More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1830 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1830  Triose-phosphate isomerase  100 
 
 
271 aa  557  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136952 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2089  triosephosphate isomerase  88.93 
 
 
271 aa  503  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19012  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  66.54 
 
 
261 aa  362  4e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  63.53 
 
 
260 aa  342  2.9999999999999997e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20010  triosephosphate isomerase  62.5 
 
 
264 aa  339  2.9999999999999998e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.627972 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11370  triosephosphate isomerase  66.67 
 
 
263 aa  336  1.9999999999999998e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.413237  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6036  triose-phosphate isomerase  61.81 
 
 
261 aa  336  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1941  triosephosphate isomerase  61.39 
 
 
264 aa  335  5e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.36983  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  60.23 
 
 
687 aa  328  4e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2538  triosephosphate isomerase  59.29 
 
 
260 aa  327  1.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00272657  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2169  triosephosphate isomerase  59.92 
 
 
265 aa  325  4.0000000000000003e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.154658  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  59.84 
 
 
258 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2015  triosephosphate isomerase  60.08 
 
 
261 aa  318  3.9999999999999996e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.944897  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2532  triosephosphate isomerase  59.14 
 
 
264 aa  318  5e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5606  triosephosphate isomerase  60.38 
 
 
263 aa  318  9e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245433  normal  0.85925 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  59.45 
 
 
265 aa  317  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2802  triosephosphate isomerase  60.87 
 
 
261 aa  316  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000097423  hitchhiker  0.00000994621 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3708  triosephosphate isomerase  60.16 
 
 
261 aa  317  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13130  triosephosphate isomerase  58.53 
 
 
263 aa  315  7e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.751982  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3096  Triose-phosphate isomerase  58.75 
 
 
263 aa  314  9.999999999999999e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119937  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2065  triosephosphate isomerase  60.08 
 
 
270 aa  314  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2929  Triose-phosphate isomerase  60.23 
 
 
261 aa  313  9.999999999999999e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.962827  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  59.14 
 
 
263 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2446  triosephosphate isomerase  60.56 
 
 
261 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1258  triosephosphate isomerase  59.61 
 
 
260 aa  313  1.9999999999999998e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352341  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2406  triosephosphate isomerase  60.56 
 
 
261 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2452  triosephosphate isomerase  60.56 
 
 
261 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.487817 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  57.77 
 
 
261 aa  312  2.9999999999999996e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2365  triosephosphate isomerase  57.54 
 
 
262 aa  308  8e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2048  triosephosphate isomerase  55.72 
 
 
287 aa  308  9e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5197  triosephosphate isomerase  57.37 
 
 
261 aa  307  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11466  triosephosphate isomerase  59.68 
 
 
261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000235283  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2705  triosephosphate isomerase  58.57 
 
 
261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2981  triosephosphate isomerase  55.81 
 
 
260 aa  298  5e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.322057  normal  0.030919 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1639  triosephosphate isomerase  60.08 
 
 
308 aa  297  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766552  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15220  triosephosphate isomerase  56.47 
 
 
258 aa  292  5e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.005965  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0433  triosephosphate isomerase  50.19 
 
 
267 aa  271  7e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.292554  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0907  triose-phosphate isomerase  49.21 
 
 
265 aa  257  1e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  43.31 
 
 
248 aa  224  8e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  45.67 
 
 
248 aa  224  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  45.67 
 
 
248 aa  224  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  42.52 
 
 
256 aa  224  1e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  44.27 
 
 
255 aa  224  2e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  44.44 
 
 
248 aa  222  6e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  47.33 
 
 
249 aa  221  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  48.03 
 
 
254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  44.35 
 
 
255 aa  218  6e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  43.7 
 
 
254 aa  218  8.999999999999998e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  47.62 
 
 
250 aa  214  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  43.25 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  44.53 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  45.1 
 
 
250 aa  212  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  46.09 
 
 
254 aa  211  9e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  44.27 
 
 
251 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  44.4 
 
 
249 aa  211  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  40.62 
 
 
251 aa  211  1e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  43.48 
 
 
257 aa  210  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  41.67 
 
 
257 aa  210  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  48.06 
 
 
253 aa  209  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  43.14 
 
 
250 aa  209  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  41.63 
 
 
253 aa  209  5e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  44.88 
 
 
253 aa  209  6e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  42.58 
 
 
655 aa  208  7e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  44.26 
 
 
250 aa  208  9e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  41.8 
 
 
251 aa  208  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  42.97 
 
 
252 aa  207  2e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  43.7 
 
 
251 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  42.29 
 
 
254 aa  207  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  42.97 
 
 
250 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  41.5 
 
 
646 aa  206  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  43.08 
 
 
250 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  42.13 
 
 
256 aa  206  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  44.02 
 
 
254 aa  206  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  43.31 
 
 
251 aa  206  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  42.91 
 
 
250 aa  206  4e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  40.32 
 
 
251 aa  205  5e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  42.13 
 
 
252 aa  205  6e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0851  triosephosphate isomerase  44.44 
 
 
275 aa  205  8e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  44.11 
 
 
265 aa  205  8e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  41.73 
 
 
250 aa  204  1e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  42.25 
 
 
253 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  42.52 
 
 
253 aa  204  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  42.52 
 
 
253 aa  204  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13483  triosephosphate isomerase  41.5 
 
 
250 aa  203  2e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.943567  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  42.29 
 
 
251 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  42.25 
 
 
252 aa  202  3e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  41.8 
 
 
252 aa  202  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  43.41 
 
 
255 aa  202  4e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  43.41 
 
 
271 aa  202  5e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  43.68 
 
 
251 aa  202  5e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  44.21 
 
 
243 aa  201  8e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  38.74 
 
 
249 aa  201  9e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  43.48 
 
 
250 aa  201  9e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  42.34 
 
 
251 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  42.34 
 
 
251 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  42.34 
 
 
251 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  41.34 
 
 
251 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  42.34 
 
 
251 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  42.34 
 
 
251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  43.78 
 
 
243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>