More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2365 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2365  triosephosphate isomerase  100 
 
 
262 aa  529  1e-149  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2538  triosephosphate isomerase  81.01 
 
 
260 aa  436  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00272657  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3708  triosephosphate isomerase  80.69 
 
 
261 aa  432  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2705  triosephosphate isomerase  80.31 
 
 
261 aa  421  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2446  triosephosphate isomerase  77.61 
 
 
261 aa  410  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2406  triosephosphate isomerase  77.61 
 
 
261 aa  410  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2452  triosephosphate isomerase  77.61 
 
 
261 aa  410  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.487817 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11466  triosephosphate isomerase  78.38 
 
 
261 aa  408  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000235283  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  69.5 
 
 
261 aa  378  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5197  triosephosphate isomerase  71.43 
 
 
261 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  67.86 
 
 
260 aa  356  1.9999999999999998e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6036  triose-phosphate isomerase  64.66 
 
 
261 aa  339  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2802  triosephosphate isomerase  63.57 
 
 
261 aa  338  7e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000097423  hitchhiker  0.00000994621 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  65.86 
 
 
263 aa  335  5e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2981  triosephosphate isomerase  64.29 
 
 
260 aa  333  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.322057  normal  0.030919 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  62.3 
 
 
258 aa  328  5.0000000000000004e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3096  Triose-phosphate isomerase  63.86 
 
 
263 aa  328  7e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119937  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  63.05 
 
 
265 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2532  triosephosphate isomerase  62.9 
 
 
264 aa  325  4.0000000000000003e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2065  triosephosphate isomerase  62.2 
 
 
270 aa  324  8.000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2015  triosephosphate isomerase  60.47 
 
 
261 aa  322  3e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.944897  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5606  triosephosphate isomerase  61.22 
 
 
263 aa  323  3e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245433  normal  0.85925 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  62.2 
 
 
261 aa  322  5e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2048  triosephosphate isomerase  59.56 
 
 
287 aa  321  6e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  61.45 
 
 
687 aa  320  9.999999999999999e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1941  triosephosphate isomerase  62.7 
 
 
264 aa  319  3.9999999999999996e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.36983  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20010  triosephosphate isomerase  61.72 
 
 
264 aa  317  9e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.627972 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2089  triosephosphate isomerase  58.73 
 
 
271 aa  313  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19012  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1830  Triose-phosphate isomerase  57.54 
 
 
271 aa  308  6.999999999999999e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136952 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13130  triosephosphate isomerase  59.45 
 
 
263 aa  305  5.0000000000000004e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.751982  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1639  triosephosphate isomerase  63.01 
 
 
308 aa  302  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766552  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2169  triosephosphate isomerase  58.57 
 
 
265 aa  301  6.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.154658  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1258  triosephosphate isomerase  59.76 
 
 
260 aa  300  2e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352341  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11370  triosephosphate isomerase  59.36 
 
 
263 aa  295  4e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.413237  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15220  triosephosphate isomerase  55.16 
 
 
258 aa  291  6e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.005965  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2929  Triose-phosphate isomerase  57.37 
 
 
261 aa  281  9e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.962827  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0433  triosephosphate isomerase  44.36 
 
 
267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.292554  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  48.19 
 
 
248 aa  242  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  50 
 
 
255 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0907  triose-phosphate isomerase  46.09 
 
 
265 aa  241  7.999999999999999e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  48.19 
 
 
256 aa  236  2e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 
256 aa  234  9e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  48.19 
 
 
255 aa  231  1e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  50.41 
 
 
250 aa  228  5e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  47.79 
 
 
251 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  48.78 
 
 
254 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  47.79 
 
 
251 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  48.19 
 
 
251 aa  228  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  50.58 
 
 
250 aa  228  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  44.4 
 
 
257 aa  227  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  47.79 
 
 
251 aa  226  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  47.79 
 
 
251 aa  225  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  47.79 
 
 
251 aa  225  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  48 
 
 
253 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 
251 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  47.56 
 
 
254 aa  224  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  46.75 
 
 
251 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 
251 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 
251 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 
251 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 
251 aa  223  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 
252 aa  222  4e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  47.39 
 
 
257 aa  221  7e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  46.59 
 
 
254 aa  221  9.999999999999999e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  44.58 
 
 
250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  46.69 
 
 
256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 
250 aa  219  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 
252 aa  219  3e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  44.18 
 
 
248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  46.37 
 
 
251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4717  Triose-phosphate isomerase  48.41 
 
 
255 aa  217  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000120949  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  42.57 
 
 
251 aa  217  1e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0957  triosephosphate isomerase  44.44 
 
 
260 aa  217  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0345759  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  48.21 
 
 
253 aa  216  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  41.46 
 
 
249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  45.82 
 
 
650 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  44.98 
 
 
253 aa  216  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  45.42 
 
 
253 aa  215  7e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  45.42 
 
 
253 aa  215  7e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 
253 aa  214  8e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 
251 aa  214  9e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1003  triosephosphate isomerase  43.68 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0343606  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0986  triosephosphate isomerase  43.68 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000192621  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 
253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  43.45 
 
 
260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  43.45 
 
 
260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  43.45 
 
 
260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  43.45 
 
 
260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000672651  hitchhiker  0.0000521404 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3393  triosephosphate isomerase  42.91 
 
 
260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000164415  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  43.45 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371764  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  43.45 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000876569  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3565  triosephosphate isomerase  42.91 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.147919  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  43.45 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084878  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  46.59 
 
 
249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  43.45 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000257421  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  43.45 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121721  unclonable  0.00000000000528037 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2831  triosephosphate isomerase  43.3 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000042953  hitchhiker  0.00389109 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  43.97 
 
 
655 aa  212  4.9999999999999996e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  43.2 
 
 
275 aa  211  7.999999999999999e-54  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 
251 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>