More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1176 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1176  Triose-phosphate isomerase  100 
 
 		 255 aa  512  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.46526  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1410  Triose-phosphate isomerase  57.71 
 
 		 251 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0348  Triose-phosphate isomerase  59.29 
 
 		 251 aa  276  3e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0212974 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1989  triosephosphate isomerase  56.13 
 
 		 250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0880  triosephosphate isomerase  52.8 
 
 		 251 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1549  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 		 252 aa  237  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.42091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.62 
 
 		 655 aa  214  9.999999999999999e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1356  triosephosphate isomerase  44.92 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.688667  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  43.2 
 
 		 252 aa  207  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  46.51 
 
 		 256 aa  206  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  45.82 
 
 		 254 aa  205  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  47.04 
 
 		 250 aa  204  9e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  45.95 
 
 		 254 aa  202  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  44.84 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  46.46 
 
 		 249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  43.97 
 
 		 251 aa  199  5e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  42.29 
 
 		 251 aa  198  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2003  triosephosphate isomerase  45.1 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0534929  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3104  Triose-phosphate isomerase  44.27 
 
 		 253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  44.66 
 
 		 251 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  43.25 
 
 		 261 aa  195  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  46.76 
 
 		 243 aa  195  6e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0604  triosephosphate isomerase  43.15 
 
 		 270 aa  194  8.000000000000001e-49  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.783409  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1236  triosephosphate isomerase  43.43 
 
 		 250 aa  195  8.000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000124491  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  43.7 
 
 		 249 aa  195  8.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1153  triosephosphate isomerase  42.13 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  43.53 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  46.3 
 
 		 243 aa  193  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  45.34 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1264  Triose-phosphate isomerase  45.68 
 
 		 240 aa  194  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  43.48 
 
 		 263 aa  192  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5206  Triose-phosphate isomerase  43.65 
 
 		 254 aa  192  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  40.71 
 
 		 253 aa  192  4e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  45.1 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  39.68 
 
 		 251 aa  192  5e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  44.05 
 
 		 253 aa  192  6e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  44.22 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  42.63 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0764  triosephosphate isomerase  45.85 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.641907 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  42.63 
 
 		 250 aa  189  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  43.65 
 
 		 250 aa  189  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  44.09 
 
 		 257 aa  188  5.999999999999999e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  43.48 
 
 		 250 aa  188  8e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  42.41 
 
 		 251 aa  188  8e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4380  Triose-phosphate isomerase  44.98 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  40.87 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  45.59 
 
 		 246 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3504  triosephosphate isomerase  41.02 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.449389  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  41.67 
 
 		 249 aa  186  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  43.87 
 
 		 250 aa  185  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5129  Triose-phosphate isomerase  42.86 
 
 		 254 aa  185  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2833  triosephosphate isomerase  44.35 
 
 		 251 aa  185  6e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.091999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4666  Triose-phosphate isomerase  42.86 
 
 		 254 aa  185  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  41.02 
 
 		 253 aa  185  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2769  Triose-phosphate isomerase  43.58 
 
 		 262 aa  185  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.216684  hitchhiker  0.00002221 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0674  triosephosphate isomerase  42.4 
 
 		 250 aa  185  7e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.260735  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  42.86 
 
 		 250 aa  185  7e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4717  Triose-phosphate isomerase  42.29 
 
 		 255 aa  184  9e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000120949  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5197  triosephosphate isomerase  43.65 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  43.43 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  42.52 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  42.86 
 
 		 263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01285  triosephosphate isomerase  44.58 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  41.67 
 
 		 249 aa  183  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  41.27 
 
 		 248 aa  182  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  41.27 
 
 		 248 aa  182  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  43.25 
 
 		 687 aa  183  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  38.74 
 
 		 254 aa  183  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  41.96 
 
 		 253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  42.91 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  43.6 
 
 		 654 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  44.88 
 
 		 253 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  41.9 
 
 		 253 aa  181  7e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49960  triosephosphate isomerase  45.24 
 
 		 251 aa  181  9.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45770  triosephosphate isomerase  45.24 
 
 		 251 aa  181  9.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  41.9 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4716  triosephosphate isomerase  44.76 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  40.54 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0238  triosephosphate isomerase  45.42 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  40.39 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  40.24 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3096  Triose-phosphate isomerase  42.46 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119937  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1830  Triose-phosphate isomerase  42.91 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136952 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2838  triosephosphate isomerase  40.16 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  40.78 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5571  triosephosphate isomerase  44.49 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4715  triosephosphate isomerase  44.35 
 
 		 251 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151784  hitchhiker  0.00871946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4581  triosephosphate isomerase  44.35 
 
 		 251 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.299699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2089  triosephosphate isomerase  42.52 
 
 		 271 aa  179  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19012  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0717  triosephosphate isomerase  43.72 
 
 		 251 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1236  Triose-phosphate isomerase  43.02 
 
 		 253 aa  178  7e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2707  triosephosphate isomerase  38.89 
 
 		 249 aa  178  7e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  41.34 
 
 		 251 aa  178  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0971  triosephosphate isomerase  39.76 
 
 		 241 aa  178  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  39.69 
 
 		 250 aa  178  7e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  40.94 
 
 		 252 aa  178  9e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1889  triosephosphate isomerase  43.78 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193197  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  40.48 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1736  triosephosphate isomerase  41.63 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  40.08 
 
 		 650 aa  177  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>