More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4380 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4380  Triose-phosphate isomerase  100 
 
 		 254 aa  509  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1835  triosephosphate isomerase  63.27 
 
 		 250 aa  305  6e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.83515  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1736  triosephosphate isomerase  62.04 
 
 		 250 aa  303  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2471  triosephosphate isomerase  59.3 
 
 		 257 aa  295  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4480  triosephosphate isomerase  61.22 
 
 		 251 aa  293  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2826  triosephosphate isomerase  59.13 
 
 		 257 aa  287  9e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14857  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1138  triosephosphate isomerase  61.98 
 
 		 254 aa  287  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1097  triosephosphate isomerase  61.98 
 
 		 254 aa  287  1e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3233  Triose-phosphate isomerase  58.89 
 
 		 258 aa  285  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2795  triosephosphate isomerase  58.73 
 
 		 261 aa  285  4e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2051  triosephosphate isomerase  60.33 
 
 		 254 aa  284  9e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5400  Triose-phosphate isomerase  62.04 
 
 		 253 aa  284  9e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.344896 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5571  triosephosphate isomerase  61.22 
 
 		 253 aa  284  9e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3166  Triose-phosphate isomerase  59.18 
 
 		 250 aa  283  3.0000000000000004e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136531  normal  0.155629 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0528  triosephosphate isomerase  55.47 
 
 		 254 aa  277  1e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1067  triosephosphate isomerase  56.8 
 
 		 256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1636  triosephosphate isomerase  57.09 
 
 		 254 aa  271  7e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3104  Triose-phosphate isomerase  56.91 
 
 		 253 aa  268  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2031  triosephosphate isomerase  55.73 
 
 		 256 aa  268  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1834  triosephosphate isomerase  55.34 
 
 		 256 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.113682  normal  0.0103278 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5206  Triose-phosphate isomerase  57.32 
 
 		 254 aa  267  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2769  Triose-phosphate isomerase  59.92 
 
 		 262 aa  266  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.216684  hitchhiker  0.00002221 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0598  Triose-phosphate isomerase  55.65 
 
 		 245 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.441113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1947  triosephosphate isomerase  55.65 
 
 		 245 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5129  Triose-phosphate isomerase  57.32 
 
 		 254 aa  265  5e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4666  Triose-phosphate isomerase  57.32 
 
 		 254 aa  265  5e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0343  Triose-phosphate isomerase  56.85 
 
 		 245 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0764  triosephosphate isomerase  57.32 
 
 		 246 aa  263  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.641907 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1889  triosephosphate isomerase  56.13 
 
 		 252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193197  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2230  triosephosphate isomerase  54.66 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1450  Triose-phosphate isomerase  54.77 
 
 		 252 aa  251  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0508  Triose-phosphate isomerase  54.47 
 
 		 263 aa  249  4e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.584203 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2078  triosephosphate isomerase  55.74 
 
 		 247 aa  248  6e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1733  triosephosphate isomerase  54.39 
 
 		 248 aa  248  7e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0214124  normal  0.405156 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1236  Triose-phosphate isomerase  55.78 
 
 		 253 aa  235  5.0000000000000005e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2350  triosephosphate isomerase  59.5 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4305  Triose-phosphate isomerase  53.14 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  54.4 
 
 		 250 aa  227  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1405  triosephosphate isomerase  57.09 
 
 		 256 aa  225  5.0000000000000005e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194664  hitchhiker  0.0000346461 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 255 aa  220  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1172  triosephosphate isomerase  51.82 
 
 		 248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162207  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  51 
 
 		 249 aa  218  6e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  49.2 
 
 		 250 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  50.59 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  46.06 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  51.19 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0154  Triose-phosphate isomerase  47.35 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  48.63 
 
 		 250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  48.02 
 
 		 253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  47.37 
 
 		 250 aa  211  7e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  48.25 
 
 		 256 aa  211  7.999999999999999e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  47.67 
 
 		 251 aa  210  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  49.4 
 
 		 253 aa  210  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1401  triosephosphate isomerase  49.41 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0615206  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  48.16 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  46 
 
 		 256 aa  209  5e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  49.01 
 
 		 250 aa  208  6e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  48.41 
 
 		 249 aa  208  6e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 		 257 aa  208  8e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3352  Triose-phosphate isomerase  46.22 
 
 		 252 aa  207  9e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  47.62 
 
 		 251 aa  207  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 		 253 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  44.49 
 
 		 250 aa  206  4e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  45.02 
 
 		 252 aa  204  7e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  47.79 
 
 		 255 aa  204  8e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  46.12 
 
 		 263 aa  204  9e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  46.67 
 
 		 251 aa  203  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  43.65 
 
 		 655 aa  203  3e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  47.79 
 
 		 245 aa  202  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 		 253 aa  202  4e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  41.9 
 
 		 249 aa  202  5e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 249 aa  201  7e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  47.45 
 
 		 252 aa  201  7e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  44.22 
 
 		 252 aa  201  9e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1078  triosephosphate isomerase  45.53 
 
 		 298 aa  200  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  44 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  44.92 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  47.24 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  48.62 
 
 		 243 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  44.8 
 
 		 250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  45.63 
 
 		 256 aa  198  6e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  46.43 
 
 		 251 aa  198  7e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  43.6 
 
 		 255 aa  198  7.999999999999999e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1499  Triose-phosphate isomerase  49.41 
 
 		 248 aa  198  7.999999999999999e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0165539 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  46.25 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  43.95 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  43.32 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  45.88 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  44.05 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1740  triosephosphate isomerase  51.03 
 
 		 245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2633  triosephosphate isomerase  45.02 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  48.02 
 
 		 246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3504  triosephosphate isomerase  43.43 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.449389  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1639  triosephosphate isomerase  49.23 
 
 		 308 aa  196  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  48.13 
 
 		 243 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>