More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1135 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1135  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 244 aa  484  1e-136  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.665659  hitchhiker  0.00574911 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  55.92 
 
 		 248 aa  264  1e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  52.57 
 
 		 250 aa  246  3e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  47.72 
 
 		 248 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  51.2 
 
 		 265 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  51.84 
 
 		 261 aa  219  3e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  51.67 
 
 		 255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1941  triosephosphate isomerase  53.5 
 
 		 264 aa  218  7.999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.36983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2981  triosephosphate isomerase  48.58 
 
 		 260 aa  217  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.322057  normal  0.030919 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20010  triosephosphate isomerase  50.83 
 
 		 264 aa  216  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.627972 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2169  triosephosphate isomerase  49 
 
 		 265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.154658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 260 aa  215  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1835  triosephosphate isomerase  50.61 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.83515  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  49.79 
 
 		 263 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2802  triosephosphate isomerase  51.25 
 
 		 261 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000097423  hitchhiker  0.00000994621 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  48.81 
 
 		 258 aa  211  7.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  50.62 
 
 		 687 aa  211  7.999999999999999e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3096  Triose-phosphate isomerase  49.79 
 
 		 263 aa  210  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119937  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6036  triose-phosphate isomerase  49.19 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2538  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 260 aa  210  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00272657  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  47.56 
 
 		 249 aa  209  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 255 aa  209  4e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5606  triosephosphate isomerase  51.64 
 
 		 263 aa  208  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245433  normal  0.85925 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15220  triosephosphate isomerase  48.35 
 
 		 258 aa  208  6e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.005965  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  49.79 
 
 		 261 aa  208  6e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  43.95 
 
 		 253 aa  208  7e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2015  triosephosphate isomerase  47.58 
 
 		 261 aa  207  8e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.944897  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2532  triosephosphate isomerase  49.59 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2365  triosephosphate isomerase  46.59 
 
 		 262 aa  206  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3708  triosephosphate isomerase  48.55 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2929  Triose-phosphate isomerase  50.2 
 
 		 261 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.962827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3166  Triose-phosphate isomerase  49.79 
 
 		 250 aa  202  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136531  normal  0.155629 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  47.28 
 
 		 251 aa  202  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 250 aa  201  7e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1830  Triose-phosphate isomerase  45.75 
 
 		 271 aa  201  8e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136952 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2065  triosephosphate isomerase  47.56 
 
 		 270 aa  199  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  48.58 
 
 		 250 aa  199  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  47.58 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  44.07 
 
 		 650 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13130  triosephosphate isomerase  47.79 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.751982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  45.6 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  42.74 
 
 		 253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  41.77 
 
 		 252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2089  triosephosphate isomerase  45.93 
 
 		 271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  42.74 
 
 		 253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  48.75 
 
 		 257 aa  198  5e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  43.37 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  44.49 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  44.88 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  47.35 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1258  triosephosphate isomerase  49.18 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  46.77 
 
 		 255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1736  triosephosphate isomerase  46.94 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2003  triosephosphate isomerase  47.24 
 
 		 256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0534929  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  41.87 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  45.12 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2705  triosephosphate isomerase  48.55 
 
 		 261 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  46.77 
 
 		 271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  41.46 
 
 		 254 aa  195  6e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2795  triosephosphate isomerase  48.39 
 
 		 261 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0764  triosephosphate isomerase  49.37 
 
 		 246 aa  194  7e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.641907 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  44.49 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  44.94 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  42.63 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0742  triosephosphate isomerase  47.58 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0598  Triose-phosphate isomerase  47.33 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.441113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5197  triosephosphate isomerase  46.67 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11466  triosephosphate isomerase  48.76 
 
 		 261 aa  194  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000235283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4380  Triose-phosphate isomerase  50.4 
 
 		 254 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1138  triosephosphate isomerase  47.98 
 
 		 254 aa  193  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  44.4 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2826  triosephosphate isomerase  47.98 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1097  triosephosphate isomerase  47.98 
 
 		 254 aa  193  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  41.87 
 
 		 275 aa  193  3e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1947  triosephosphate isomerase  47.33 
 
 		 245 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4717  Triose-phosphate isomerase  48.51 
 
 		 255 aa  192  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000120949  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  43.37 
 
 		 253 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 251 aa  192  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  46.41 
 
 		 254 aa  192  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4008  triosephosphate isomerase  45.19 
 
 		 241 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0608629 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  43.82 
 
 		 251 aa  191  6e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4480  triosephosphate isomerase  48.37 
 
 		 251 aa  191  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  41.13 
 
 		 256 aa  191  7e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  46.8 
 
 		 249 aa  191  8e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3233  Triose-phosphate isomerase  46.4 
 
 		 258 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  43.25 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  44.4 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1003  triosephosphate isomerase  42.91 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0343606  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  47.43 
 
 		 245 aa  190  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  41.3 
 
 		 655 aa  191  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0528  triosephosphate isomerase  42.74 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2831  triosephosphate isomerase  41.83 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000042953  hitchhiker  0.00389109 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  43.39 
 
 		 251 aa  189  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  43.15 
 
 		 250 aa  189  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5206  Triose-phosphate isomerase  46.59 
 
 		 254 aa  189  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  41.43 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  42.91 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  43.67 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>