More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3369 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3369  Triose-phosphate isomerase  100 
 
 
231 aa  478  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0061573  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3290  triosephosphate isomerase  80.43 
 
 
241 aa  388  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  77.49 
 
 
263 aa  375  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1078  triosephosphate isomerase  73.48 
 
 
298 aa  363  1e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4008  triosephosphate isomerase  71.3 
 
 
241 aa  350  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0608629 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1380  triosephosphate isomerase  71.3 
 
 
241 aa  346  1e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2499  triosephosphate isomerase  72.17 
 
 
230 aa  341  7e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16227  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3615  Triose-phosphate isomerase  71.74 
 
 
230 aa  339  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09381  triosephosphate isomerase  54.98 
 
 
243 aa  267  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000670344 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1825  triosephosphate isomerase  55.41 
 
 
248 aa  264  8.999999999999999e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13911  triosephosphate isomerase  54.55 
 
 
243 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.303825 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0830  triosephosphate isomerase  54.98 
 
 
243 aa  258  6e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292321  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10411  triosephosphate isomerase  51.74 
 
 
241 aa  252  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0971  triosephosphate isomerase  51.74 
 
 
241 aa  251  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10411  triosephosphate isomerase  51.74 
 
 
241 aa  250  1e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09041  triosephosphate isomerase  50 
 
 
241 aa  246  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.535393  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10641  triosephosphate isomerase  50.21 
 
 
246 aa  238  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0590544 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  50.63 
 
 
248 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0382  triosephosphate isomerase  49.79 
 
 
246 aa  237  1e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  52.92 
 
 
250 aa  235  4e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  52.1 
 
 
250 aa  231  6e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  50.84 
 
 
249 aa  230  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  50.42 
 
 
250 aa  228  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  51.68 
 
 
251 aa  224  6e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.95 
 
 
650 aa  223  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  50.63 
 
 
250 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  47.68 
 
 
249 aa  221  8e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  51.07 
 
 
255 aa  219  3e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  48.12 
 
 
251 aa  218  7e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  48.54 
 
 
250 aa  214  7e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  50.21 
 
 
254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  48.95 
 
 
251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  48.74 
 
 
257 aa  211  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  46.03 
 
 
248 aa  209  3e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  46.03 
 
 
248 aa  209  3e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  48.1 
 
 
253 aa  208  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  47.7 
 
 
254 aa  208  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  47.5 
 
 
253 aa  208  7e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  46.84 
 
 
250 aa  207  8e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  48.54 
 
 
253 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.19 
 
 
646 aa  207  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  45.42 
 
 
250 aa  206  3e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  46.09 
 
 
275 aa  206  3e-52  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0672  triosephosphate isomerase  46.58 
 
 
253 aa  203  2e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.649878  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  46.86 
 
 
254 aa  202  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  46.67 
 
 
251 aa  202  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  43.75 
 
 
251 aa  202  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  45.23 
 
 
261 aa  201  7e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  44.54 
 
 
249 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  43.33 
 
 
251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  43.75 
 
 
251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  45.38 
 
 
254 aa  198  5e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  42.68 
 
 
251 aa  198  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  50.45 
 
 
246 aa  198  6e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  43.51 
 
 
251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  46.19 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  45.57 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  45.53 
 
 
251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  45.96 
 
 
251 aa  194  9e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  44.3 
 
 
251 aa  194  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  44.49 
 
 
252 aa  193  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  42.98 
 
 
257 aa  193  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  45.53 
 
 
251 aa  192  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  45.53 
 
 
251 aa  192  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  45.53 
 
 
251 aa  192  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  45.53 
 
 
251 aa  192  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  45.53 
 
 
251 aa  192  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  45.53 
 
 
251 aa  192  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  45.53 
 
 
251 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  43.28 
 
 
256 aa  192  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2003  triosephosphate isomerase  43.04 
 
 
256 aa  192  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0534929  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  45.53 
 
 
251 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  45.53 
 
 
251 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  45.53 
 
 
251 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  43.1 
 
 
253 aa  192  5e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  44.58 
 
 
253 aa  191  8e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  41.91 
 
 
252 aa  190  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  44.07 
 
 
250 aa  190  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  44.17 
 
 
243 aa  190  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0742  triosephosphate isomerase  44.64 
 
 
251 aa  189  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  43.1 
 
 
251 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  45.19 
 
 
256 aa  190  2e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_649  triose-phosphate isomerase  44.64 
 
 
251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  41.74 
 
 
265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  46.41 
 
 
253 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  41.67 
 
 
251 aa  189  4e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  46.41 
 
 
253 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1026  triosephosphate isomerase  42.67 
 
 
251 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00133267  normal  0.306303 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  42.24 
 
 
251 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  42.24 
 
 
251 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4717  Triose-phosphate isomerase  43.64 
 
 
255 aa  188  7e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000120949  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  43.75 
 
 
255 aa  187  1e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  44.35 
 
 
256 aa  187  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  41 
 
 
252 aa  187  1e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  45 
 
 
654 aa  186  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  42.19 
 
 
252 aa  186  3e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  43.42 
 
 
655 aa  186  4e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  43.21 
 
 
265 aa  185  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  41.81 
 
 
251 aa  185  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  42.5 
 
 
248 aa  185  6e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>