166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0795 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0795  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 
328 aa  654    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1810  Mammalian cell entry related domain protein  50.78 
 
 
341 aa  328  6e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5281  Mammalian cell entry related domain protein  44.97 
 
 
340 aa  297  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.192594 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  42.33 
 
 
337 aa  293  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2984  ABC transporter, permease component  44.9 
 
 
325 aa  291  9e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395413  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4316  hypothetical protein  32 
 
 
279 aa  119  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3316  Mammalian cell entry related domain protein  30.93 
 
 
266 aa  112  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635964  hitchhiker  0.0000217652 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0707  Mammalian cell entry related domain protein  23.51 
 
 
362 aa  98.2  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.886561  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3214  hypothetical protein  25.16 
 
 
360 aa  91.3  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1243  hypothetical protein  25.67 
 
 
360 aa  90.1  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2541  virulence factor MCE-like protein-related protein  23.18 
 
 
360 aa  89.7  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143277  hitchhiker  0.00000000000784881 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0687  hypothetical protein  26.21 
 
 
332 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0926  mce-related protein  23.44 
 
 
360 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2254  Mammalian cell entry related domain protein  28.52 
 
 
292 aa  83.6  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.371924  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0495  Mammalian cell entry related domain protein  23.91 
 
 
360 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  24.17 
 
 
333 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0661  hypothetical protein  25.84 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1739  Mammalian cell entry related domain protein  27.12 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0478  VpsC protein  27.15 
 
 
292 aa  79.3  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.238955  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1873  Mammalian cell entry related domain protein  24.05 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  23.31 
 
 
529 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1508  Mammalian cell entry related domain protein  25.08 
 
 
356 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.577537 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0031  hypothetical protein  22.03 
 
 
305 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.929118  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1696  Mammalian cell entry related domain protein  23.29 
 
 
293 aa  76.6  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6192  Mammalian cell entry related domain protein  24.63 
 
 
332 aa  76.3  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  25.08 
 
 
349 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  23.19 
 
 
430 aa  75.9  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1272  virulence factor MCE-like protein-related protein  24.68 
 
 
347 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.821992  hitchhiker  0.0000000117847 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0440  VpsC protein  27.5 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1899  virulence factor Mce family protein  24.69 
 
 
349 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  23.29 
 
 
579 aa  67.4  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2344  hypothetical protein  35 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043368 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  25.48 
 
 
515 aa  63.5  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4901  Mammalian cell entry related domain protein  26.33 
 
 
328 aa  63.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.374077  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2733  Mammalian cell entry related domain protein  21.81 
 
 
356 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  28.37 
 
 
148 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4517  hypothetical protein  20.63 
 
 
359 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1625  Mammalian cell entry related domain protein  28.22 
 
 
559 aa  59.7  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.164573 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1894  hypothetical protein  20.95 
 
 
324 aa  59.7  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276188  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2218  hypothetical protein  31.5 
 
 
154 aa  59.3  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0854  Mammalian cell entry related domain protein  32.48 
 
 
148 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.102404 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1007  Mammalian cell entry related domain protein  32.77 
 
 
152 aa  58.9  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.063355  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  20.33 
 
 
433 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0449  ABC-type transport system protein  30.63 
 
 
148 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.58514e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  23.23 
 
 
308 aa  57.4  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  24.29 
 
 
307 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0384  Mammalian cell entry related domain protein  29.17 
 
 
152 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.214826 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  24.32 
 
 
321 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  23.03 
 
 
308 aa  57  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0739  Mammalian cell entry related domain protein  29.05 
 
 
152 aa  55.8  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.942465  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2784  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component  30.07 
 
 
155 aa  54.7  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162084  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0403  hypothetical protein  29.66 
 
 
146 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304841  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0534  Mammalian cell entry related domain protein  31.3 
 
 
150 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  23.99 
 
 
321 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0905  hypothetical protein  34.34 
 
 
158 aa  53.9  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0874  hypothetical protein  34.34 
 
 
158 aa  53.9  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0981  hypothetical protein  29.17 
 
 
158 aa  53.5  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3702  hypothetical protein  26.57 
 
 
149 aa  53.5  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  22.9 
 
 
321 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3183  Mammalian cell entry related domain protein  27.46 
 
 
150 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1818  hypothetical protein  31.39 
 
 
148 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1049  hypothetical protein  20.86 
 
 
292 aa  51.6  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460957 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0815  mce-related protein  22.3 
 
 
149 aa  50.8  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2159  virulence factor Mce family protein  20.15 
 
 
321 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0878447  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0514  virulence factor Mce family protein  32.35 
 
 
340 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0137  virulence factor Mce family protein  24.91 
 
 
544 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0751  ABC transporter permease  24.12 
 
 
308 aa  50.4  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221313  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3636  Mammalian cell entry related domain protein  21.65 
 
 
321 aa  50.1  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.676726 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1867  Mammalian cell entry related domain protein  23.71 
 
 
316 aa  49.7  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.449047  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  23.4 
 
 
313 aa  49.7  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0516  virulence factor Mce family protein  26.05 
 
 
345 aa  49.7  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5201  virulence factor Mce family protein  21.38 
 
 
341 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.922675  normal  0.183603 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2511  virulence factor Mce family protein  29.27 
 
 
503 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.309476 
 
 
-
 
NC_004310  BR1021  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  21.77 
 
 
331 aa  48.5  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2118  hypothetical protein  30.71 
 
 
151 aa  48.5  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0098  hypothetical protein  28.97 
 
 
160 aa  48.5  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.334829  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  22.29 
 
 
308 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1888  Mammalian cell entry related domain protein  20.89 
 
 
529 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0560  hypothetical protein  25.87 
 
 
148 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000625618  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1638  hypothetical protein  23.02 
 
 
317 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  20.42 
 
 
312 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2707  hypothetical protein  32.46 
 
 
149 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2411  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  47.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108225  normal  0.153742 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  24.37 
 
 
312 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0838  virulence factor Mce family protein  22.09 
 
 
523 aa  47  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1506  virulence factor Mce family protein  22.53 
 
 
339 aa  47  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  21.88 
 
 
312 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1454  hypothetical protein  27.03 
 
 
289 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0474733  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0474  hypothetical protein  31.82 
 
 
164 aa  47  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000014845  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4603  virulence factor Mce family protein  25.56 
 
 
346 aa  47  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1041  hypothetical protein  27.19 
 
 
150 aa  46.6  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  23.05 
 
 
308 aa  46.6  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1854  Mammalian cell entry related domain protein  23.64 
 
 
318 aa  46.6  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000329704  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1954  hypothetical protein  25.12 
 
 
360 aa  47  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104433  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.05 
 
 
308 aa  46.6  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  26.05 
 
 
312 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1557  virulence factor Mce family protein  20.12 
 
 
343 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1629  hypothetical protein  23.02 
 
 
291 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.232196 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3390  Mammalian cell entry related domain protein  21.34 
 
 
317 aa  46.2  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0881876 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2438  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  46.2  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.284994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>