More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_10411 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_10411  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 241 aa  501  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0971  triosephosphate isomerase  96.68 
 
 		 241 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10411  triosephosphate isomerase  96.68 
 
 		 241 aa  487  1e-137  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09041  triosephosphate isomerase  89.63 
 
 		 241 aa  460  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.535393  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13911  triosephosphate isomerase  74.27 
 
 		 243 aa  384  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.303825 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09381  triosephosphate isomerase  73.44 
 
 		 243 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000670344 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1825  triosephosphate isomerase  70.12 
 
 		 248 aa  369  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0382  triosephosphate isomerase  72.54 
 
 		 246 aa  360  1e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0830  triosephosphate isomerase  68.75 
 
 		 243 aa  359  2e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292321  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10641  triosephosphate isomerase  72.13 
 
 		 246 aa  356  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0590544 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  56.02 
 
 		 263 aa  291  8e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3290  triosephosphate isomerase  54.77 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1380  triosephosphate isomerase  53.94 
 
 		 241 aa  278  4e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1078  triosephosphate isomerase  52.7 
 
 		 298 aa  275  4e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4008  triosephosphate isomerase  51.04 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0608629 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2499  triosephosphate isomerase  55.22 
 
 		 230 aa  263  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3615  Triose-phosphate isomerase  54.78 
 
 		 230 aa  261  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3369  Triose-phosphate isomerase  51.74 
 
 		 231 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0061573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 248 aa  249  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  48.59 
 
 		 249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  48.58 
 
 		 250 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  47.95 
 
 		 249 aa  237  1e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  48.58 
 
 		 253 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  49.39 
 
 		 251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  47.2 
 
 		 251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 		 248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 		 248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 		 251 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  46.15 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  45.42 
 
 		 251 aa  228  7e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 		 250 aa  228  8e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  46.12 
 
 		 253 aa  225  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  46.15 
 
 		 250 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 250 aa  224  7e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  43.82 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 254 aa  223  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 		 253 aa  222  4e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 		 253 aa  222  4e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  43.2 
 
 		 251 aa  222  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  44.13 
 
 		 252 aa  221  8e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 		 253 aa  221  8e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  47.95 
 
 		 251 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  44.22 
 
 		 251 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  44.53 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  44.8 
 
 		 254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  47.13 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  47.13 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  47.13 
 
 		 251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  47.13 
 
 		 251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  47.13 
 
 		 251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  43.9 
 
 		 250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  47.13 
 
 		 251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  47.13 
 
 		 251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  47.13 
 
 		 251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  47.13 
 
 		 251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  46.56 
 
 		 251 aa  218  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  46.12 
 
 		 253 aa  218  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  46.12 
 
 		 253 aa  218  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  43.43 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0056  triosephosphate isomerase  45.67 
 
 		 253 aa  217  2e-55  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  44.98 
 
 		 251 aa  216  4e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  44.94 
 
 		 646 aa  215  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  42.98 
 
 		 253 aa  214  9e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  45.67 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  45.56 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  43.82 
 
 		 252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  44.22 
 
 		 275 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  43.82 
 
 		 248 aa  211  7.999999999999999e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  42.57 
 
 		 253 aa  211  1e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  44.49 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  44.18 
 
 		 650 aa  209  4e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  45.06 
 
 		 250 aa  208  7e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  43.37 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  45.02 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  45.75 
 
 		 254 aa  206  2e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  44.35 
 
 		 655 aa  206  3e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 250 aa  205  5e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  43.85 
 
 		 251 aa  205  5e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  41.77 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1549  triosephosphate isomerase  42.97 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.42091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1153  triosephosphate isomerase  44.72 
 
 		 250 aa  202  3e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  41.53 
 
 		 265 aa  202  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  43.37 
 
 		 254 aa  202  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4717  Triose-phosphate isomerase  42.45 
 
 		 255 aa  201  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000120949  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  43.44 
 
 		 255 aa  201  7e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  42.28 
 
 		 255 aa  201  7e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  42.51 
 
 		 250 aa  201  9e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2017  triosephosphate isomerase  42.17 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.283793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1244  triosephosphate isomerase  44.72 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2003  triosephosphate isomerase  41.46 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0534929  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1356  triosephosphate isomerase  44.08 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.688667  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  42.4 
 
 		 654 aa  199  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1410  Triose-phosphate isomerase  40.49 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  43.28 
 
 		 243 aa  199  5e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  41.77 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  40.78 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1941  triosephosphate isomerase  41.96 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.36983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  41.63 
 
 		 251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  44.49 
 
 		 249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0750  triosephosphate isomerase  42.46 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>