More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0750 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0750  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 248 aa  502  1e-141  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  66.53 
 
 		 275 aa  348  3e-95  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  51.61 
 
 		 252 aa  265  4e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 		 252 aa  262  3e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  49 
 
 		 253 aa  249  3e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 251 aa  246  3e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  47.37 
 
 		 251 aa  244  6.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  51.81 
 
 		 250 aa  244  8e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  47.77 
 
 		 250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 251 aa  242  5e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  46.77 
 
 		 251 aa  241  6e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  46.77 
 
 		 251 aa  241  6e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  46.77 
 
 		 251 aa  240  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  46.96 
 
 		 251 aa  240  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  46.77 
 
 		 251 aa  240  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  47.18 
 
 		 251 aa  239  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  46.77 
 
 		 251 aa  239  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  46.77 
 
 		 251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  46.77 
 
 		 251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  46.77 
 
 		 251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  48.39 
 
 		 253 aa  235  6e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 		 253 aa  234  9e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49.38 
 
 		 646 aa  233  3e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  45.75 
 
 		 253 aa  230  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  47.98 
 
 		 248 aa  231  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  47.18 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  47.18 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  44.4 
 
 		 249 aa  229  4e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1244  triosephosphate isomerase  47.15 
 
 		 252 aa  227  2e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  44.98 
 
 		 253 aa  226  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  44.98 
 
 		 253 aa  226  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  42.34 
 
 		 257 aa  223  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  41.77 
 
 		 256 aa  220  9.999999999999999e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.37 
 
 		 650 aa  219  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  44.44 
 
 		 257 aa  218  6e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 		 255 aa  218  7.999999999999999e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  45.75 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  47.58 
 
 		 251 aa  216  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  45.42 
 
 		 250 aa  214  8e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  43.25 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5608  triosephosphate isomerase  44.22 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  43.03 
 
 		 250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  43.65 
 
 		 252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.72 
 
 		 655 aa  211  7.999999999999999e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  45.6 
 
 		 249 aa  211  9e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  41.3 
 
 		 249 aa  210  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  47.33 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  41.53 
 
 		 253 aa  209  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2017  triosephosphate isomerase  43.09 
 
 		 256 aa  209  4e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.283793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  41.53 
 
 		 253 aa  208  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  44.13 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  44.76 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  40.96 
 
 		 253 aa  206  3e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  43.78 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  43.72 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  45.99 
 
 		 255 aa  206  4e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  45.56 
 
 		 254 aa  206  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  44.53 
 
 		 249 aa  205  5e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  40.24 
 
 		 250 aa  204  7e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  44.35 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1825  triosephosphate isomerase  43.08 
 
 		 248 aa  204  2e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0674  triosephosphate isomerase  39.27 
 
 		 250 aa  203  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.260735  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  41.53 
 
 		 253 aa  201  8e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  41.53 
 
 		 253 aa  201  8e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  43.9 
 
 		 252 aa  201  9e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  41.77 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13130  triosephosphate isomerase  40.39 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.751982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0830  triosephosphate isomerase  43.87 
 
 		 243 aa  199  3e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292321  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  39.92 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  41.46 
 
 		 248 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  53.55 
 
 		 243 aa  198  6e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0103  triosephosphate isomerase  41.7 
 
 		 256 aa  198  7e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  39.59 
 
 		 245 aa  198  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1258  triosephosphate isomerase  38.28 
 
 		 260 aa  197  9e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  40.08 
 
 		 248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  53.01 
 
 		 243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3504  triosephosphate isomerase  41.77 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.449389  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  40.16 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  41.25 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10411  triosephosphate isomerase  42.46 
 
 		 241 aa  196  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03804  triosephosphate isomerase  41.73 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4066  Triose-phosphate isomerase  41.73 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03753  hypothetical protein  41.73 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4399  triosephosphate isomerase  41.73 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4453  triosephosphate isomerase  41.73 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4359  triosephosphate isomerase  41.73 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.626096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  39.92 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0971  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 241 aa  196  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4150  triosephosphate isomerase  41.73 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5374  triosephosphate isomerase  41.73 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  43.2 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4099  triosephosphate isomerase  41.73 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2003  triosephosphate isomerase  37.5 
 
 		 256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0534929  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4008  triosephosphate isomerase  44.66 
 
 		 241 aa  195  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0608629 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3104  Triose-phosphate isomerase  41.87 
 
 		 253 aa  195  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  40.64 
 
 		 254 aa  195  7e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  43.95 
 
 		 251 aa  195  7e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2169  triosephosphate isomerase  36.72 
 
 		 265 aa  195  7e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.154658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  39.84 
 
 		 254 aa  194  8.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>