39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2910 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2910  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  622  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  23.24 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  23.24 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  28.96 
 
 		 529 aa  62.4  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1360  Mammalian cell entry related domain protein  26.22 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3022  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component-like protein  25.42 
 
 		 355 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3827  virulence factor Mce family protein  25.33 
 
 		 364 aa  54.3  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2744  hypothetical protein  26.36 
 
 		 315 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811657 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4901  Mammalian cell entry related domain protein  26.99 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.374077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0838  virulence factor Mce family protein  23.36 
 
 		 523 aa  50.4  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1049  hypothetical protein  20.49 
 
 		 292 aa  50.1  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460957 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  26.13 
 
 		 307 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3636  Mammalian cell entry related domain protein  24.68 
 
 		 321 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.676726 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1156  Mammalian cell entry related domain protein  32 
 
 		 163 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482142  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2221  hypothetical protein  32.09 
 
 		 153 aa  47.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.693824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0751  ABC transporter permease  25.14 
 
 		 308 aa  47.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2937  hypothetical protein  30.71 
 
 		 162 aa  47.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.887715  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2344  hypothetical protein  25.08 
 
 		 306 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043368 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2784  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component  30.08 
 
 		 155 aa  47.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162084  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  23.08 
 
 		 310 aa  47  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  23.29 
 
 		 333 aa  47  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1268  hypothetical protein  34.88 
 
 		 155 aa  46.6  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0705  virulence factor Mce family protein  21.93 
 
 		 321 aa  46.6  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  25.53 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2118  hypothetical protein  30.23 
 
 		 151 aa  45.4  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2399  hypothetical protein  30.08 
 
 		 156 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  24.04 
 
 		 579 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0795  hypothetical protein  34.11 
 
 		 168 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3702  hypothetical protein  25.38 
 
 		 149 aa  44.3  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  23.53 
 
 		 349 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0815  mce-related protein  31.5 
 
 		 149 aa  43.9  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0384  Mammalian cell entry related domain protein  33.85 
 
 		 152 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.214826 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1867  Mammalian cell entry related domain protein  20.2 
 
 		 316 aa  43.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.449047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0100  Mammalian cell entry related domain protein  21.04 
 
 		 316 aa  43.5  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09350  virulence factor Mce family protein  25.93 
 
 		 336 aa  43.1  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.960251 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0925  virulence factor Mce family protein  24.18 
 
 		 427 aa  43.1  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4186  virulence factor Mce family protein  26.24 
 
 		 407 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1810  Mammalian cell entry related domain protein  25.66 
 
 		 341 aa  42.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  23.85 
 
 		 312 aa  42.7  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>