256 aa  251  7e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49960  triosephosphate isomerase  57.98 
 
 		 251 aa  249  4e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45770  triosephosphate isomerase  57.98 
 
 		 251 aa  249  4e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01285  triosephosphate isomerase  52.89 
 
 		 251 aa  247  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2833  triosephosphate isomerase  52.89 
 
 		 251 aa  246  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.091999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  56 
 
 		 249 aa  246  3e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  47.77 
 
 		 249 aa  245  6e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  51.21 
 
 		 248 aa  244  6.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4716  triosephosphate isomerase  52.99 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4715  triosephosphate isomerase  52.59 
 
 		 251 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151784  hitchhiker  0.00871946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5468  triosephosphate isomerase  54.58 
 
 		 251 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.50496  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4184  triosephosphate isomerase  53.39 
 
 		 251 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4581  triosephosphate isomerase  52.59 
 
 		 251 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.299699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1053  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 		 252 aa  242  3.9999999999999997e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62830  triosephosphate isomerase  54.58 
 
 		 251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4494  triosephosphate isomerase  52.96 
 
 		 251 aa  242  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.321001  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3612  triosephosphate isomerase  54.55 
 
 		 251 aa  242  5e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0706  triosephosphate isomerase  57.38 
 
 		 255 aa  241  7e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.423457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0717  triosephosphate isomerase  52.59 
 
 		 251 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0267  triosephosphate isomerase  51.01 
 
 		 249 aa  238  5e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0238  triosephosphate isomerase  51.01 
 
 		 249 aa  238  6.999999999999999e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  51.41 
 
 		 250 aa  238  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0674  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 		 250 aa  237  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.260735  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0819  triosephosphate isomerase  48.02 
 
 		 252 aa  237  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1591  triosephosphate isomerase  48.16 
 
 		 255 aa  236  3e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  55.42 
 
 		 253 aa  235  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0775  triosephosphate isomerase  51.79 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354266  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1574  triosephosphate isomerase  48.78 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0183532  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2633  triosephosphate isomerase  51.17 
 
 		 257 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1520  triosephosphate isomerase  52.65 
 
 		 272 aa  232  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128427  decreased coverage  0.0000834169 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  52.42 
 
 		 250 aa  231  9e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  51.61 
 
 		 250 aa  229  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0169  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.543601  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  47.1 
 
 		 260 aa  229  4e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084878  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  47.1 
 
 		 260 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000257421  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  47.1 
 
 		 260 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121721  unclonable  0.00000000000528037 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  47.1 
 
 		 260 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000876569  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  47.1 
 
 		 260 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371764  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  53.23 
 
 		 249 aa  228  5e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0343  Triose-phosphate isomerase  53.47 
 
 		 245 aa  228  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0154  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 255 aa  229  5e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  47.64 
 
 		 254 aa  228  6e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  49.59 
 
 		 255 aa  228  6e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  47.1 
 
 		 260 aa  228  6e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0103  triosephosphate isomerase  48.4 
 
 		 256 aa  228  8e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  47.1 
 
 		 260 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  47.1 
 
 		 260 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0986  triosephosphate isomerase  45.95 
 
 		 260 aa  227  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000192621  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  47.1 
 
 		 260 aa  228  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000672651  hitchhiker  0.0000521404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  49.41 
 
 		 254 aa  226  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  47.79 
 
 		 250 aa  227  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 251 aa  226  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0598  Triose-phosphate isomerase  53.06 
 
 		 245 aa  226  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.441113  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>