More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5400 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5400  Triose-phosphate isomerase  100 
 
 		 253 aa  493  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.344896 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5571  triosephosphate isomerase  88.54 
 
 		 253 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3104  Triose-phosphate isomerase  72.47 
 
 		 253 aa  345  6e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3166  Triose-phosphate isomerase  68.67 
 
 		 250 aa  335  5e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136531  normal  0.155629 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1736  triosephosphate isomerase  68.83 
 
 		 250 aa  326  3e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5206  Triose-phosphate isomerase  66.67 
 
 		 254 aa  321  6e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2795  triosephosphate isomerase  67.07 
 
 		 261 aa  321  7e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5129  Triose-phosphate isomerase  67.06 
 
 		 254 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4666  Triose-phosphate isomerase  67.06 
 
 		 254 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1835  triosephosphate isomerase  67.61 
 
 		 250 aa  319  3e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.83515  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2826  triosephosphate isomerase  67.07 
 
 		 257 aa  318  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2471  triosephosphate isomerase  67.6 
 
 		 257 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3233  Triose-phosphate isomerase  66.8 
 
 		 258 aa  314  7e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1067  triosephosphate isomerase  63.41 
 
 		 256 aa  311  4.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4480  triosephosphate isomerase  65.16 
 
 		 251 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2051  triosephosphate isomerase  62.2 
 
 		 254 aa  301  9e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0343  Triose-phosphate isomerase  64.78 
 
 		 245 aa  295  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2230  triosephosphate isomerase  62.35 
 
 		 256 aa  293  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1097  triosephosphate isomerase  60.98 
 
 		 254 aa  291  7e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1138  triosephosphate isomerase  60.98 
 
 		 254 aa  291  7e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1947  triosephosphate isomerase  63.31 
 
 		 245 aa  289  4e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1636  triosephosphate isomerase  62.45 
 
 		 254 aa  289  4e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0598  Triose-phosphate isomerase  62.75 
 
 		 245 aa  288  7e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.441113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2031  triosephosphate isomerase  59.35 
 
 		 256 aa  285  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4380  Triose-phosphate isomerase  62.04 
 
 		 254 aa  284  9e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1834  triosephosphate isomerase  58.94 
 
 		 256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.113682  normal  0.0103278 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1889  triosephosphate isomerase  64.11 
 
 		 252 aa  278  9e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193197  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0764  triosephosphate isomerase  61.94 
 
 		 246 aa  277  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.641907 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0528  triosephosphate isomerase  56.5 
 
 		 254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4305  Triose-phosphate isomerase  60.89 
 
 		 247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1733  triosephosphate isomerase  59.11 
 
 		 248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0214124  normal  0.405156 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1236  Triose-phosphate isomerase  59.92 
 
 		 253 aa  256  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2078  triosephosphate isomerase  59.35 
 
 		 247 aa  256  3e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0508  Triose-phosphate isomerase  57.32 
 
 		 263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.584203 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2350  triosephosphate isomerase  63.79 
 
 		 250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1450  Triose-phosphate isomerase  53.85 
 
 		 252 aa  236  3e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2769  Triose-phosphate isomerase  53.57 
 
 		 262 aa  230  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.216684  hitchhiker  0.00002221 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  53.25 
 
 		 249 aa  230  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1405  triosephosphate isomerase  60.16 
 
 		 256 aa  228  5e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194664  hitchhiker  0.0000346461 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1172  triosephosphate isomerase  55.38 
 
 		 248 aa  218  6e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162207  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  52.85 
 
 		 250 aa  218  8.999999999999998e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  50.2 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  50 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  48.18 
 
 		 255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  48.58 
 
 		 250 aa  209  5e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0154  Triose-phosphate isomerase  47.15 
 
 		 247 aa  207  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  57.32 
 
 		 253 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  46 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  45.49 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  46.94 
 
 		 271 aa  205  6e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  46.94 
 
 		 255 aa  205  6e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  49.39 
 
 		 254 aa  205  7e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  49.39 
 
 		 250 aa  204  9e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  47.15 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  47.97 
 
 		 250 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62830  triosephosphate isomerase  51.23 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  45.63 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084878  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  45.63 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000876569  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  45.6 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  45.63 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000257421  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1574  triosephosphate isomerase  43.87 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0183532  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  45.63 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121721  unclonable  0.00000000000528037 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 		 260 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  45.63 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371764  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000672651  hitchhiker  0.0000521404 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  54.4 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 251 aa  202  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 251 aa  202  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5468  triosephosphate isomerase  51.44 
 
 		 251 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.50496  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  45.6 
 
 		 251 aa  202  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 251 aa  202  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  47.37 
 
 		 250 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 251 aa  202  5e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4480  triosephosphate isomerase  48.19 
 
 		 255 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 251 aa  201  7e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 251 aa  201  7e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 251 aa  201  7e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 251 aa  201  7e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0957  triosephosphate isomerase  46.06 
 
 		 260 aa  201  7e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0345759  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4327  triosephosphate isomerase  47.79 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4412  triosephosphate isomerase  47.79 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0292909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  48.37 
 
 		 248 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  49.39 
 
 		 249 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4410  triosephosphate isomerase  47.79 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4297  triosephosphate isomerase  47.79 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  48.99 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0947  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2831  triosephosphate isomerase  44.27 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000042953  hitchhiker  0.00389109 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  56.91 
 
 		 253 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0103  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  45.71 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  56.91 
 
 		 253 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0706  triosephosphate isomerase  50.21 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.423457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1003  triosephosphate isomerase  45.82 
 
 		 260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0343606  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0986  triosephosphate isomerase  44.44 
 
 		 260 aa  198  5e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000192621  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  47.56 
 
 		 248 aa  198  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>