More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1410 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1410  Triose-phosphate isomerase  100 
 
 		 251 aa  503  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0348  Triose-phosphate isomerase  68.53 
 
 		 251 aa  348  5e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0212974 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1989  triosephosphate isomerase  63.35 
 
 		 250 aa  310  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0880  triosephosphate isomerase  59.52 
 
 		 251 aa  299  4e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1549  triosephosphate isomerase  58.4 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.42091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1176  Triose-phosphate isomerase  57.71 
 
 		 255 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.46526  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 250 aa  228  6e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  47.6 
 
 		 265 aa  225  6e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  48.63 
 
 		 251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  49 
 
 		 254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  49 
 
 		 254 aa  218  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  46.59 
 
 		 252 aa  218  7.999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  49.39 
 
 		 251 aa  217  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  48.4 
 
 		 254 aa  216  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  48 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  48.58 
 
 		 251 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  47.66 
 
 		 257 aa  212  4.9999999999999996e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  51.41 
 
 		 654 aa  210  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  47.2 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  47.39 
 
 		 257 aa  208  7e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  44.18 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  48.8 
 
 		 255 aa  205  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1356  triosephosphate isomerase  43.82 
 
 		 246 aa  205  5e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.688667  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  46.56 
 
 		 251 aa  205  5e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  47.33 
 
 		 255 aa  204  9e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  45.67 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  47.37 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  40.56 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 		 250 aa  202  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  46.77 
 
 		 253 aa  201  7e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0764  triosephosphate isomerase  48 
 
 		 246 aa  201  7e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.641907 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  45.2 
 
 		 253 aa  201  9e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  44.13 
 
 		 252 aa  201  9e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  44.66 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  45.14 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  45.82 
 
 		 249 aa  199  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3166  Triose-phosphate isomerase  44.49 
 
 		 250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136531  normal  0.155629 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10411  triosephosphate isomerase  40.49 
 
 		 241 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  43.03 
 
 		 249 aa  198  7e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  44.03 
 
 		 655 aa  198  7.999999999999999e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  48.58 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  43.43 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  48.58 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09041  triosephosphate isomerase  38.06 
 
 		 241 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.535393  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  43.87 
 
 		 252 aa  196  3e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  44.67 
 
 		 243 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  45.82 
 
 		 248 aa  195  5.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10411  triosephosphate isomerase  39.68 
 
 		 241 aa  195  6e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1835  triosephosphate isomerase  46.34 
 
 		 250 aa  195  7e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.83515  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  43.97 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3290  triosephosphate isomerase  42.91 
 
 		 241 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0971  triosephosphate isomerase  39.68 
 
 		 241 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  45.06 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4480  triosephosphate isomerase  43.32 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  41.04 
 
 		 251 aa  193  3e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  43.85 
 
 		 243 aa  193  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  42.91 
 
 		 251 aa  193  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  42.97 
 
 		 250 aa  192  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 250 aa  192  5e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  45.42 
 
 		 250 aa  192  6e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  42.75 
 
 		 256 aa  191  8e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1380  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 241 aa  191  9e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0604  triosephosphate isomerase  44.18 
 
 		 270 aa  191  1e-47  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.783409  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0598  Triose-phosphate isomerase  43.65 
 
 		 245 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.441113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1736  triosephosphate isomerase  44.13 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1947  triosephosphate isomerase  43.25 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  43.37 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2471  triosephosphate isomerase  44.44 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  42 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1740  triosephosphate isomerase  44.22 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  42.34 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2769  Triose-phosphate isomerase  43.87 
 
 		 262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.216684  hitchhiker  0.00002221 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.22 
 
 		 687 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  41.83 
 
 		 250 aa  189  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  44.22 
 
 		 250 aa  189  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4717  Triose-phosphate isomerase  45.53 
 
 		 255 aa  189  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000120949  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  41.34 
 
 		 254 aa  188  5e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  46.06 
 
 		 261 aa  189  5e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1153  triosephosphate isomerase  41.6 
 
 		 250 aa  188  7e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2802  triosephosphate isomerase  47.41 
 
 		 261 aa  188  8e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000097423  hitchhiker  0.00000994621 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 		 249 aa  188  8e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  44.98 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1067  triosephosphate isomerase  44.09 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  45.93 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4380  Triose-phosphate isomerase  43.85 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0343  Triose-phosphate isomerase  44.27 
 
 		 245 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1236  triosephosphate isomerase  43.65 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000124491  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1078  triosephosphate isomerase  41.6 
 
 		 298 aa  187  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5400  Triose-phosphate isomerase  45.49 
 
 		 253 aa  186  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.344896 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0717  triosephosphate isomerase  43.48 
 
 		 251 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1450  Triose-phosphate isomerase  45.27 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  40.65 
 
 		 250 aa  186  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1264  Triose-phosphate isomerase  42.24 
 
 		 240 aa  187  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0528  triosephosphate isomerase  42.57 
 
 		 254 aa  186  2e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0742  triosephosphate isomerase  43.85 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  40.96 
 
 		 248 aa  186  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01285  triosephosphate isomerase  44.9 
 
 		 251 aa  186  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>