More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_10641 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_10641  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 246 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0590544 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0382  triosephosphate isomerase  97.97 
 
 		 246 aa  501  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13911  triosephosphate isomerase  72.95 
 
 		 243 aa  367  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.303825 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09381  triosephosphate isomerase  72.54 
 
 		 243 aa  364  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000670344 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0830  triosephosphate isomerase  70.37 
 
 		 243 aa  361  7.0000000000000005e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292321  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1825  triosephosphate isomerase  68.85 
 
 		 248 aa  359  2e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10411  triosephosphate isomerase  72.13 
 
 		 241 aa  356  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10411  triosephosphate isomerase  72.13 
 
 		 241 aa  356  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09041  triosephosphate isomerase  70.08 
 
 		 241 aa  354  8.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.535393  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0971  triosephosphate isomerase  72.13 
 
 		 241 aa  353  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1078  triosephosphate isomerase  55.69 
 
 		 298 aa  280  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1380  triosephosphate isomerase  54.51 
 
 		 241 aa  273  3e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  52.46 
 
 		 263 aa  269  2.9999999999999997e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3290  triosephosphate isomerase  53.69 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4008  triosephosphate isomerase  52.05 
 
 		 241 aa  264  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0608629 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2499  triosephosphate isomerase  53.65 
 
 		 230 aa  254  8e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3615  Triose-phosphate isomerase  53.88 
 
 		 230 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  50.59 
 
 		 248 aa  248  5e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3369  Triose-phosphate isomerase  50.21 
 
 		 231 aa  238  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0061573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  47.64 
 
 		 249 aa  237  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 		 251 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  46.56 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  46.64 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  46.64 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  46.8 
 
 		 250 aa  229  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  47.2 
 
 		 250 aa  228  9e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  45.42 
 
 		 253 aa  226  3e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  44.18 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  45.06 
 
 		 253 aa  222  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  45.02 
 
 		 253 aa  222  4e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  45.02 
 
 		 253 aa  222  4e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  45.67 
 
 		 251 aa  219  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  45.31 
 
 		 250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  43.31 
 
 		 250 aa  218  7e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  45.1 
 
 		 251 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46 
 
 		 646 aa  216  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  46.25 
 
 		 250 aa  217  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  45.6 
 
 		 257 aa  216  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  46.15 
 
 		 255 aa  215  4e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  45.42 
 
 		 251 aa  215  5e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  43.75 
 
 		 254 aa  214  7e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  44.66 
 
 		 251 aa  214  7e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  44.84 
 
 		 250 aa  214  8e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  44.35 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  44.35 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  44.35 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  44.35 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  44.35 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  44.35 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  44.35 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  44.35 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  44.35 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  44.35 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  44.35 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  43.65 
 
 		 253 aa  212  3.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  44.09 
 
 		 251 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  44.88 
 
 		 251 aa  212  4.9999999999999996e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  43.08 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  42.91 
 
 		 255 aa  209  3e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0672  triosephosphate isomerase  44.13 
 
 		 253 aa  209  4e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.649878  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  43.25 
 
 		 251 aa  209  5e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  45.24 
 
 		 650 aa  208  6e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  42.4 
 
 		 252 aa  208  7e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  43.43 
 
 		 253 aa  208  7e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  43.08 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  41.8 
 
 		 252 aa  202  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1153  triosephosphate isomerase  43.72 
 
 		 250 aa  202  4e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  42.91 
 
 		 248 aa  202  5e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  42.74 
 
 		 250 aa  201  9e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  41.34 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2981  triosephosphate isomerase  43.03 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.322057  normal  0.030919 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  44.14 
 
 		 254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  41.41 
 
 		 261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1941  triosephosphate isomerase  42.97 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.36983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0056  triosephosphate isomerase  43.08 
 
 		 253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20010  triosephosphate isomerase  41.41 
 
 		 264 aa  196  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.627972 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  43.15 
 
 		 252 aa  196  3e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  41.57 
 
 		 265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  44.35 
 
 		 253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1244  triosephosphate isomerase  43.32 
 
 		 252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  40.71 
 
 		 251 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  44.35 
 
 		 253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  44.66 
 
 		 655 aa  195  6e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2802  triosephosphate isomerase  40.8 
 
 		 261 aa  194  8.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000097423  hitchhiker  0.00000994621 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  44.27 
 
 		 654 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  42.74 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13483  triosephosphate isomerase  40.48 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.943567  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  41.6 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  42.04 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  42.32 
 
 		 243 aa  193  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  40.65 
 
 		 249 aa  192  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  42.06 
 
 		 260 aa  192  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  41.57 
 
 		 275 aa  192  4e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  41.7 
 
 		 251 aa  192  5e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  39.84 
 
 		 256 aa  192  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4717  Triose-phosphate isomerase  41.94 
 
 		 255 aa  191  7e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000120949  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2003  triosephosphate isomerase  41.37 
 
 		 256 aa  191  7e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0534929  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  42.57 
 
 		 250 aa  191  8e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  42 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  39.61 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>