204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0188 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 		 337 aa  668    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2984  ABC transporter, permease component  51.13 
 
 		 325 aa  323  4e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5281  Mammalian cell entry related domain protein  48.25 
 
 		 340 aa  312  4.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.192594 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1810  Mammalian cell entry related domain protein  47 
 
 		 341 aa  288  8e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0795  Mammalian cell entry related domain protein  42.95 
 
 		 328 aa  285  5e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3316  Mammalian cell entry related domain protein  31.75 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635964  hitchhiker  0.0000217652 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4316  hypothetical protein  27.63 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209742  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0707  Mammalian cell entry related domain protein  25.07 
 
 		 362 aa  95.5  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.886561  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1873  Mammalian cell entry related domain protein  27.36 
 
 		 293 aa  89  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1272  virulence factor MCE-like protein-related protein  24.15 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.821992  hitchhiker  0.0000000117847 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  24.7 
 
 		 529 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1243  hypothetical protein  30.84 
 
 		 360 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0687  hypothetical protein  24.83 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0661  hypothetical protein  27.82 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2254  Mammalian cell entry related domain protein  26.78 
 
 		 292 aa  82.4  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.371924  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3636  Mammalian cell entry related domain protein  27.69 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.676726 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1508  Mammalian cell entry related domain protein  23.12 
 
 		 356 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.577537 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0926  mce-related protein  28.51 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  22.56 
 
 		 349 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1696  Mammalian cell entry related domain protein  25.81 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3214  hypothetical protein  25.61 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0478  VpsC protein  27.18 
 
 		 292 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.238955  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1739  Mammalian cell entry related domain protein  26.71 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1899  virulence factor Mce family protein  23.72 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0495  Mammalian cell entry related domain protein  24.91 
 
 		 360 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4901  Mammalian cell entry related domain protein  26.44 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.374077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4517  hypothetical protein  24.62 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  27.1 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2541  virulence factor MCE-like protein-related protein  27.31 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143277  hitchhiker  0.00000000000784881 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2733  Mammalian cell entry related domain protein  21.97 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1217  Mammalian cell entry related domain protein  21.88 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2591  hypothetical protein  21.88 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703679  normal  0.200982 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0031  hypothetical protein  23.78 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.929118  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  20.06 
 
 		 333 aa  65.9  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1818  hypothetical protein  21.92 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0011  hypothetical protein  22.61 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000604844 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0440  VpsC protein  23.98 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  24.61 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2918  hypothetical protein  21.4 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.184503  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  23.58 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  25.16 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  23.2 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3238  Mammalian cell entry related domain protein  37.17 
 
 		 175 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1790  hypothetical protein  24.11 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0502683 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0334  hypothetical protein  34.95 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2691  hypothetical protein  35.92 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0995365  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0395  hypothetical protein  35.92 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2891  Mammalian cell entry related domain protein  36.79 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0416  hypothetical protein  35.92 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249405  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  23.28 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  24.55 
 
 		 579 aa  60.8  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  22.9 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0343  hypothetical protein  34.95 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.908048  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3514  ABC transporter, inner membrane subunit  35.92 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.531635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0161  Mammalian cell entry related domain protein  24.54 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3120  hypothetical protein  35.58 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771354  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  25.71 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0553  hypothetical protein  23.19 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2960  signal peptide protein  33.65 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  35.25 
 
 		 515 aa  59.3  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3569  Mammalian cell entry related domain protein  34.95 
 
 		 186 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424468  hitchhiker  0.0000173433 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1898  putative ABC transporter substrate-binding protein  37.86 
 
 		 155 aa  57.8  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0384  Mammalian cell entry related domain protein  30.89 
 
 		 152 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.214826 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0838  virulence factor Mce family protein  25.71 
 
 		 523 aa  57.8  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2768  hypothetical protein  33.01 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1007  Mammalian cell entry related domain protein  30.97 
 
 		 152 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.063355  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0389  putative signal peptide protein, toluene tolerance Ttg2C-like  33.98 
 
 		 181 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  25 
 
 		 308 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1894  hypothetical protein  26.57 
 
 		 324 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276188  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0854  Mammalian cell entry related domain protein  31.79 
 
 		 148 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.102404 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  31.25 
 
 		 148 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0534  Mammalian cell entry related domain protein  30.23 
 
 		 150 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2113  Mammalian cell entry related domain protein  28.66 
 
 		 316 aa  54.3  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202192  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  27.42 
 
 		 305 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1529  virulence factor MCE-like protein  23.08 
 
 		 479 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1552  virulence factor Mce family protein  23.08 
 
 		 479 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.977582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6192  Mammalian cell entry related domain protein  24.42 
 
 		 332 aa  53.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1041  hypothetical protein  36.52 
 
 		 150 aa  53.5  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  24.29 
 
 		 312 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1454  hypothetical protein  26.09 
 
 		 289 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0474733  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2724  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.89 
 
 		 184 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3702  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.89 
 
 		 188 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  24.29 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3702  hypothetical protein  31.34 
 
 		 149 aa  52  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3183  Mammalian cell entry related domain protein  36.28 
 
 		 150 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5534  hypothetical protein  30.47 
 
 		 161 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.264569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.89 
 
 		 186 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42671  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1779  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.89 
 
 		 186 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3675  mce family protein  36.89 
 
 		 189 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.090883  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3733  mce family protein  36.89 
 
 		 186 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2774  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.89 
 
 		 186 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1854  Mammalian cell entry related domain protein  24.48 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000329704  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4616  virulence factor MCE-like protein  25.21 
 
 		 344 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.978929  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0560  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000625618  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3037  Mammalian cell entry related domain protein  34.78 
 
 		 479 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4704  virulence factor Mce family protein  25.21 
 
 		 344 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  25.5 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0319  hypothetical protein  34.04 
 
 		 187 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0287402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2399  hypothetical protein  28.21 
 
 		 156 aa  51.2  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0097  Mammalian cell entry related domain protein  30.99 
 
 		 160 aa  50.8  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000148019  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>