More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_24989 on replicon NC_009363
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009363  OSTLU_24989  predicted protein  100 
 
 		 279 aa  569  1e-161  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36521  predicted protein  100 
 
 		 266 aa  540  9.999999999999999e-153  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.144318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43602  predicted protein  61.23 
 
 		 338 aa  322  3e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.033956  normal  0.0824901 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06900  Triosephosphate isomerase (TIM)(EC 5.3.1.1)(Triose-phosphate isomerase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P04828]  55.28 
 
 		 249 aa  270  1e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.762723 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05000  triose-phosphate isomerase, putative  52.8 
 
 		 251 aa  264  1e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00881282  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_91105  Triosephosphate isomerase (TIM) (Triose-phosphate isomerase)  50.41 
 
 		 248 aa  247  2e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_54738  isomerase triosephosphate isomerase  48.05 
 
 		 268 aa  240  2e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0597298  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  50.4 
 
 		 249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25308  triosephosphate isomerase/glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase precursor  47.81 
 
 		 614 aa  228  1e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.165806  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  50.6 
 
 		 256 aa  225  7e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  48.21 
 
 		 256 aa  223  3e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  48.35 
 
 		 252 aa  218  7.999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  47.41 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  47.77 
 
 		 257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 		 253 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 249 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  48.18 
 
 		 250 aa  211  9e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  47.74 
 
 		 248 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  47.74 
 
 		 248 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0154  triosephosphate isomerase  47.83 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  45.97 
 
 		 655 aa  211  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4715  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151784  hitchhiker  0.00871946 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4716  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 		 251 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4581  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.299699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 		 252 aa  209  5e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  44.98 
 
 		 257 aa  209  5e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0169  triosephosphate isomerase  47.04 
 
 		 255 aa  209  6e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.543601  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0103  triosephosphate isomerase  47.2 
 
 		 256 aa  208  6e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0674  triosephosphate isomerase  47.13 
 
 		 250 aa  208  8e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.260735  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.06 
 
 		 646 aa  208  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3808  triosephosphate isomerase  48.35 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.102844  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0100  triosephosphate isomerase  44.94 
 
 		 249 aa  207  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0717  triosephosphate isomerase  47.56 
 
 		 251 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5468  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.50496  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  44.49 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  45.31 
 
 		 251 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 650 aa  204  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  43.44 
 
 		 252 aa  204  2e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_7124  predicted protein  45.71 
 
 		 245 aa  204  2e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000000122567  normal  0.0110543 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  45.31 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  45.31 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  46.75 
 
 		 251 aa  203  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  46.75 
 
 		 251 aa  203  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4410  triosephosphate isomerase  46.64 
 
 		 255 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4327  triosephosphate isomerase  46.64 
 
 		 255 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  47.41 
 
 		 251 aa  203  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4297  triosephosphate isomerase  46.64 
 
 		 255 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4412  triosephosphate isomerase  46.64 
 
 		 255 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0292909  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03804  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 		 255 aa  202  4e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4066  Triose-phosphate isomerase  46.4 
 
 		 255 aa  202  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3448  triosephosphate isomerase  43.31 
 
 		 256 aa  202  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5374  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 		 255 aa  202  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03753  hypothetical protein  46.4 
 
 		 255 aa  202  4e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4480  triosephosphate isomerase  46.64 
 
 		 255 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4150  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 		 255 aa  202  4e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4099  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 		 255 aa  202  4e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4399  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 		 255 aa  202  4e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  47.41 
 
 		 250 aa  202  4e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4359  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 		 255 aa  202  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.626096 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4453  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 		 255 aa  202  4e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1264  Triose-phosphate isomerase  49.1 
 
 		 240 aa  202  4e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  44.26 
 
 		 253 aa  202  5e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3612  triosephosphate isomerase  46.34 
 
 		 251 aa  202  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  45.27 
 
 		 248 aa  202  6e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  45.31 
 
 		 251 aa  201  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  49 
 
 		 251 aa  201  9e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2168  triosephosphate isomerase  44.9 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00524142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0775  triosephosphate isomerase  46.75 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354266  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  46.38 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2289  triosephosphate isomerase  44.9 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785898  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62830  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  45.9 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  44.8 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1549  triosephosphate isomerase  42 
 
 		 252 aa  199  3e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.42091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  43.37 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  46.59 
 
 		 253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  46.56 
 
 		 253 aa  199  5e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2831  triosephosphate isomerase  42.46 
 
 		 260 aa  199  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000042953  hitchhiker  0.00389109 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1591  triosephosphate isomerase  45.12 
 
 		 255 aa  199  6e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4052  triosephosphate isomerase  45.49 
 
 		 255 aa  198  7e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1574  triosephosphate isomerase  45.53 
 
 		 249 aa  198  7e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0183532  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  45.53 
 
 		 254 aa  198  7.999999999999999e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  47.13 
 
 		 251 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  45.63 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4805  triosephosphate isomerase  46.69 
 
 		 255 aa  198  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000667098 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1236  triosephosphate isomerase  43.03 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000124491  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4494  triosephosphate isomerase  45.53 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.321001  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  44.49 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  45.9 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3565  triosephosphate isomerase  41.67 
 
 		 260 aa  196  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.147919  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1026  triosephosphate isomerase  46.12 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00133267  normal  0.306303 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  45.08 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0096  triosephosphate isomerase  46.12 
 
 		 255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  48.59 
 
 		 253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0095  triosephosphate isomerase  46.12 
 
 		 255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13483  triosephosphate isomerase  40.08 
 
 		 250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.943567  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4118  triosephosphate isomerase  46.12 
 
 		 255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3504  triosephosphate isomerase  43.15 
 
 		 250 aa  196  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.449389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>