More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1520 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  100 
 
 
248 aa  509  1e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  72.98 
 
 
250 aa  375  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  52.87 
 
 
248 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2064  triosephosphate isomerase  53.28 
 
 
248 aa  246  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0168982  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 
261 aa  246  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1135  triosephosphate isomerase  55.92 
 
 
244 aa  244  8e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.665659  hitchhiker  0.00574911 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 
258 aa  243  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  51.64 
 
 
248 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  49.59 
 
 
250 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  48.37 
 
 
250 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 
261 aa  241  5e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2065  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 
270 aa  241  7.999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2015  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 
261 aa  239  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.944897  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 
260 aa  240  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  49.8 
 
 
263 aa  240  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  51.42 
 
 
250 aa  239  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2538  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 
260 aa  238  5e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00272657  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  50 
 
 
687 aa  238  5e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  51.24 
 
 
255 aa  238  5.999999999999999e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1401  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 
251 aa  238  8e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0615206  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 
265 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 
245 aa  237  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1499  Triose-phosphate isomerase  50.61 
 
 
248 aa  235  5.0000000000000005e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0165539 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3096  Triose-phosphate isomerase  48.19 
 
 
263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119937  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1639  triosephosphate isomerase  48.8 
 
 
308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766552  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2981  triosephosphate isomerase  49 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.322057  normal  0.030919 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  45.75 
 
 
248 aa  232  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5606  triosephosphate isomerase  51.6 
 
 
263 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245433  normal  0.85925 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01285  triosephosphate isomerase  51.44 
 
 
251 aa  233  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15220  triosephosphate isomerase  48.19 
 
 
258 aa  231  8.000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.005965  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  48.16 
 
 
245 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3708  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 
261 aa  229  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 
253 aa  230  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  46.37 
 
 
256 aa  229  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3216  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 
258 aa  229  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00012954  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20010  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 
264 aa  229  3e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.627972 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  48.58 
 
 
254 aa  229  4e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  48.58 
 
 
254 aa  229  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  44.49 
 
 
650 aa  228  5e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  44.94 
 
 
252 aa  228  5e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 
251 aa  228  5e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  45.75 
 
 
250 aa  228  6e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1941  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 
264 aa  228  7e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.36983  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2048  triosephosphate isomerase  47.19 
 
 
287 aa  227  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  48.58 
 
 
257 aa  227  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  49.8 
 
 
253 aa  226  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2802  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 
261 aa  226  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000097423  hitchhiker  0.00000994621 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  46.59 
 
 
251 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 
255 aa  226  4e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  48.98 
 
 
249 aa  225  7e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3504  triosephosphate isomerase  44.18 
 
 
250 aa  224  8e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.449389  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 
271 aa  224  8e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5197  triosephosphate isomerase  46.59 
 
 
261 aa  224  9e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2011  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 
259 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000187443  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  47.54 
 
 
251 aa  224  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  48.58 
 
 
250 aa  224  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2003  triosephosphate isomerase  47.62 
 
 
256 aa  224  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0534929  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1341  triosephosphate isomerase  50 
 
 
259 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000463974  normal  0.0307092 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1026  triosephosphate isomerase  46.59 
 
 
251 aa  223  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00133267  normal  0.306303 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1258  triosephosphate isomerase  46.03 
 
 
260 aa  223  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352341  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2169  triosephosphate isomerase  46.03 
 
 
265 aa  223  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.154658  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1140  triosephosphate isomerase  51.21 
 
 
248 aa  222  3e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.766646  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  45.42 
 
 
655 aa  222  3e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 
253 aa  222  4e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  45.16 
 
 
252 aa  222  4.9999999999999996e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1830  Triose-phosphate isomerase  44.44 
 
 
271 aa  222  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136952 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  45.34 
 
 
275 aa  221  6e-57  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0100  triosephosphate isomerase  42.34 
 
 
249 aa  221  6e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 
251 aa  221  9e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 
251 aa  221  9e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 
253 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  43.09 
 
 
252 aa  219  1.9999999999999999e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  43.6 
 
 
251 aa  219  3e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0674  triosephosphate isomerase  44.9 
 
 
250 aa  219  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.260735  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1287  triosephosphate isomerase  47.62 
 
 
266 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 
256 aa  219  3e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1058  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 
251 aa  219  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00483785  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  44.18 
 
 
254 aa  219  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2365  triosephosphate isomerase  44.18 
 
 
262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  45.63 
 
 
254 aa  218  7e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 
251 aa  218  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  45.6 
 
 
250 aa  218  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  46 
 
 
252 aa  217  1e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.06 
 
 
646 aa  217  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2168  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 
251 aa  217  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00524142  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2289  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 
251 aa  217  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785898  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2532  triosephosphate isomerase  46.77 
 
 
264 aa  217  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  42.51 
 
 
253 aa  216  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 
257 aa  217  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11370  triosephosphate isomerase  50.79 
 
 
263 aa  217  2e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.413237  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  46.59 
 
 
250 aa  217  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2833  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 
251 aa  217  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.091999  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  44.13 
 
 
251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6036  triose-phosphate isomerase  46.18 
 
 
261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  42.34 
 
 
251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0433  triosephosphate isomerase  44.22 
 
 
267 aa  216  4e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.292554  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  45.8 
 
 
248 aa  215  4e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  44.8 
 
 
251 aa  216  4e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2705  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 
261 aa  215  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  46.96 
 
 
249 aa  214  7e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>