More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0343 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0343  Triose-phosphate isomerase  100 
 
 
245 aa  488  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1947  triosephosphate isomerase  90.61 
 
 
245 aa  447  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0598  Triose-phosphate isomerase  90.61 
 
 
245 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.441113  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4305  Triose-phosphate isomerase  76.64 
 
 
247 aa  362  4e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1733  triosephosphate isomerase  70.73 
 
 
248 aa  332  4e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0214124  normal  0.405156 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1835  triosephosphate isomerase  67.21 
 
 
250 aa  326  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.83515  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0764  triosephosphate isomerase  68.16 
 
 
246 aa  321  7e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.641907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2471  triosephosphate isomerase  64.8 
 
 
257 aa  318  7e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885036  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3166  Triose-phosphate isomerase  65.32 
 
 
250 aa  315  3e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136531  normal  0.155629 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1736  triosephosphate isomerase  63.16 
 
 
250 aa  310  9e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2795  triosephosphate isomerase  62.25 
 
 
261 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3233  Triose-phosphate isomerase  61.2 
 
 
258 aa  299  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2826  triosephosphate isomerase  60.64 
 
 
257 aa  298  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14857  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5400  Triose-phosphate isomerase  64.78 
 
 
253 aa  295  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.344896 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2078  triosephosphate isomerase  67.21 
 
 
247 aa  294  9e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4480  triosephosphate isomerase  62.5 
 
 
251 aa  293  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1067  triosephosphate isomerase  60.16 
 
 
256 aa  285  5e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331655  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2051  triosephosphate isomerase  60.42 
 
 
254 aa  278  7e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5571  triosephosphate isomerase  62.35 
 
 
253 aa  277  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1097  triosephosphate isomerase  60.83 
 
 
254 aa  275  3e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1138  triosephosphate isomerase  60.83 
 
 
254 aa  275  3e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2230  triosephosphate isomerase  61.69 
 
 
256 aa  276  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2031  triosephosphate isomerase  61.85 
 
 
256 aa  274  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1636  triosephosphate isomerase  59.92 
 
 
254 aa  268  5.9999999999999995e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0528  triosephosphate isomerase  57.92 
 
 
254 aa  267  1e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1834  triosephosphate isomerase  59.44 
 
 
256 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.113682  normal  0.0103278 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4380  Triose-phosphate isomerase  56.85 
 
 
254 aa  263  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1450  Triose-phosphate isomerase  58.12 
 
 
252 aa  259  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10934  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1889  triosephosphate isomerase  61.79 
 
 
252 aa  258  8e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193197  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2769  Triose-phosphate isomerase  60.25 
 
 
262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.216684  hitchhiker  0.00002221 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3104  Triose-phosphate isomerase  57.49 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5206  Triose-phosphate isomerase  56.73 
 
 
254 aa  246  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4666  Triose-phosphate isomerase  56.73 
 
 
254 aa  245  6e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5129  Triose-phosphate isomerase  56.73 
 
 
254 aa  245  6e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0508  Triose-phosphate isomerase  57.38 
 
 
263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.584203 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1236  Triose-phosphate isomerase  57.37 
 
 
253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2350  triosephosphate isomerase  58.7 
 
 
250 aa  238  5.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1405  triosephosphate isomerase  56.79 
 
 
256 aa  230  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194664  hitchhiker  0.0000346461 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0154  Triose-phosphate isomerase  50.61 
 
 
247 aa  219  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1172  triosephosphate isomerase  54.96 
 
 
248 aa  218  7.999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162207  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1401  triosephosphate isomerase  53.47 
 
 
251 aa  216  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0615206  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1499  Triose-phosphate isomerase  52.26 
 
 
248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0165539 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  46.8 
 
 
256 aa  208  5e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2019  triosephosphate isomerase  53.23 
 
 
256 aa  207  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1740  triosephosphate isomerase  50 
 
 
245 aa  205  5e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  46.91 
 
 
251 aa  204  8e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 
249 aa  203  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  46.77 
 
 
252 aa  203  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  47.37 
 
 
250 aa  201  6e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4184  triosephosphate isomerase  47.37 
 
 
251 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 
249 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 
255 aa  201  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1574  triosephosphate isomerase  43.62 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0183532  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4494  triosephosphate isomerase  46.34 
 
 
251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.321001  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62830  triosephosphate isomerase  48.79 
 
 
251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5468  triosephosphate isomerase  48.79 
 
 
251 aa  198  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.50496  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  45.93 
 
 
251 aa  198  5e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 
253 aa  198  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  45.12 
 
 
249 aa  198  7.999999999999999e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  43.9 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  47.5 
 
 
251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2833  triosephosphate isomerase  48.13 
 
 
251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.091999  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  46.44 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  48.77 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  47.74 
 
 
251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  46.8 
 
 
253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  46.86 
 
 
253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  47.5 
 
 
251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2168  triosephosphate isomerase  47.5 
 
 
251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00524142  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2289  triosephosphate isomerase  47.5 
 
 
251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785898  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  47.5 
 
 
251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1287  triosephosphate isomerase  47.92 
 
 
266 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1026  triosephosphate isomerase  47.92 
 
 
251 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00133267  normal  0.306303 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  44.98 
 
 
251 aa  195  5.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  47.76 
 
 
250 aa  194  8.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0870  triosephosphate isomerase  48.15 
 
 
250 aa  194  9e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695096  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  46.31 
 
 
271 aa  194  1e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  46.31 
 
 
255 aa  194  1e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  45.8 
 
 
245 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  47.08 
 
 
251 aa  193  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1639  triosephosphate isomerase  48 
 
 
308 aa  193  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766552  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  45.56 
 
 
250 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  44.86 
 
 
251 aa  192  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  42.63 
 
 
250 aa  192  6e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2011  triosephosphate isomerase  45.87 
 
 
259 aa  191  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000187443  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  45.57 
 
 
248 aa  191  9e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0947  triosephosphate isomerase  44.9 
 
 
249 aa  191  9e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144972  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  45.63 
 
 
251 aa  191  9e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  41.67 
 
 
254 aa  191  9e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0955  triosephosphate isomerase  48.15 
 
 
250 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000301152 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  43.25 
 
 
251 aa  191  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 
253 aa  190  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1432  triosephosphate isomerase  48.33 
 
 
251 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0775  triosephosphate isomerase  45.75 
 
 
251 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354266  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  44.66 
 
 
253 aa  190  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4480  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 
255 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1296  triosephosphate isomerase  48.33 
 
 
266 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2815  triosephosphate isomerase  48.37 
 
 
270 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  45.15 
 
 
248 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.596842 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>