More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0528 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0528  triosephosphate isomerase  100 
 
 
254 aa  523  1e-147  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1138  triosephosphate isomerase  63.39 
 
 
254 aa  340  1e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1097  triosephosphate isomerase  63.39 
 
 
254 aa  340  1e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2051  triosephosphate isomerase  62.6 
 
 
254 aa  332  5e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1067  triosephosphate isomerase  56.69 
 
 
256 aa  296  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331655  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3166  Triose-phosphate isomerase  57.09 
 
 
250 aa  293  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136531  normal  0.155629 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2471  triosephosphate isomerase  58.27 
 
 
257 aa  291  9e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885036  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1835  triosephosphate isomerase  57.09 
 
 
250 aa  287  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.83515  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2230  triosephosphate isomerase  55.51 
 
 
256 aa  286  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1636  triosephosphate isomerase  61.54 
 
 
254 aa  286  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3233  Triose-phosphate isomerase  56.57 
 
 
258 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2031  triosephosphate isomerase  57.48 
 
 
256 aa  285  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1834  triosephosphate isomerase  57.09 
 
 
256 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.113682  normal  0.0103278 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2795  triosephosphate isomerase  56.8 
 
 
261 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2826  triosephosphate isomerase  55.6 
 
 
257 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14857  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1736  triosephosphate isomerase  53.44 
 
 
250 aa  280  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5571  triosephosphate isomerase  56.5 
 
 
253 aa  278  7e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4380  Triose-phosphate isomerase  55.47 
 
 
254 aa  277  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0764  triosephosphate isomerase  58.68 
 
 
246 aa  276  3e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.641907 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5400  Triose-phosphate isomerase  56.5 
 
 
253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.344896 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4480  triosephosphate isomerase  53.6 
 
 
251 aa  271  7e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1947  triosephosphate isomerase  56.67 
 
 
245 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0598  Triose-phosphate isomerase  56.25 
 
 
245 aa  269  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.441113  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0343  Triose-phosphate isomerase  57.92 
 
 
245 aa  267  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3104  Triose-phosphate isomerase  52.44 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1733  triosephosphate isomerase  53.14 
 
 
248 aa  251  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0214124  normal  0.405156 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4305  Triose-phosphate isomerase  57.44 
 
 
247 aa  249  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5206  Triose-phosphate isomerase  50 
 
 
254 aa  248  8e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2769  Triose-phosphate isomerase  51.84 
 
 
262 aa  248  8e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.216684  hitchhiker  0.00002221 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4666  Triose-phosphate isomerase  50.41 
 
 
254 aa  246  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5129  Triose-phosphate isomerase  50.41 
 
 
254 aa  246  4e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1450  Triose-phosphate isomerase  51.88 
 
 
252 aa  245  6e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10934  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0508  Triose-phosphate isomerase  50.4 
 
 
263 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.584203 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2078  triosephosphate isomerase  51.44 
 
 
247 aa  229  4e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1889  triosephosphate isomerase  50.61 
 
 
252 aa  227  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193197  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1236  Triose-phosphate isomerase  49.41 
 
 
253 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  45.88 
 
 
250 aa  209  4e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  42.97 
 
 
250 aa  205  5e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  44.53 
 
 
253 aa  205  7e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  43.95 
 
 
249 aa  204  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0154  Triose-phosphate isomerase  44.9 
 
 
247 aa  204  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  44.62 
 
 
256 aa  203  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  44.4 
 
 
253 aa  203  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  44 
 
 
255 aa  203  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  43.27 
 
 
250 aa  203  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  45.87 
 
 
251 aa  203  3e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  44.13 
 
 
255 aa  201  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  44.49 
 
 
252 aa  199  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1405  triosephosphate isomerase  51.01 
 
 
256 aa  199  3e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194664  hitchhiker  0.0000346461 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  44 
 
 
251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3064  triosephosphate isomerase  42.97 
 
 
260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000137173  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  42.8 
 
 
250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1003  triosephosphate isomerase  41.96 
 
 
260 aa  199  5e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0343606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  44.88 
 
 
251 aa  198  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2831  triosephosphate isomerase  42.58 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000042953  hitchhiker  0.00389109 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  42.34 
 
 
248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  41.96 
 
 
260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  41.96 
 
 
260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  41.96 
 
 
260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000672651  hitchhiker  0.0000521404 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  41.57 
 
 
260 aa  196  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084878  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  41.57 
 
 
260 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121721  unclonable  0.00000000000528037 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  41.57 
 
 
260 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000257421  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  41.57 
 
 
260 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371764  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  42.28 
 
 
250 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1172  triosephosphate isomerase  47.52 
 
 
248 aa  196  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162207  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  41.57 
 
 
260 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000876569  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  40.8 
 
 
655 aa  196  4.0000000000000005e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  41.57 
 
 
260 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2350  triosephosphate isomerase  48.97 
 
 
250 aa  195  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0957  triosephosphate isomerase  41.57 
 
 
260 aa  195  6e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0345759  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 
249 aa  194  9e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3565  triosephosphate isomerase  41.8 
 
 
260 aa  194  9e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.147919  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  43.5 
 
 
245 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  41.2 
 
 
254 aa  194  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2064  triosephosphate isomerase  43.5 
 
 
250 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  43.2 
 
 
250 aa  193  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  45.34 
 
 
251 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0986  triosephosphate isomerase  41.18 
 
 
260 aa  193  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000192621  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  42.4 
 
 
251 aa  193  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  45.49 
 
 
249 aa  193  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3393  triosephosphate isomerase  41.18 
 
 
260 aa  192  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000164415  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  42 
 
 
251 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  41.27 
 
 
251 aa  190  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  42.86 
 
 
250 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  43.65 
 
 
251 aa  190  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0674  triosephosphate isomerase  42.11 
 
 
250 aa  189  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.260735  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  40.8 
 
 
250 aa  189  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  42.11 
 
 
252 aa  189  5e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1574  triosephosphate isomerase  42.45 
 
 
249 aa  189  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0183532  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  41.77 
 
 
253 aa  188  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  41.25 
 
 
251 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  40 
 
 
252 aa  187  1e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1410  Triose-phosphate isomerase  42.57 
 
 
251 aa  186  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  42.91 
 
 
251 aa  187  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  43.58 
 
 
243 aa  186  3e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  39.68 
 
 
253 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  40.96 
 
 
257 aa  186  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  42.68 
 
 
245 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  43.98 
 
 
243 aa  186  3e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  42 
 
 
252 aa  186  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>