More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2060 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 250 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  72.98 
 
 		 248 aa  375  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  49.39 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  52.46 
 
 		 248 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2981  triosephosphate isomerase  51.41 
 
 		 260 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.322057  normal  0.030919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  51.21 
 
 		 254 aa  248  7e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  52.05 
 
 		 248 aa  248  8e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  53.31 
 
 		 255 aa  247  2e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  51.61 
 
 		 250 aa  247  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  51.43 
 
 		 245 aa  245  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2064  triosephosphate isomerase  52.87 
 
 		 248 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0168982  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  51 
 
 		 260 aa  243  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  50.61 
 
 		 245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 		 254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2065  triosephosphate isomerase  51.59 
 
 		 270 aa  242  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20010  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 264 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.627972 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  49 
 
 		 261 aa  242  5e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  50.79 
 
 		 261 aa  241  9e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 		 258 aa  241  9e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  48.58 
 
 		 250 aa  240  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3096  Triose-phosphate isomerase  49.8 
 
 		 263 aa  238  5e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119937  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  49.39 
 
 		 250 aa  238  6.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2015  triosephosphate isomerase  49.01 
 
 		 261 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.944897  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 265 aa  238  8e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  47.2 
 
 		 251 aa  238  9e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 249 aa  237  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  46.34 
 
 		 248 aa  236  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15220  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 258 aa  234  8e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.005965  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 		 251 aa  234  8e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.4 
 
 		 687 aa  234  8e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2538  triosephosphate isomerase  48.19 
 
 		 260 aa  234  9e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00272657  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  45.53 
 
 		 250 aa  232  5e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 251 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2802  triosephosphate isomerase  48.19 
 
 		 261 aa  231  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000097423  hitchhiker  0.00000994621 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 251 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  47.22 
 
 		 252 aa  230  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6036  triose-phosphate isomerase  49 
 
 		 261 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1135  triosephosphate isomerase  52.57 
 
 		 244 aa  229  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.665659  hitchhiker  0.00574911 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  48.19 
 
 		 263 aa  229  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1401  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 		 251 aa  229  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0615206  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1639  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 308 aa  229  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1258  triosephosphate isomerase  46.43 
 
 		 260 aa  228  5e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 251 aa  228  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 251 aa  228  9e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 253 aa  227  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5606  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 		 263 aa  227  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245433  normal  0.85925 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1026  triosephosphate isomerase  49 
 
 		 251 aa  227  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00133267  normal  0.306303 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  45.82 
 
 		 250 aa  227  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  50 
 
 		 253 aa  226  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2168  triosephosphate isomerase  49 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00524142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2289  triosephosphate isomerase  49 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785898  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1941  triosephosphate isomerase  48.61 
 
 		 264 aa  226  3e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.36983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2003  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 		 256 aa  225  7e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0534929  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  44.72 
 
 		 253 aa  225  7e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  44.49 
 
 		 650 aa  224  8e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1287  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 266 aa  224  9e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1499  Triose-phosphate isomerase  49.6 
 
 		 248 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0165539 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2064  triosephosphate isomerase  48 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  46.72 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0674  triosephosphate isomerase  45.97 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.260735  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  48.54 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  44.35 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 271 aa  223  2e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3708  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 		 261 aa  223  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2169  triosephosphate isomerase  46.43 
 
 		 265 aa  223  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.154658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 256 aa  223  3e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 249 aa  223  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  46.61 
 
 		 257 aa  223  3e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  47.2 
 
 		 250 aa  222  4e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  44.22 
 
 		 253 aa  222  4e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3216  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 		 258 aa  222  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00012954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2048  triosephosphate isomerase  46.49 
 
 		 287 aa  221  9e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  45.7 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2831  triosephosphate isomerase  46.48 
 
 		 260 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000042953  hitchhiker  0.00389109 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1003  triosephosphate isomerase  45.7 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0343606  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  45.7 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  45.7 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  45.7 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000672651  hitchhiker  0.0000521404 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3352  Triose-phosphate isomerase  47.39 
 
 		 252 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5608  triosephosphate isomerase  45.67 
 
 		 254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  45.7 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000876569  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  45.7 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084878  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  45.7 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121721  unclonable  0.00000000000528037 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1058  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 		 251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00483785  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 		 246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  45.7 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000257421  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  45.7 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371764  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  45.38 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1341  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 		 259 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000463974  normal  0.0307092 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0957  triosephosphate isomerase  46.48 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0345759  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2365  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 		 262 aa  219  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 		 253 aa  219  3e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5197  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 		 261 aa  219  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3565  triosephosphate isomerase  45.7 
 
 		 260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.147919  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0947  triosephosphate isomerase  46.8 
 
 		 249 aa  218  5e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  44.44 
 
 		 251 aa  218  5e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3504  triosephosphate isomerase  42.17 
 
 		 250 aa  218  6e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.449389  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2532  triosephosphate isomerase  47.98 
 
 		 264 aa  218  7.999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1140  triosephosphate isomerase  51.41 
 
 		 248 aa  218  8.999999999999998e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.766646  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>