236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3705 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  687    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1508  Mammalian cell entry related domain protein  70.22 
 
 
356 aa  508  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.577537 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1272  virulence factor MCE-like protein-related protein  68.01 
 
 
347 aa  502  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.821992  hitchhiker  0.0000000117847 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1899  virulence factor Mce family protein  67.62 
 
 
349 aa  495  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2733  Mammalian cell entry related domain protein  69.1 
 
 
356 aa  478  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0687  hypothetical protein  27.12 
 
 
332 aa  144  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4517  hypothetical protein  26.69 
 
 
359 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  25.7 
 
 
529 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3214  hypothetical protein  27.22 
 
 
360 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2541  virulence factor MCE-like protein-related protein  27.83 
 
 
360 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143277  hitchhiker  0.00000000000784881 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1243  hypothetical protein  26.15 
 
 
360 aa  98.6  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0926  mce-related protein  26.77 
 
 
360 aa  98.2  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0838  virulence factor Mce family protein  25.21 
 
 
523 aa  97.8  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0495  Mammalian cell entry related domain protein  24.58 
 
 
360 aa  95.5  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4901  Mammalian cell entry related domain protein  25.76 
 
 
328 aa  89.7  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.374077  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  23.77 
 
 
515 aa  84.3  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  26.47 
 
 
430 aa  82  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3636  Mammalian cell entry related domain protein  25.85 
 
 
321 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.676726 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1867  Mammalian cell entry related domain protein  25.08 
 
 
316 aa  80.1  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.449047  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5281  Mammalian cell entry related domain protein  23.99 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.192594 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6192  Mammalian cell entry related domain protein  26.45 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  22.56 
 
 
337 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0795  Mammalian cell entry related domain protein  25.08 
 
 
328 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  27.57 
 
 
579 aa  75.1  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2113  Mammalian cell entry related domain protein  27.74 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202192  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1873  Mammalian cell entry related domain protein  24.46 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0707  Mammalian cell entry related domain protein  25.45 
 
 
362 aa  69.3  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.886561  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2985  virulence factor Mce family protein  33.06 
 
 
344 aa  68.9  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0661  hypothetical protein  23.23 
 
 
292 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  25.54 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09350  virulence factor Mce family protein  23.86 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.960251 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1696  Mammalian cell entry related domain protein  22.48 
 
 
293 aa  67  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2254  Mammalian cell entry related domain protein  28.52 
 
 
292 aa  67  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.371924  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  25.46 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  25 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  27.39 
 
 
308 aa  65.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3316  Mammalian cell entry related domain protein  26.55 
 
 
266 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635964  hitchhiker  0.0000217652 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  29.32 
 
 
296 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  25.12 
 
 
333 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1639  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  30.43 
 
 
296 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1739  Mammalian cell entry related domain protein  23.57 
 
 
292 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0009  virulence factor Mce family protein  31.86 
 
 
351 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629178  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10601  MCE-family protein mce2B  33.61 
 
 
275 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4584  hypothetical protein  25.72 
 
 
321 aa  63.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0710  virulence factor Mce family protein  23.53 
 
 
343 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.476442  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  24.6 
 
 
312 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0403  hypothetical protein  30.82 
 
 
146 aa  63.2  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304841  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0364  virulence factor Mce family protein  24.83 
 
 
342 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3827  virulence factor Mce family protein  27.07 
 
 
364 aa  63.2  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11078  hypothetical protein  23.66 
 
 
316 aa  62  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2984  ABC transporter, permease component  22.08 
 
 
325 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395413  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0960  virulence factor Mce family protein  27.47 
 
 
351 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2008  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  28.92 
 
 
296 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  25.15 
 
 
312 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0517  virulence factor Mce family protein  22.75 
 
 
355 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2344  Mammalian cell entry related domain protein  23.9 
 
 
314 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0440  VpsC protein  29.55 
 
 
292 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3681  virulence factor Mce family protein  26.96 
 
 
494 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.18631  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0135  virulence factor Mce family protein  22.55 
 
 
343 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4997  virulence factor Mce family protein  23.23 
 
 
463 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.430498 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1810  Mammalian cell entry related domain protein  21.52 
 
 
341 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1557  virulence factor Mce family protein  34.75 
 
 
343 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0119  virulence factor MCE-like protein  22.22 
 
 
343 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.410781  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4614  virulence factor MCE-like protein  23.23 
 
 
453 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  24.2 
 
 
433 aa  60.8  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0128  virulence factor Mce family protein  22.22 
 
 
343 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284372  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4702  virulence factor Mce family protein  23.23 
 
 
453 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0109  virulence factor Mce family protein  22.22 
 
 
343 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.971857  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4603  virulence factor Mce family protein  25.54 
 
 
346 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2102  virulence factor Mce family protein  22.83 
 
 
343 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0525635  normal  0.778813 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3668  virulence factor MCE-like protein  26.64 
 
 
494 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3741  virulence factor Mce family protein  26.64 
 
 
494 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0478  VpsC protein  22.34 
 
 
292 aa  59.7  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.238955  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.63 
 
 
308 aa  59.7  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  27.63 
 
 
308 aa  59.7  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4169  virulence factor Mce family protein  26.95 
 
 
342 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1629  virulence factor Mce family protein  23.11 
 
 
442 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0650  virulence factor Mce family protein  23.11 
 
 
442 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0504991  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1656  virulence factor MCE-like protein  23.11 
 
 
442 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.593757  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13532  MCE-family protein mce4B  26.74 
 
 
350 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000717957 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0751  ABC transporter permease  26.9 
 
 
308 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221313  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1680  virulence factor Mce family protein  23.11 
 
 
442 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0515  virulence factor Mce family protein  23.11 
 
 
442 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.72197  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0709  virulence factor Mce family protein  23.29 
 
 
523 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.936925  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3981  virulence factor Mce family protein  26.22 
 
 
342 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13530  MCE-family protein mce4D  22.57 
 
 
451 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000446617 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  25.26 
 
 
378 aa  57  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0923  virulence factor Mce family protein  29.66 
 
 
343 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.771537 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0161  Mammalian cell entry related domain protein  23.53 
 
 
334 aa  57.4  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1628  virulence factor Mce family protein  23.53 
 
 
342 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1655  virulence factor MCE-like protein  23.53 
 
 
342 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1679  virulence factor Mce family protein  23.53 
 
 
342 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.859349  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0501  virulence factor Mce family protein  23.53 
 
 
278 aa  57  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298085  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0651  virulence factor Mce family protein  23.53 
 
 
342 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228257  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0815  mce-related protein  27.78 
 
 
149 aa  56.2  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11998  MCE-family protein mce3B  23.08 
 
 
342 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000434194  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  25.89 
 
 
307 aa  56.2  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  31.19 
 
 
148 aa  56.2  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3022  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component-like protein  28.48 
 
 
355 aa  56.2  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0786  virulence factor MCE-like protein-related protein  29.37 
 
 
150 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>