More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0433 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0433  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 267 aa  551  1e-156  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.292554  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0907  triose-phosphate isomerase  75 
 
 		 265 aa  424  1e-118  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  56.81 
 
 		 687 aa  295  5e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20010  triosephosphate isomerase  54.65 
 
 		 264 aa  291  9e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.627972 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1941  triosephosphate isomerase  54.09 
 
 		 264 aa  288  5.0000000000000004e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.36983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13130  triosephosphate isomerase  53.12 
 
 		 263 aa  281  6.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.751982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2169  triosephosphate isomerase  51.36 
 
 		 265 aa  279  3e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.154658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  52.96 
 
 		 265 aa  280  3e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2532  triosephosphate isomerase  51.55 
 
 		 264 aa  279  3e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  52.55 
 
 		 261 aa  278  5e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  50.58 
 
 		 258 aa  276  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1258  triosephosphate isomerase  51.76 
 
 		 260 aa  275  6e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2089  triosephosphate isomerase  50.79 
 
 		 271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19012  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 260 aa  271  6e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1830  Triose-phosphate isomerase  50.19 
 
 		 271 aa  271  6e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136952 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2929  Triose-phosphate isomerase  53.15 
 
 		 261 aa  271  7e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.962827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6036  triose-phosphate isomerase  51.35 
 
 		 261 aa  266  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2802  triosephosphate isomerase  50.79 
 
 		 261 aa  266  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000097423  hitchhiker  0.00000994621 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  51.97 
 
 		 263 aa  265  5e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3096  Triose-phosphate isomerase  50.97 
 
 		 263 aa  265  5.999999999999999e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119937  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 261 aa  263  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5197  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 261 aa  263  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2065  triosephosphate isomerase  50.78 
 
 		 270 aa  263  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11370  triosephosphate isomerase  51.95 
 
 		 263 aa  261  6e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.413237  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2015  triosephosphate isomerase  49.03 
 
 		 261 aa  261  8e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.944897  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15220  triosephosphate isomerase  50.39 
 
 		 258 aa  260  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.005965  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5606  triosephosphate isomerase  51.95 
 
 		 263 aa  259  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245433  normal  0.85925 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2048  triosephosphate isomerase  48.35 
 
 		 287 aa  258  6e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3708  triosephosphate isomerase  48.63 
 
 		 261 aa  258  8e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2538  triosephosphate isomerase  46.27 
 
 		 260 aa  256  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00272657  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11466  triosephosphate isomerase  49.22 
 
 		 261 aa  255  5e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000235283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1639  triosephosphate isomerase  49.22 
 
 		 308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2705  triosephosphate isomerase  47.06 
 
 		 261 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2446  triosephosphate isomerase  47.45 
 
 		 261 aa  248  6e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2406  triosephosphate isomerase  47.45 
 
 		 261 aa  248  6e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2452  triosephosphate isomerase  47.45 
 
 		 261 aa  248  6e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.487817 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2981  triosephosphate isomerase  47.27 
 
 		 260 aa  248  9e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.322057  normal  0.030919 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2365  triosephosphate isomerase  44.36 
 
 		 262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  44.22 
 
 		 248 aa  216  4e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  43.19 
 
 		 655 aa  216  4e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  43.43 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  42.23 
 
 		 254 aa  211  9e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  41.83 
 
 		 248 aa  206  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  41.83 
 
 		 248 aa  206  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  43.87 
 
 		 257 aa  206  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  44.72 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0851  triosephosphate isomerase  44.27 
 
 		 275 aa  204  9e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  46.78 
 
 		 243 aa  203  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  42.29 
 
 		 251 aa  202  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  38.25 
 
 		 248 aa  202  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  43.41 
 
 		 250 aa  202  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  42.41 
 
 		 250 aa  202  7e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  44.22 
 
 		 250 aa  201  7e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  46.35 
 
 		 243 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  42.69 
 
 		 646 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  44.09 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  44.09 
 
 		 252 aa  199  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  45.42 
 
 		 254 aa  200  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  41.83 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  41.11 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  44.36 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  39.84 
 
 		 256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  41.02 
 
 		 251 aa  195  7e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  40.32 
 
 		 252 aa  195  8.000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3869  triosephosphate isomerase  38.74 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  45.38 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  43.82 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  43.58 
 
 		 253 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  41.63 
 
 		 256 aa  194  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  42.75 
 
 		 254 aa  192  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  42.35 
 
 		 253 aa  192  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  41.18 
 
 		 265 aa  192  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  43.92 
 
 		 246 aa  191  7e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1520  triosephosphate isomerase  44.32 
 
 		 272 aa  191  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128427  decreased coverage  0.0000834169 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  39.34 
 
 		 248 aa  191  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  40.94 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  37.89 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  41.41 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4805  triosephosphate isomerase  41.83 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000667098 
 
 
-
 
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  41.04 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4717  Triose-phosphate isomerase  41.47 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000120949  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  40.32 
 
 		 250 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2003  triosephosphate isomerase  41.37 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0534929  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  43.67 
 
 		 256 aa  189  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  39.92 
 
 		 252 aa  189  5e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  38.21 
 
 		 251 aa  189  5e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  40.73 
 
 		 252 aa  189  5e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  40.71 
 
 		 251 aa  188  7e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0775  triosephosphate isomerase  41.02 
 
 		 251 aa  186  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354266  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  40.23 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  41.31 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  41.31 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1026  triosephosphate isomerase  40.93 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00133267  normal  0.306303 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  38.76 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  40.23 
 
 		 271 aa  186  3e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  37.05 
 
 		 650 aa  186  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  43.82 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  41.31 
 
 		 251 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>