More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2011 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2011  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 259 aa  520  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000187443  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1341  triosephosphate isomerase  79.84 
 
 		 259 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000463974  normal  0.0307092 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3216  triosephosphate isomerase  79.38 
 
 		 258 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00012954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  72.62 
 
 		 251 aa  368  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2168  triosephosphate isomerase  72.22 
 
 		 251 aa  364  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00524142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  72.22 
 
 		 251 aa  364  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2289  triosephosphate isomerase  72.22 
 
 		 251 aa  364  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785898  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  72.22 
 
 		 251 aa  364  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  72.22 
 
 		 251 aa  363  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1026  triosephosphate isomerase  73.02 
 
 		 251 aa  362  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00133267  normal  0.306303 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1287  triosephosphate isomerase  71.83 
 
 		 266 aa  361  8e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1058  triosephosphate isomerase  73.41 
 
 		 251 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00483785  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1296  triosephosphate isomerase  72.62 
 
 		 266 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1127  triosephosphate isomerase  72.62 
 
 		 266 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0740  triosephosphate isomerase  72.62 
 
 		 266 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0410  triosephosphate isomerase  72.62 
 
 		 266 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1832  triosephosphate isomerase  72.62 
 
 		 251 aa  349  2e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1432  triosephosphate isomerase  72.22 
 
 		 251 aa  347  8e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  62.86 
 
 		 248 aa  301  7.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  61.29 
 
 		 245 aa  296  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  61.63 
 
 		 248 aa  295  7e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  60.08 
 
 		 245 aa  293  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2064  triosephosphate isomerase  60.41 
 
 		 248 aa  285  4e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0168982  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  53.41 
 
 		 253 aa  262  4e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  52.8 
 
 		 253 aa  259  2e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1401  triosephosphate isomerase  57.14 
 
 		 251 aa  256  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0615206  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1499  Triose-phosphate isomerase  58.13 
 
 		 248 aa  256  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0165539 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2815  triosephosphate isomerase  55.38 
 
 		 270 aa  250  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0947  triosephosphate isomerase  53.82 
 
 		 249 aa  248  8e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144972  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0674  triosephosphate isomerase  51.21 
 
 		 250 aa  246  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.260735  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0870  triosephosphate isomerase  55.02 
 
 		 250 aa  244  9e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695096  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2064  triosephosphate isomerase  51.81 
 
 		 250 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1053  triosephosphate isomerase  51.19 
 
 		 252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0819  triosephosphate isomerase  50.79 
 
 		 252 aa  242  5e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 250 aa  241  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  52.96 
 
 		 246 aa  240  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  52.14 
 
 		 253 aa  238  5e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0955  triosephosphate isomerase  54.22 
 
 		 250 aa  238  5.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301152 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3512  triosephosphate isomerase  55.2 
 
 		 261 aa  238  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1491  triosephosphate isomerase  51.61 
 
 		 247 aa  238  9e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020715  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1740  triosephosphate isomerase  54.88 
 
 		 245 aa  236  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  55.73 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1261  triosephosphate isomerase  55.02 
 
 		 251 aa  236  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168128 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1140  triosephosphate isomerase  52.61 
 
 		 248 aa  235  6e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.766646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  48.59 
 
 		 256 aa  231  9e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01285  triosephosphate isomerase  50.41 
 
 		 251 aa  231  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2833  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 		 251 aa  227  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.091999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0717  triosephosphate isomerase  50.8 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5182  triosephosphate isomerase  54.4 
 
 		 248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.735069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4716  triosephosphate isomerase  51.6 
 
 		 251 aa  225  7e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5608  triosephosphate isomerase  48.02 
 
 		 254 aa  224  8e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  51.6 
 
 		 249 aa  224  9e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4715  triosephosphate isomerase  51.6 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151784  hitchhiker  0.00871946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4581  triosephosphate isomerase  51.6 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.299699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  46.59 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  49.6 
 
 		 256 aa  223  4e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1520  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 272 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128427  decreased coverage  0.0000834169 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0267  triosephosphate isomerase  50.79 
 
 		 249 aa  222  4.9999999999999996e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  44.02 
 
 		 260 aa  221  6e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121721  unclonable  0.00000000000528037 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  44.02 
 
 		 260 aa  221  6e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084878  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  44.02 
 
 		 260 aa  221  6e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000257421  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1003  triosephosphate isomerase  44.02 
 
 		 260 aa  222  6e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0343606  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  44.02 
 
 		 260 aa  221  6e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000876569  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  44.02 
 
 		 260 aa  221  6e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371764  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0957  triosephosphate isomerase  45.17 
 
 		 260 aa  221  6e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0345759  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  44.02 
 
 		 260 aa  221  8e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1591  triosephosphate isomerase  47.77 
 
 		 255 aa  221  8e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  44.02 
 
 		 260 aa  221  8e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  44.02 
 
 		 260 aa  221  8e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  44.02 
 
 		 260 aa  221  8e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000672651  hitchhiker  0.0000521404 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0986  triosephosphate isomerase  43.24 
 
 		 260 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000192621  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0238  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 		 249 aa  219  3e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01687  triosephosphate isomerase  47.28 
 
 		 232 aa  219  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000150844  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  48.99 
 
 		 249 aa  219  5e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3393  triosephosphate isomerase  44.23 
 
 		 260 aa  218  6e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000164415  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3064  triosephosphate isomerase  43.63 
 
 		 260 aa  218  7e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000137173  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0706  triosephosphate isomerase  53.16 
 
 		 255 aa  217  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.423457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0775  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 251 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354266  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  48 
 
 		 250 aa  217  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2717  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0490631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1574  triosephosphate isomerase  49 
 
 		 249 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0183532  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  46.96 
 
 		 255 aa  217  2e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  46.96 
 
 		 271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3565  triosephosphate isomerase  43.24 
 
 		 260 aa  215  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.147919  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3352  Triose-phosphate isomerase  46.53 
 
 		 252 aa  216  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49960  triosephosphate isomerase  51.46 
 
 		 251 aa  215  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45770  triosephosphate isomerase  51.46 
 
 		 251 aa  215  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2831  triosephosphate isomerase  43.24 
 
 		 260 aa  214  9e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000042953  hitchhiker  0.00389109 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  48.8 
 
 		 253 aa  214  9e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3808  triosephosphate isomerase  48.78 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.102844  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  46.96 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5468  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.50496  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62830  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  47.01 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  48.37 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0169  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 255 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.543601  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 		 253 aa  211  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>