More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2769 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2769  Triose-phosphate isomerase  100 
 
 		 262 aa  520  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.216684  hitchhiker  0.00002221 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3166  Triose-phosphate isomerase  56.56 
 
 		 250 aa  277  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136531  normal  0.155629 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4380  Triose-phosphate isomerase  59.92 
 
 		 254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1835  triosephosphate isomerase  58.37 
 
 		 250 aa  268  5e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.83515  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3233  Triose-phosphate isomerase  56.22 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4480  triosephosphate isomerase  57.44 
 
 		 251 aa  263  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0528  triosephosphate isomerase  52.24 
 
 		 254 aa  259  3e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0343  Triose-phosphate isomerase  60.25 
 
 		 245 aa  258  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1947  triosephosphate isomerase  59.02 
 
 		 245 aa  257  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1736  triosephosphate isomerase  55.24 
 
 		 250 aa  258  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2471  triosephosphate isomerase  55.82 
 
 		 257 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0598  Triose-phosphate isomerase  58.61 
 
 		 245 aa  255  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.441113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0764  triosephosphate isomerase  58.2 
 
 		 246 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.641907 
 
 
-
 
NC_004310  BR1138  triosephosphate isomerase  56.61 
 
 		 254 aa  250  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1097  triosephosphate isomerase  56.61 
 
 		 254 aa  250  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2826  triosephosphate isomerase  52.02 
 
 		 257 aa  248  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2795  triosephosphate isomerase  50.78 
 
 		 261 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1236  Triose-phosphate isomerase  56.4 
 
 		 253 aa  246  4e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2051  triosephosphate isomerase  55.37 
 
 		 254 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1834  triosephosphate isomerase  54.66 
 
 		 256 aa  242  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.113682  normal  0.0103278 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1067  triosephosphate isomerase  53.44 
 
 		 256 aa  242  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2031  triosephosphate isomerase  53.63 
 
 		 256 aa  241  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1733  triosephosphate isomerase  54.51 
 
 		 248 aa  237  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0214124  normal  0.405156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5400  Triose-phosphate isomerase  55.6 
 
 		 253 aa  237  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.344896 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1889  triosephosphate isomerase  54.8 
 
 		 252 aa  236  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193197  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1172  triosephosphate isomerase  57.09 
 
 		 248 aa  235  4e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162207  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1636  triosephosphate isomerase  55.06 
 
 		 254 aa  235  5.0000000000000005e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4305  Triose-phosphate isomerase  55.69 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4666  Triose-phosphate isomerase  52.42 
 
 		 254 aa  232  6e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5129  Triose-phosphate isomerase  52.42 
 
 		 254 aa  232  6e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5571  triosephosphate isomerase  54.47 
 
 		 253 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5206  Triose-phosphate isomerase  52.02 
 
 		 254 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2230  triosephosphate isomerase  52.24 
 
 		 256 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2019  triosephosphate isomerase  58.17 
 
 		 256 aa  231  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3104  Triose-phosphate isomerase  51.43 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2078  triosephosphate isomerase  55.51 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1450  Triose-phosphate isomerase  51.06 
 
 		 252 aa  224  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  49.39 
 
 		 249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0154  Triose-phosphate isomerase  49.19 
 
 		 247 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 250 aa  216  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 		 250 aa  215  5e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0508  Triose-phosphate isomerase  50.61 
 
 		 263 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.584203 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  47.41 
 
 		 254 aa  212  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1405  triosephosphate isomerase  56.56 
 
 		 256 aa  211  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194664  hitchhiker  0.0000346461 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2350  triosephosphate isomerase  56.73 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  47.56 
 
 		 249 aa  209  5e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1499  Triose-phosphate isomerase  48.41 
 
 		 248 aa  208  9e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0165539 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  46.18 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  47.01 
 
 		 254 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  45.16 
 
 		 249 aa  206  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  48.4 
 
 		 253 aa  205  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  44.94 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3290  triosephosphate isomerase  42.39 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1410  Triose-phosphate isomerase  44.66 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1341  triosephosphate isomerase  47.77 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000463974  normal  0.0307092 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  43.72 
 
 		 252 aa  199  5e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  42.11 
 
 		 251 aa  198  6e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 		 249 aa  198  7.999999999999999e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  45.56 
 
 		 255 aa  198  9e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1078  triosephosphate isomerase  40.93 
 
 		 298 aa  197  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  43.9 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  47.01 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  43.9 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  44.44 
 
 		 252 aa  196  3e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  43.03 
 
 		 263 aa  196  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3216  triosephosphate isomerase  47.37 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00012954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  44.76 
 
 		 253 aa  195  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0674  triosephosphate isomerase  42.8 
 
 		 250 aa  195  6e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.260735  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  43.09 
 
 		 248 aa  195  6e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  45.56 
 
 		 251 aa  195  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  45.56 
 
 		 251 aa  195  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 253 aa  195  7e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  49.39 
 
 		 253 aa  195  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  42.91 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  44.4 
 
 		 253 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  43.9 
 
 		 251 aa  194  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2815  triosephosphate isomerase  47.69 
 
 		 270 aa  193  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3277  triosephosphate isomerase  43.27 
 
 		 251 aa  192  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000689826  hitchhiker  0.00599286 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  45.16 
 
 		 251 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  43.55 
 
 		 251 aa  192  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4716  triosephosphate isomerase  43.78 
 
 		 251 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  39.76 
 
 		 250 aa  192  6e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  40.87 
 
 		 251 aa  191  7e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  45.16 
 
 		 251 aa  192  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4715  triosephosphate isomerase  43.78 
 
 		 251 aa  191  8e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151784  hitchhiker  0.00871946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4581  triosephosphate isomerase  43.78 
 
 		 251 aa  191  8e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.299699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0348  Triose-phosphate isomerase  48.46 
 
 		 251 aa  191  9e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0212974 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2168  triosephosphate isomerase  44.76 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00524142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2289  triosephosphate isomerase  44.76 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785898  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2833  triosephosphate isomerase  47.35 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.091999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0870  triosephosphate isomerase  47.66 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695096  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  44.58 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  42.8 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  42.4 
 
 		 256 aa  189  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  43.6 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1176  Triose-phosphate isomerase  43.58 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.46526  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3352  Triose-phosphate isomerase  43.32 
 
 		 252 aa  189  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5608  triosephosphate isomerase  42.35 
 
 		 254 aa  189  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  39.2 
 
 		 250 aa  189  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>