252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0687 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0687  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  667    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1272  virulence factor MCE-like protein-related protein  30.77 
 
 
347 aa  177  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.821992  hitchhiker  0.0000000117847 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1899  virulence factor Mce family protein  30.99 
 
 
349 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1508  Mammalian cell entry related domain protein  29.64 
 
 
356 aa  169  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.577537 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  29.05 
 
 
349 aa  166  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2733  Mammalian cell entry related domain protein  28.75 
 
 
356 aa  151  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  28.78 
 
 
529 aa  112  6e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4517  hypothetical protein  23.23 
 
 
359 aa  89.7  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0795  Mammalian cell entry related domain protein  26.21 
 
 
328 aa  88.2  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  24.83 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0534  Mammalian cell entry related domain protein  38.36 
 
 
150 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  26.67 
 
 
515 aa  80.1  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5281  Mammalian cell entry related domain protein  25.09 
 
 
340 aa  79.7  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.192594 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0926  mce-related protein  24.2 
 
 
360 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  24.91 
 
 
430 aa  76.6  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2541  virulence factor MCE-like protein-related protein  22.61 
 
 
360 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143277  hitchhiker  0.00000000000784881 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2118  hypothetical protein  38.58 
 
 
151 aa  75.1  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0838  virulence factor Mce family protein  25.38 
 
 
523 aa  73.9  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1818  hypothetical protein  35.42 
 
 
148 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  33.57 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1243  hypothetical protein  24.15 
 
 
360 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1810  Mammalian cell entry related domain protein  27.48 
 
 
341 aa  69.7  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3214  hypothetical protein  24.12 
 
 
360 aa  69.3  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0449  ABC-type transport system protein  36.8 
 
 
148 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.58514e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0171  hypothetical protein  40.21 
 
 
166 aa  67.8  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0854  Mammalian cell entry related domain protein  35.42 
 
 
148 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.102404 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0495  Mammalian cell entry related domain protein  24.64 
 
 
360 aa  67  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1041  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0815  mce-related protein  33.58 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3702  hypothetical protein  29.63 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1007  Mammalian cell entry related domain protein  32.43 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.063355  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1888  Mammalian cell entry related domain protein  24.5 
 
 
529 aa  65.9  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3022  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component-like protein  29.52 
 
 
355 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1049  hypothetical protein  23.64 
 
 
292 aa  65.1  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460957 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0384  Mammalian cell entry related domain protein  34.65 
 
 
152 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.214826 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2344  Mammalian cell entry related domain protein  21.41 
 
 
314 aa  64.7  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1391  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  64.3  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230903  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2984  ABC transporter, permease component  22.45 
 
 
325 aa  64.3  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395413  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1268  hypothetical protein  43.48 
 
 
155 aa  63.9  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0707  Mammalian cell entry related domain protein  23.2 
 
 
362 aa  63.9  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.886561  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3296  hypothetical protein  33.98 
 
 
164 aa  63.9  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  25.77 
 
 
312 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0560  hypothetical protein  34.04 
 
 
148 aa  63.9  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000625618  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3183  Mammalian cell entry related domain protein  34.03 
 
 
150 aa  63.9  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09350  virulence factor Mce family protein  26.71 
 
 
336 aa  63.5  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.960251 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0739  Mammalian cell entry related domain protein  34.56 
 
 
152 aa  62.8  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.942465  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11998  MCE-family protein mce3B  24.9 
 
 
342 aa  62  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000434194  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4535  virulence factor Mce family protein  27.27 
 
 
487 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00220219  normal  0.295822 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1521  hypothetical protein  40.86 
 
 
150 aa  62.4  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.661029  normal  0.423884 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1110  Mammalian cell entry related domain protein  37.23 
 
 
196 aa  62.4  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820134  normal  0.240411 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0474  hypothetical protein  36.3 
 
 
164 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000014845  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0339  Mammalian cell entry related domain protein  34.88 
 
 
152 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.620596 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1330  hypothetical protein  34.17 
 
 
168 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.519307  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0160  mce-related protein  34.88 
 
 
152 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2221  hypothetical protein  33.07 
 
 
153 aa  61.6  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.693824  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  26.06 
 
 
312 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1867  Mammalian cell entry related domain protein  22.42 
 
 
316 aa  60.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.449047  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1576  hypothetical protein  31.78 
 
 
172 aa  60.5  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.667817  normal  0.289363 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0009  virulence factor Mce family protein  28.57 
 
 
351 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629178  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3316  Mammalian cell entry related domain protein  23.58 
 
 
266 aa  60.1  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635964  hitchhiker  0.0000217652 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2002  hypothetical protein  27.98 
 
 
316 aa  60.1  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1898  putative ABC transporter substrate-binding protein  31.41 
 
 
155 aa  59.7  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0786  virulence factor MCE-like protein-related protein  31.88 
 
 
150 aa  59.7  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  30.08 
 
 
579 aa  59.7  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1451  hypothetical protein  32.61 
 
 
156 aa  59.7  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.813641  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0761  Mammalian cell entry related domain protein  33.6 
 
 
145 aa  58.9  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2747  hypothetical protein  34.07 
 
 
161 aa  57.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03730  virulence factor Mce family protein  34.19 
 
 
343 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.918695  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3566  hypothetical protein  25 
 
 
312 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46814  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4316  hypothetical protein  27.32 
 
 
279 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209742  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0960  virulence factor Mce family protein  30.25 
 
 
351 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2854  virulence factor Mce family protein  26.13 
 
 
491 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370612  normal  0.383005 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0890  Mammalian cell entry related domain protein  33.59 
 
 
156 aa  58.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1169  virulence factor Mce family protein  31.84 
 
 
356 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03760  virulence factor Mce family protein  24.62 
 
 
398 aa  57.4  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.704534  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2254  Mammalian cell entry related domain protein  25.52 
 
 
292 aa  57.4  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.371924  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1696  Mammalian cell entry related domain protein  22.36 
 
 
293 aa  57  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2411  hypothetical protein  28.99 
 
 
154 aa  56.6  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108225  normal  0.153742 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2784  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component  33.07 
 
 
155 aa  56.6  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162084  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2597  Mammalian cell entry related domain protein  21.93 
 
 
259 aa  56.6  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.144498  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1015  hypothetical protein  31.03 
 
 
321 aa  56.6  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  25.62 
 
 
308 aa  56.2  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3827  virulence factor Mce family protein  23.77 
 
 
364 aa  56.2  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.62 
 
 
308 aa  56.2  0.0000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0893  hypothetical protein  25.12 
 
 
360 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.932259  normal  0.840241 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  26.51 
 
 
305 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0194  ABC transporter substrate-binding protein  34.55 
 
 
156 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.176856  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0853  Mammalian cell entry related domain protein  25.08 
 
 
360 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.0740756 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4603  virulence factor Mce family protein  27.98 
 
 
346 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2707  hypothetical protein  34.26 
 
 
149 aa  55.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1827  hypothetical protein  39.24 
 
 
156 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.607055 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0905  hypothetical protein  37.3 
 
 
158 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0874  hypothetical protein  37.3 
 
 
158 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2218  hypothetical protein  32.81 
 
 
154 aa  54.7  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0475  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  28.48 
 
 
304 aa  54.7  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.848355  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1750  hypothetical protein  34.65 
 
 
178 aa  54.7  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2399  hypothetical protein  28.89 
 
 
156 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1818  toluene tolerance protein  36.56 
 
 
178 aa  53.9  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2554  hypothetical protein  30.22 
 
 
164 aa  54.3  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1873  Mammalian cell entry related domain protein  23.51 
 
 
293 aa  53.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.010294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>