More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0851 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0851  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 275 aa  548  1e-155  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  50 
 
 		 687 aa  237  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  49.01 
 
 		 258 aa  229  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 		 249 aa  228  6e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  48.19 
 
 		 265 aa  225  7e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  51.63 
 
 		 255 aa  224  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2048  triosephosphate isomerase  48.23 
 
 		 287 aa  223  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 		 251 aa  221  7e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2802  triosephosphate isomerase  48.19 
 
 		 261 aa  221  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000097423  hitchhiker  0.00000994621 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2015  triosephosphate isomerase  48.43 
 
 		 261 aa  219  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.944897  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  48 
 
 		 261 aa  219  3.9999999999999997e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  43.75 
 
 		 655 aa  217  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3708  triosephosphate isomerase  46.59 
 
 		 261 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5606  triosephosphate isomerase  48.41 
 
 		 263 aa  216  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245433  normal  0.85925 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  47.01 
 
 		 250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  46.75 
 
 		 263 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  46.43 
 
 		 261 aa  214  8e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  46.4 
 
 		 250 aa  214  8e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2538  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 260 aa  214  9e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00272657  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  47.77 
 
 		 249 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20010  triosephosphate isomerase  44.66 
 
 		 264 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.627972 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  46.59 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2169  triosephosphate isomerase  45.67 
 
 		 265 aa  212  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.154658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  50 
 
 		 253 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3096  Triose-phosphate isomerase  45.45 
 
 		 263 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119937  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  43.6 
 
 		 650 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2365  triosephosphate isomerase  44.58 
 
 		 262 aa  212  5.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  46.4 
 
 		 254 aa  212  7e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6036  triose-phosphate isomerase  47.01 
 
 		 261 aa  212  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2532  triosephosphate isomerase  44.49 
 
 		 264 aa  211  7.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1153  triosephosphate isomerase  45.16 
 
 		 250 aa  211  1e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2089  triosephosphate isomerase  45.24 
 
 		 271 aa  211  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19012  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1830  Triose-phosphate isomerase  44.44 
 
 		 271 aa  210  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136952 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0433  triosephosphate isomerase  44.27 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.292554  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  45.6 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5197  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2065  triosephosphate isomerase  43.49 
 
 		 270 aa  209  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1941  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 264 aa  208  9e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.36983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13130  triosephosphate isomerase  45.63 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.751982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1258  triosephosphate isomerase  44.88 
 
 		 260 aa  206  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  48.18 
 
 		 249 aa  206  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2981  triosephosphate isomerase  45.02 
 
 		 260 aa  205  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.322057  normal  0.030919 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 		 254 aa  205  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  47.22 
 
 		 257 aa  205  8e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  45.28 
 
 		 253 aa  204  9e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  47.6 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  44 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  42.23 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  42.46 
 
 		 257 aa  204  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  48.39 
 
 		 248 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 253 aa  202  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2929  Triose-phosphate isomerase  48.02 
 
 		 261 aa  203  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.962827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  48.39 
 
 		 248 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  42.8 
 
 		 251 aa  202  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  44.31 
 
 		 253 aa  202  5e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  44.31 
 
 		 253 aa  202  5e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2705  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 		 261 aa  202  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  44 
 
 		 254 aa  202  6e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  45.93 
 
 		 250 aa  201  7e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  40.64 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  43.2 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  44.35 
 
 		 248 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2064  triosephosphate isomerase  47.58 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0168982  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  45.61 
 
 		 243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  46.56 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11466  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000235283  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3448  triosephosphate isomerase  44.18 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4528  triosephosphate isomerase  46.64 
 
 		 254 aa  199  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3808  triosephosphate isomerase  46.8 
 
 		 255 aa  200  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.102844  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  44.62 
 
 		 254 aa  199  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  45.93 
 
 		 253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  45.61 
 
 		 243 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0907  triose-phosphate isomerase  43.65 
 
 		 265 aa  199  6e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1639  triosephosphate isomerase  44.75 
 
 		 308 aa  198  7.999999999999999e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0742  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 		 256 aa  198  9e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  45.88 
 
 		 253 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2446  triosephosphate isomerase  46 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2406  triosephosphate isomerase  46 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2452  triosephosphate isomerase  46 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.487817 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2633  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  44.8 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  42.8 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  41.04 
 
 		 248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  41.04 
 
 		 248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  41.46 
 
 		 249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0154  triosephosphate isomerase  45.6 
 
 		 255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1380  triosephosphate isomerase  44.62 
 
 		 241 aa  196  5.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0169  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 255 aa  195  6e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.543601  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11370  triosephosphate isomerase  48.02 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.413237  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  44.4 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  44.62 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4118  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 		 255 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4008  triosephosphate isomerase  41.83 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0608629 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0095  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 		 255 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1591  triosephosphate isomerase  43.78 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1356  triosephosphate isomerase  40.16 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.688667  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0096  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 		 255 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  44.09 
 
 		 250 aa  192  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>