141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4901 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4901  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 
328 aa  651    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.374077  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3636  Mammalian cell entry related domain protein  52.34 
 
 
321 aa  338  7e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.676726 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0751  ABC transporter permease  38.38 
 
 
308 aa  195  8.000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221313  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4584  hypothetical protein  33.03 
 
 
321 aa  166  5.9999999999999996e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6192  Mammalian cell entry related domain protein  31.44 
 
 
332 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1867  Mammalian cell entry related domain protein  31.86 
 
 
316 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.449047  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0638  hypothetical protein  30.26 
 
 
306 aa  155  1e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.498696 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11078  hypothetical protein  26.79 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1049  hypothetical protein  28.34 
 
 
292 aa  119  6e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460957 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2113  Mammalian cell entry related domain protein  29.38 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202192  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1873  Mammalian cell entry related domain protein  29.55 
 
 
293 aa  106  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2344  Mammalian cell entry related domain protein  28.48 
 
 
314 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1508  Mammalian cell entry related domain protein  28.19 
 
 
356 aa  102  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.577537 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1696  Mammalian cell entry related domain protein  27.97 
 
 
293 aa  101  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0478  VpsC protein  27.51 
 
 
292 aa  94.4  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.238955  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2733  Mammalian cell entry related domain protein  27.52 
 
 
356 aa  93.2  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  25.76 
 
 
349 aa  89.7  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1739  Mammalian cell entry related domain protein  25.08 
 
 
292 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0661  hypothetical protein  27.42 
 
 
292 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0440  VpsC protein  27.09 
 
 
292 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  25 
 
 
529 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2254  Mammalian cell entry related domain protein  27.39 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.371924  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0838  virulence factor Mce family protein  24.41 
 
 
523 aa  82.8  0.000000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0926  mce-related protein  26.82 
 
 
360 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2541  virulence factor MCE-like protein-related protein  24.86 
 
 
360 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143277  hitchhiker  0.00000000000784881 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1899  virulence factor Mce family protein  24.78 
 
 
349 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0707  Mammalian cell entry related domain protein  24.32 
 
 
362 aa  73.9  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.886561  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  26.84 
 
 
333 aa  73.6  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1272  virulence factor MCE-like protein-related protein  22.53 
 
 
347 aa  72  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.821992  hitchhiker  0.0000000117847 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  25.5 
 
 
430 aa  70.1  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  26.44 
 
 
337 aa  69.7  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4517  hypothetical protein  24.15 
 
 
359 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3214  hypothetical protein  23.25 
 
 
360 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1243  hypothetical protein  22.79 
 
 
360 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  23.65 
 
 
308 aa  65.5  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.65 
 
 
308 aa  65.5  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3316  Mammalian cell entry related domain protein  26.78 
 
 
266 aa  63.5  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635964  hitchhiker  0.0000217652 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  26.52 
 
 
308 aa  62  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4603  virulence factor Mce family protein  26.42 
 
 
346 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2843  hypothetical protein  28.78 
 
 
319 aa  60.5  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4169  virulence factor Mce family protein  28.02 
 
 
342 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  22.67 
 
 
321 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0795  Mammalian cell entry related domain protein  25.79 
 
 
328 aa  59.7  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2102  virulence factor Mce family protein  25.26 
 
 
343 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0525635  normal  0.778813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3981  virulence factor Mce family protein  25.7 
 
 
342 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  21.94 
 
 
302 aa  57.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4398  virulence factor Mce family protein  25.54 
 
 
342 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  23.99 
 
 
307 aa  56.6  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  23.99 
 
 
307 aa  56.6  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4187  virulence factor Mce family protein  26.57 
 
 
342 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.39714  normal  0.700299 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  23.37 
 
 
515 aa  56.2  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0495  Mammalian cell entry related domain protein  25.45 
 
 
360 aa  54.3  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  25 
 
 
312 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0364  virulence factor Mce family protein  25.32 
 
 
342 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  25.56 
 
 
310 aa  53.5  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  24.41 
 
 
312 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2109  hypothetical protein  24.53 
 
 
331 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0704  virulence factor Mce family protein  25.63 
 
 
348 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1841  hypothetical protein  24.53 
 
 
313 aa  51.6  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2910  hypothetical protein  26.99 
 
 
317 aa  50.8  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1655  virulence factor MCE-like protein  22.73 
 
 
342 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1679  virulence factor Mce family protein  22.73 
 
 
342 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.859349  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1628  virulence factor Mce family protein  22.73 
 
 
342 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0651  virulence factor Mce family protein  22.73 
 
 
342 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228257  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13531  MCE-family protein mce4C  26.24 
 
 
357 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185056 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0501  virulence factor Mce family protein  22.36 
 
 
278 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298085  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  24.78 
 
 
308 aa  50.4  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  24.78 
 
 
308 aa  50.4  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4161  virulence factor Mce family protein  21.62 
 
 
341 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2438  hypothetical protein  32.32 
 
 
151 aa  49.7  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.284994  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2744  hypothetical protein  25 
 
 
315 aa  50.1  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0811657 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0161  Mammalian cell entry related domain protein  20.89 
 
 
334 aa  49.7  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2103  virulence factor Mce family protein  28.19 
 
 
453 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265097  normal  0.867723 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0479  hypothetical protein  23.51 
 
 
313 aa  48.9  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0772873  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4997  virulence factor Mce family protein  23.1 
 
 
463 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.430498 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  27.05 
 
 
579 aa  49.3  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3307  Mammalian cell entry related domain protein  23.53 
 
 
339 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185146  normal  0.246163 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0021  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component-like  23.53 
 
 
313 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.577639  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  29.27 
 
 
148 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2193  Mammalian cell entry related domain protein  28.05 
 
 
456 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141725  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5281  Mammalian cell entry related domain protein  28.79 
 
 
340 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.192594 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0924  virulence factor Mce family protein  23.68 
 
 
438 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4186  virulence factor Mce family protein  26.42 
 
 
407 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1810  Mammalian cell entry related domain protein  23.97 
 
 
341 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4168  virulence factor Mce family protein  22.77 
 
 
444 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375234  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1506  virulence factor Mce family protein  23.14 
 
 
339 aa  47.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4614  virulence factor MCE-like protein  23.66 
 
 
453 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4702  virulence factor Mce family protein  23.66 
 
 
453 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4602  virulence factor Mce family protein  25.45 
 
 
450 aa  47  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.939789  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03181  ABC transporter substrate-binding protein  23.66 
 
 
308 aa  47  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721062  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  21 
 
 
321 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1894  hypothetical protein  25.43 
 
 
324 aa  47  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276188  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1656  virulence factor MCE-like protein  26.56 
 
 
442 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.593757  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1680  virulence factor Mce family protein  26.56 
 
 
442 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0515  virulence factor Mce family protein  26.56 
 
 
442 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.72197  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  22.42 
 
 
321 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1629  virulence factor Mce family protein  26.56 
 
 
442 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4998  virulence factor Mce family protein  24.64 
 
 
352 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0650  virulence factor Mce family protein  26.56 
 
 
442 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0504991  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2823  virulence factor Mce family protein  26.83 
 
 
361 aa  46.6  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.314486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>