136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0707 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0707  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 		 362 aa  719    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.886561  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4517  hypothetical protein  24.54 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3316  Mammalian cell entry related domain protein  28.43 
 
 		 266 aa  99.8  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635964  hitchhiker  0.0000217652 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  25.07 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0795  Mammalian cell entry related domain protein  23.62 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2541  virulence factor MCE-like protein-related protein  28.01 
 
 		 360 aa  90.5  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143277  hitchhiker  0.00000000000784881 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3214  hypothetical protein  27.24 
 
 		 360 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4316  hypothetical protein  24.74 
 
 		 279 aa  89  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209742  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0926  mce-related protein  27.94 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1243  hypothetical protein  29.39 
 
 		 360 aa  87  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1810  Mammalian cell entry related domain protein  27.45 
 
 		 341 aa  86.7  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  24.71 
 
 		 430 aa  86.3  7e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2984  ABC transporter, permease component  23.42 
 
 		 325 aa  79.3  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4901  Mammalian cell entry related domain protein  24.32 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.374077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0495  Mammalian cell entry related domain protein  25 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  25.45 
 
 		 349 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  24.32 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0478  VpsC protein  23.94 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.238955  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5281  Mammalian cell entry related domain protein  23.1 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.192594 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3636  Mammalian cell entry related domain protein  22.79 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.676726 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0384  Mammalian cell entry related domain protein  35.2 
 
 		 152 aa  63.9  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.214826 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1867  Mammalian cell entry related domain protein  23.84 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.449047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0687  hypothetical protein  23.2 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0440  VpsC protein  22.22 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1508  Mammalian cell entry related domain protein  24.75 
 
 		 356 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.577537 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1007  Mammalian cell entry related domain protein  31.9 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.063355  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3183  Mammalian cell entry related domain protein  32.46 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2118  hypothetical protein  37.8 
 
 		 151 aa  58.9  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0751  ABC transporter permease  26.57 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2733  Mammalian cell entry related domain protein  23.26 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0339  Mammalian cell entry related domain protein  35.24 
 
 		 152 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.620596 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0160  mce-related protein  35.24 
 
 		 152 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002411  uncharacterized ABC transporter, periplasmic component YrbD  33.04 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1696  Mammalian cell entry related domain protein  22.54 
 
 		 293 aa  57  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2254  Mammalian cell entry related domain protein  23.59 
 
 		 292 aa  57  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.371924  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1898  putative ABC transporter substrate-binding protein  36.45 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3307  Mammalian cell entry related domain protein  22.52 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185146  normal  0.246163 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0239  hypothetical protein  35.51 
 
 		 164 aa  55.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.852395 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0854  Mammalian cell entry related domain protein  34.59 
 
 		 148 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.102404 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0739  Mammalian cell entry related domain protein  32 
 
 		 152 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.942465  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1899  virulence factor Mce family protein  22.59 
 
 		 349 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0449  ABC-type transport system protein  28.45 
 
 		 148 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.58514e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1272  virulence factor MCE-like protein-related protein  25.08 
 
 		 347 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.821992  hitchhiker  0.0000000117847 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2218  hypothetical protein  36.43 
 
 		 154 aa  55.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03656  hypothetical protein  32.17 
 
 		 165 aa  55.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1750  hypothetical protein  30 
 
 		 178 aa  54.3  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5534  hypothetical protein  35.2 
 
 		 161 aa  53.9  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.264569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3120  hypothetical protein  34.26 
 
 		 173 aa  53.9  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771354  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0560  hypothetical protein  26.98 
 
 		 148 aa  53.9  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000625618  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2597  Mammalian cell entry related domain protein  21.72 
 
 		 259 aa  53.5  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.144498  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0638  hypothetical protein  22.71 
 
 		 306 aa  53.5  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.498696 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2707  hypothetical protein  34.55 
 
 		 149 aa  53.5  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1041  hypothetical protein  29.82 
 
 		 150 aa  53.5  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2368  hypothetical protein  28.95 
 
 		 316 aa  52.8  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.709282  normal  0.77833 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11078  hypothetical protein  21.94 
 
 		 316 aa  53.1  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2784  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component  30.34 
 
 		 155 aa  52.8  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162084  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0021  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component-like  33.64 
 
 		 313 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.577639  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3945  virulence factor Mce family protein  26.36 
 
 		 476 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4584  hypothetical protein  21.74 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  33.02 
 
 		 308 aa  52.4  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.02 
 
 		 308 aa  52.4  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  24.35 
 
 		 529 aa  52.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0661  hypothetical protein  20.83 
 
 		 292 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6192  Mammalian cell entry related domain protein  22.93 
 
 		 332 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2960  signal peptide protein  34.82 
 
 		 173 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3825  virulence factor Mce family protein  28.5 
 
 		 344 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2747  hypothetical protein  31.2 
 
 		 161 aa  50.4  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1739  Mammalian cell entry related domain protein  21.99 
 
 		 292 aa  50.4  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2344  Mammalian cell entry related domain protein  26.19 
 
 		 314 aa  50.1  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1049  hypothetical protein  23.1 
 
 		 292 aa  50.1  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460957 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0403  hypothetical protein  29.46 
 
 		 146 aa  50.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3569  Mammalian cell entry related domain protein  31.45 
 
 		 186 aa  50.1  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424468  hitchhiker  0.0000173433 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2937  hypothetical protein  32.26 
 
 		 162 aa  49.7  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.887715  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2066  Mammalian cell entry related domain protein  21.78 
 
 		 388 aa  49.7  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2113  Mammalian cell entry related domain protein  32.95 
 
 		 316 aa  49.7  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202192  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0718  Mammalian cell entry related domain protein  32 
 
 		 161 aa  49.7  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.57 
 
 		 275 aa  49.7  0.00008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  28.24 
 
 		 148 aa  49.7  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1132  virulence factor Mce family protein  26.97 
 
 		 379 aa  49.7  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1894  hypothetical protein  21.98 
 
 		 324 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276188  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1873  Mammalian cell entry related domain protein  21.2 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0534  Mammalian cell entry related domain protein  30 
 
 		 150 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3257  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0761  Mammalian cell entry related domain protein  28.46 
 
 		 145 aa  48.5  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0750  hypothetical protein  32.26 
 
 		 161 aa  48.5  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1156  Mammalian cell entry related domain protein  34.29 
 
 		 163 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482142  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2768  hypothetical protein  33.06 
 
 		 184 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1655  putative ABC transporter  22.63 
 
 		 281 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0530  Mammalian cell entry related domain protein  34.86 
 
 		 465 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794795  hitchhiker  0.00420823 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0389  putative signal peptide protein, toluene tolerance Ttg2C-like  30.65 
 
 		 181 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0513  Mammalian cell entry related domain protein  34.86 
 
 		 465 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1818  toluene tolerance protein  29.2 
 
 		 178 aa  47  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3238  Mammalian cell entry related domain protein  33.33 
 
 		 175 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0786  virulence factor MCE-like protein-related protein  26.5 
 
 		 150 aa  46.6  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1171  hypothetical protein  31.86 
 
 		 168 aa  47  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2891  Mammalian cell entry related domain protein  33.33 
 
 		 175 aa  47  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  35 
 
 		 310 aa  46.6  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  25.99 
 
 		 308 aa  46.6  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0474  hypothetical protein  30.84 
 
 		 164 aa  46.2  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000014845  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3948  virulence factor Mce family protein  27.82 
 
 		 405 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>