More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1740 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1740  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 245 aa  474  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  58.3 
 
 		 253 aa  271  6e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  62.08 
 
 		 245 aa  271  8.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  59.51 
 
 		 251 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  59.51 
 
 		 251 aa  262  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  59.51 
 
 		 251 aa  262  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  60.41 
 
 		 246 aa  262  4e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  59.92 
 
 		 251 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  58.58 
 
 		 245 aa  260  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1401  triosephosphate isomerase  60.41 
 
 		 251 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0615206  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0947  triosephosphate isomerase  60.98 
 
 		 249 aa  256  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2168  triosephosphate isomerase  59.11 
 
 		 251 aa  255  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00524142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2289  triosephosphate isomerase  59.11 
 
 		 251 aa  255  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785898  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  58.13 
 
 		 249 aa  255  5e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1026  triosephosphate isomerase  57.89 
 
 		 251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00133267  normal  0.306303 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  57.5 
 
 		 248 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  57.26 
 
 		 248 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1287  triosephosphate isomerase  58.54 
 
 		 266 aa  250  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  57.14 
 
 		 253 aa  249  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45770  triosephosphate isomerase  59.4 
 
 		 251 aa  249  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49960  triosephosphate isomerase  59.4 
 
 		 251 aa  249  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  53.04 
 
 		 250 aa  248  5e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1058  triosephosphate isomerase  58.13 
 
 		 251 aa  248  7e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00483785  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2064  triosephosphate isomerase  57.44 
 
 		 248 aa  247  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0168982  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1296  triosephosphate isomerase  58.94 
 
 		 266 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0410  triosephosphate isomerase  58.94 
 
 		 266 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0740  triosephosphate isomerase  58.94 
 
 		 266 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1127  triosephosphate isomerase  58.94 
 
 		 266 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1832  triosephosphate isomerase  58.94 
 
 		 251 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1499  Triose-phosphate isomerase  58.02 
 
 		 248 aa  243  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0165539 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1432  triosephosphate isomerase  58.94 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1341  triosephosphate isomerase  54.66 
 
 		 259 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000463974  normal  0.0307092 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1140  triosephosphate isomerase  58.61 
 
 		 248 aa  235  6e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.766646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0870  triosephosphate isomerase  56.97 
 
 		 250 aa  234  7e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695096  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3216  triosephosphate isomerase  54 
 
 		 258 aa  234  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00012954  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0674  triosephosphate isomerase  51.45 
 
 		 250 aa  234  9e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.260735  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2011  triosephosphate isomerase  54.73 
 
 		 259 aa  234  9e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000187443  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1491  triosephosphate isomerase  55.42 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020715  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2064  triosephosphate isomerase  52.85 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2815  triosephosphate isomerase  56.68 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  47.95 
 
 		 249 aa  232  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  57.14 
 
 		 250 aa  232  4.0000000000000004e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 		 256 aa  230  1e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0955  triosephosphate isomerase  56.56 
 
 		 250 aa  230  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301152 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1520  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 		 272 aa  228  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128427  decreased coverage  0.0000834169 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  51.22 
 
 		 253 aa  224  8e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3448  triosephosphate isomerase  47.45 
 
 		 256 aa  224  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3512  triosephosphate isomerase  56.8 
 
 		 261 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2717  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 246 aa  223  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0490631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1053  triosephosphate isomerase  50.61 
 
 		 252 aa  222  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2833  triosephosphate isomerase  52.3 
 
 		 251 aa  222  4e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.091999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5182  triosephosphate isomerase  56.33 
 
 		 248 aa  222  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.735069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1003  triosephosphate isomerase  48.21 
 
 		 260 aa  221  9e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0343606  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084878  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371764  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000257421  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000876569  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121721  unclonable  0.00000000000528037 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 		 260 aa  219  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1261  triosephosphate isomerase  56.45 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168128 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 		 260 aa  219  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 		 260 aa  219  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0717  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 		 260 aa  219  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000672651  hitchhiker  0.0000521404 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0957  triosephosphate isomerase  48.21 
 
 		 260 aa  219  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0345759  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1574  triosephosphate isomerase  48.13 
 
 		 249 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0183532  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62830  triosephosphate isomerase  53.06 
 
 		 251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  48.15 
 
 		 250 aa  218  6e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4494  triosephosphate isomerase  52.03 
 
 		 251 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.321001  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0986  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 260 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000192621  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  54.1 
 
 		 253 aa  218  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0819  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 252 aa  218  8.999999999999998e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3064  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 260 aa  217  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000137173  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4184  triosephosphate isomerase  52.85 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5468  triosephosphate isomerase  52.65 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.50496  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  49.79 
 
 		 255 aa  217  1e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  49.79 
 
 		 271 aa  217  1e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3565  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 260 aa  217  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.147919  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  54.07 
 
 		 249 aa  215  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3393  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 260 aa  216  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000164415  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2831  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 		 260 aa  216  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000042953  hitchhiker  0.00389109 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3352  Triose-phosphate isomerase  47.79 
 
 		 252 aa  215  5e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 255 aa  214  7e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0775  triosephosphate isomerase  49.39 
 
 		 251 aa  214  8e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354266  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1422  triosephosphate isomerase  57.26 
 
 		 242 aa  214  9e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.192091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  52.67 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  50.62 
 
 		 249 aa  212  3.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  55.33 
 
 		 253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  55.33 
 
 		 253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4716  triosephosphate isomerase  49.39 
 
 		 251 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  50.61 
 
 		 257 aa  211  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0706  triosephosphate isomerase  53.19 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.423457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1236  Triose-phosphate isomerase  51.39 
 
 		 253 aa  210  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4715  triosephosphate isomerase  49.39 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151784  hitchhiker  0.00871946 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  48.16 
 
 		 248 aa  209  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4581  triosephosphate isomerase  49.39 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.299699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1947  triosephosphate isomerase  52.05 
 
 		 245 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0598  Triose-phosphate isomerase  52.52 
 
 		 245 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.441113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2350  triosephosphate isomerase  57.68 
 
 		 250 aa  208  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  49.6 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>