More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2705 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2705  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 261 aa  532  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3708  triosephosphate isomerase  92.34 
 
 		 261 aa  496  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2446  triosephosphate isomerase  91.95 
 
 		 261 aa  480  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2406  triosephosphate isomerase  91.95 
 
 		 261 aa  480  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2452  triosephosphate isomerase  91.95 
 
 		 261 aa  480  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.487817 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11466  triosephosphate isomerase  85.82 
 
 		 261 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000235283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2365  triosephosphate isomerase  80.31 
 
 		 262 aa  431  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2538  triosephosphate isomerase  73.85 
 
 		 260 aa  408  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00272657  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  70.11 
 
 		 261 aa  387  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5197  triosephosphate isomerase  69.73 
 
 		 261 aa  382  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  69.92 
 
 		 260 aa  358  5e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6036  triose-phosphate isomerase  66.8 
 
 		 261 aa  347  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2065  triosephosphate isomerase  65.85 
 
 		 270 aa  344  8.999999999999999e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5606  triosephosphate isomerase  68.08 
 
 		 263 aa  341  5.999999999999999e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245433  normal  0.85925 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2802  triosephosphate isomerase  63.67 
 
 		 261 aa  341  7e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000097423  hitchhiker  0.00000994621 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2015  triosephosphate isomerase  64.2 
 
 		 261 aa  339  2.9999999999999998e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.944897  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  64.37 
 
 		 258 aa  331  6e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20010  triosephosphate isomerase  62.93 
 
 		 264 aa  329  3e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.627972 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  64.78 
 
 		 265 aa  329  3e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  65.08 
 
 		 261 aa  327  9e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2981  triosephosphate isomerase  64.23 
 
 		 260 aa  326  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.322057  normal  0.030919 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3096  Triose-phosphate isomerase  61.6 
 
 		 263 aa  324  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119937  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  62 
 
 		 263 aa  321  9.000000000000001e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2532  triosephosphate isomerase  63.45 
 
 		 264 aa  318  3.9999999999999996e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1639  triosephosphate isomerase  65.85 
 
 		 308 aa  317  9e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766552  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1941  triosephosphate isomerase  61.26 
 
 		 264 aa  314  9.999999999999999e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.36983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  60.4 
 
 		 687 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1830  Triose-phosphate isomerase  58.57 
 
 		 271 aa  311  4.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136952 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2089  triosephosphate isomerase  58.17 
 
 		 271 aa  310  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19012  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2048  triosephosphate isomerase  57.35 
 
 		 287 aa  308  5e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13130  triosephosphate isomerase  59.76 
 
 		 263 aa  307  1.0000000000000001e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.751982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2169  triosephosphate isomerase  58.73 
 
 		 265 aa  303  1.0000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.154658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1258  triosephosphate isomerase  59.52 
 
 		 260 aa  302  3.0000000000000004e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11370  triosephosphate isomerase  61.51 
 
 		 263 aa  297  1e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.413237  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15220  triosephosphate isomerase  56.8 
 
 		 258 aa  292  3e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.005965  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2929  Triose-phosphate isomerase  58.1 
 
 		 261 aa  284  9e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.962827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0433  triosephosphate isomerase  47.06 
 
 		 267 aa  256  4e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.292554  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0907  triose-phosphate isomerase  47.88 
 
 		 265 aa  248  6e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 		 255 aa  243  3e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  51.22 
 
 		 250 aa  229  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  49 
 
 		 252 aa  229  5e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  45.42 
 
 		 256 aa  228  8e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  49 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  47.79 
 
 		 250 aa  226  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 		 256 aa  224  1e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 		 253 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  44.05 
 
 		 257 aa  222  6e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  47.15 
 
 		 255 aa  221  7e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 254 aa  221  8e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  47.79 
 
 		 249 aa  221  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  44.58 
 
 		 251 aa  221  9.999999999999999e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  46.75 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  46.8 
 
 		 253 aa  219  3e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  46.75 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  46.75 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  46.75 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  47.01 
 
 		 254 aa  218  6e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  46.75 
 
 		 251 aa  218  7e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  47.79 
 
 		 257 aa  218  7e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  46.34 
 
 		 251 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  46.34 
 
 		 251 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  46.34 
 
 		 251 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  46.34 
 
 		 251 aa  217  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  46.34 
 
 		 251 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  46.34 
 
 		 251 aa  216  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  46.34 
 
 		 251 aa  216  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  45.24 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  45.06 
 
 		 646 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1003  triosephosphate isomerase  45.74 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0343606  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  45.53 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 		 253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  47.49 
 
 		 250 aa  212  5.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0986  triosephosphate isomerase  44.96 
 
 		 260 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000192621  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  44.8 
 
 		 253 aa  211  7e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  44.8 
 
 		 253 aa  211  7e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0957  triosephosphate isomerase  45.35 
 
 		 260 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0345759  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3064  triosephosphate isomerase  44.96 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000137173  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  47.15 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  43.78 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  44.19 
 
 		 260 aa  209  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  44.19 
 
 		 260 aa  209  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3393  triosephosphate isomerase  44.19 
 
 		 260 aa  209  4e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000164415  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  44.19 
 
 		 260 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  44.19 
 
 		 260 aa  209  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000672651  hitchhiker  0.0000521404 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  44.19 
 
 		 260 aa  208  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000257421  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  44.19 
 
 		 260 aa  208  5e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000876569  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  44.19 
 
 		 260 aa  208  5e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084878  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  44.19 
 
 		 260 aa  208  5e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371764  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  44.19 
 
 		 260 aa  208  5e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121721  unclonable  0.00000000000528037 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  41.06 
 
 		 249 aa  208  6e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  47.58 
 
 		 253 aa  208  8e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  44.35 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  42.63 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2831  triosephosphate isomerase  44.19 
 
 		 260 aa  207  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000042953  hitchhiker  0.00389109 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3565  triosephosphate isomerase  43.8 
 
 		 260 aa  206  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.147919  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  46.37 
 
 		 253 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  41.7 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>