More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0444 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 253 aa  520  1e-147  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  87.75 
 
 		 253 aa  468  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  87.75 
 
 		 253 aa  468  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  61.42 
 
 		 251 aa  321  6e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  61.42 
 
 		 253 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  61.42 
 
 		 251 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  61.42 
 
 		 251 aa  319  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  61.42 
 
 		 251 aa  319  3e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  61.42 
 
 		 251 aa  319  3e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  61.42 
 
 		 251 aa  319  3e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  61.02 
 
 		 251 aa  318  6e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  61.02 
 
 		 251 aa  318  6e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  61.72 
 
 		 251 aa  318  6e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  61.02 
 
 		 251 aa  317  1e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  61.02 
 
 		 251 aa  317  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  59.84 
 
 		 253 aa  308  8e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  59.29 
 
 		 252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  58.89 
 
 		 252 aa  296  2e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  56.4 
 
 		 251 aa  290  2e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  55.42 
 
 		 248 aa  285  5.999999999999999e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  55.42 
 
 		 248 aa  285  5.999999999999999e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1244  triosephosphate isomerase  56 
 
 		 252 aa  281  8.000000000000001e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  55.2 
 
 		 248 aa  275  4e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  52.76 
 
 		 250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  53.78 
 
 		 250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 		 250 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2017  triosephosphate isomerase  52.76 
 
 		 256 aa  265  4e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.283793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  55.51 
 
 		 646 aa  265  5e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  51.79 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  51 
 
 		 249 aa  260  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  51.38 
 
 		 251 aa  260  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  54.51 
 
 		 251 aa  258  5.0000000000000005e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 249 aa  258  5.0000000000000005e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  50.79 
 
 		 251 aa  258  6e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  50.4 
 
 		 257 aa  258  8e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  53.47 
 
 		 255 aa  257  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  52.4 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  51.41 
 
 		 248 aa  251  8.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  51.41 
 
 		 650 aa  246  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4717  Triose-phosphate isomerase  51.59 
 
 		 255 aa  246  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000120949  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  49.6 
 
 		 250 aa  244  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2003  triosephosphate isomerase  47.64 
 
 		 256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0534929  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  48.8 
 
 		 251 aa  243  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 		 256 aa  241  7.999999999999999e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 254 aa  240  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 		 252 aa  239  2e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  50 
 
 		 243 aa  237  1e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  47.41 
 
 		 251 aa  236  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  48.37 
 
 		 251 aa  236  4e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  46.48 
 
 		 255 aa  235  5.0000000000000005e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0672  triosephosphate isomerase  47.43 
 
 		 253 aa  235  6e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.649878  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  46 
 
 		 251 aa  234  8e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 654 aa  234  9e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  49.58 
 
 		 243 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  49.61 
 
 		 261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20010  triosephosphate isomerase  51.19 
 
 		 264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.627972 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0750  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 		 248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  46 
 
 		 251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  48.02 
 
 		 253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  46.43 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  47.43 
 
 		 257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  47.04 
 
 		 256 aa  232  4.0000000000000004e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 		 250 aa  231  9e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.99 
 
 		 655 aa  231  1e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  45.88 
 
 		 265 aa  231  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2802  triosephosphate isomerase  48.4 
 
 		 261 aa  230  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000097423  hitchhiker  0.00000994621 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  47.62 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  47.41 
 
 		 251 aa  230  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4008  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 241 aa  228  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0608629 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  46.03 
 
 		 257 aa  227  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  46.59 
 
 		 254 aa  227  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  44.58 
 
 		 249 aa  226  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10641  triosephosphate isomerase  45.42 
 
 		 246 aa  226  3e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0590544 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_649  triose-phosphate isomerase  47.04 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15220  triosephosphate isomerase  48 
 
 		 258 aa  226  3e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.005965  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  48 
 
 		 263 aa  226  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  46.46 
 
 		 250 aa  226  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0171  triosephosphate isomerase  46.46 
 
 		 256 aa  225  5.0000000000000005e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000459536  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0382  triosephosphate isomerase  45.02 
 
 		 246 aa  225  6e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  43.43 
 
 		 252 aa  225  6e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 263 aa  225  7e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3096  Triose-phosphate isomerase  48 
 
 		 263 aa  224  9e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119937  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1941  triosephosphate isomerase  48.41 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.36983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13911  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 243 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.303825 
 
 
-
 
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  43.25 
 
 		 251 aa  222  4e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1825  triosephosphate isomerase  44.76 
 
 		 248 aa  222  4.9999999999999996e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 253 aa  221  6e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1078  triosephosphate isomerase  46.27 
 
 		 298 aa  221  7e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0742  triosephosphate isomerase  44.49 
 
 		 256 aa  221  7e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10411  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 		 241 aa  221  9e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10411  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 		 241 aa  221  9e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  44.44 
 
 		 256 aa  220  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  48.4 
 
 		 265 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5197  triosephosphate isomerase  46.8 
 
 		 261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3708  triosephosphate isomerase  46.8 
 
 		 261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0830  triosephosphate isomerase  44.8 
 
 		 243 aa  220  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292321  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1380  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 241 aa  220  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2532  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>