117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1873 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1873  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 		 293 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1696  Mammalian cell entry related domain protein  67.58 
 
 		 293 aa  413  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1739  Mammalian cell entry related domain protein  59.39 
 
 		 292 aa  351  8.999999999999999e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0661  hypothetical protein  59.73 
 
 		 292 aa  347  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2254  Mammalian cell entry related domain protein  56.31 
 
 		 292 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.371924  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0478  VpsC protein  54.61 
 
 		 292 aa  338  7e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.238955  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0440  VpsC protein  56.31 
 
 		 292 aa  323  2e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0495  Mammalian cell entry related domain protein  27.22 
 
 		 360 aa  113  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3214  hypothetical protein  26.37 
 
 		 360 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0926  mce-related protein  25.82 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1243  hypothetical protein  25.27 
 
 		 360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2541  virulence factor MCE-like protein-related protein  24.73 
 
 		 360 aa  109  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143277  hitchhiker  0.00000000000784881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4517  hypothetical protein  23.84 
 
 		 359 aa  106  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4901  Mammalian cell entry related domain protein  29.55 
 
 		 328 aa  106  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.374077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6192  Mammalian cell entry related domain protein  28.34 
 
 		 332 aa  91.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  27.36 
 
 		 337 aa  89  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3636  Mammalian cell entry related domain protein  25.73 
 
 		 321 aa  86.7  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.676726 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5281  Mammalian cell entry related domain protein  28.11 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.192594 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0795  Mammalian cell entry related domain protein  24.05 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4316  hypothetical protein  29.68 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209742  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1867  Mammalian cell entry related domain protein  26.32 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.449047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3316  Mammalian cell entry related domain protein  28.49 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635964  hitchhiker  0.0000217652 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11078  hypothetical protein  25.55 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1810  Mammalian cell entry related domain protein  25.73 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  24.46 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  24.68 
 
 		 529 aa  69.3  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0751  ABC transporter permease  26.51 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2344  Mammalian cell entry related domain protein  21.9 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2984  ABC transporter, permease component  24.29 
 
 		 325 aa  67  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4584  hypothetical protein  25.88 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1272  virulence factor MCE-like protein-related protein  21.31 
 
 		 347 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.821992  hitchhiker  0.0000000117847 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2823  virulence factor Mce family protein  29.45 
 
 		 361 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.314486  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1899  virulence factor Mce family protein  22.15 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1049  hypothetical protein  24.44 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460957 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0343  hypothetical protein  29.71 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.908048  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0638  hypothetical protein  23.59 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.498696 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0334  hypothetical protein  29.71 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3514  ABC transporter, inner membrane subunit  29.71 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.531635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0384  Mammalian cell entry related domain protein  25.35 
 
 		 152 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.214826 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2691  hypothetical protein  29.71 
 
 		 189 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0995365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0416  hypothetical protein  29.71 
 
 		 189 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249405  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0395  hypothetical protein  29.71 
 
 		 187 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2113  Mammalian cell entry related domain protein  24.68 
 
 		 316 aa  57  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202192  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0339  Mammalian cell entry related domain protein  32.86 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.620596 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0160  mce-related protein  32.86 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1967  hypothetical protein  33.04 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.539275  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0031  hypothetical protein  22.06 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.929118  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2733  Mammalian cell entry related domain protein  30.08 
 
 		 356 aa  55.8  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3120  hypothetical protein  28.26 
 
 		 173 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771354  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2118  hypothetical protein  30.43 
 
 		 151 aa  55.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2768  hypothetical protein  28.99 
 
 		 184 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3569  Mammalian cell entry related domain protein  28.26 
 
 		 186 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424468  hitchhiker  0.0000173433 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2960  signal peptide protein  31.65 
 
 		 173 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0718  Mammalian cell entry related domain protein  29.71 
 
 		 161 aa  54.3  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1508  Mammalian cell entry related domain protein  30.08 
 
 		 356 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.577537 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0389  putative signal peptide protein, toluene tolerance Ttg2C-like  26.81 
 
 		 181 aa  53.9  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2218  hypothetical protein  32.28 
 
 		 154 aa  53.9  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0750  hypothetical protein  29.71 
 
 		 161 aa  53.9  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3390  Mammalian cell entry related domain protein  25.58 
 
 		 317 aa  53.9  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0881876 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2891  Mammalian cell entry related domain protein  30.94 
 
 		 175 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1898  putative ABC transporter substrate-binding protein  30.94 
 
 		 155 aa  53.5  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5534  hypothetical protein  30.94 
 
 		 161 aa  53.5  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.264569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0687  hypothetical protein  23.51 
 
 		 332 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3238  Mammalian cell entry related domain protein  31.01 
 
 		 175 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2066  Mammalian cell entry related domain protein  20.74 
 
 		 388 aa  53.1  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0534  Mammalian cell entry related domain protein  32.12 
 
 		 150 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2724  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.16 
 
 		 184 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0403  hypothetical protein  27.21 
 
 		 146 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0687  hypothetical protein  30.19 
 
 		 169 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1894  hypothetical protein  22.4 
 
 		 324 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276188  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3702  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.16 
 
 		 188 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.16 
 
 		 186 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42671  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1779  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.16 
 
 		 186 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3675  mce family protein  31.16 
 
 		 189 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.090883  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3733  mce family protein  31.16 
 
 		 186 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2774  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.16 
 
 		 186 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0854  Mammalian cell entry related domain protein  28.89 
 
 		 148 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.102404 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3002  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.71 
 
 		 176 aa  49.7  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.784047  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1015  hypothetical protein  32.11 
 
 		 163 aa  50.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2399  hypothetical protein  27.54 
 
 		 156 aa  50.1  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0319  hypothetical protein  29.51 
 
 		 187 aa  50.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0287402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  28.79 
 
 		 148 aa  48.9  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1171  hypothetical protein  32.17 
 
 		 168 aa  48.9  0.00009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0707  Mammalian cell entry related domain protein  21.2 
 
 		 362 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.886561  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1818  hypothetical protein  29.85 
 
 		 148 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1007  Mammalian cell entry related domain protein  31.58 
 
 		 152 aa  48.5  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.063355  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1156  Mammalian cell entry related domain protein  28.26 
 
 		 163 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482142  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3307  Mammalian cell entry related domain protein  23.1 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185146  normal  0.246163 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  23.37 
 
 		 430 aa  47.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2784  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component  27.61 
 
 		 155 aa  47.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162084  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0449  ABC-type transport system protein  31.62 
 
 		 148 aa  47.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.58514e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3702  hypothetical protein  28.47 
 
 		 149 aa  47  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0890  Mammalian cell entry related domain protein  28.57 
 
 		 156 aa  47  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1015  hypothetical protein  28.3 
 
 		 321 aa  46.2  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1156  Mammalian cell entry related domain protein  21.62 
 
 		 313 aa  46.2  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3392  hypothetical protein  32.11 
 
 		 160 aa  45.8  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1072  hypothetical protein  24.64 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3566  hypothetical protein  23.99 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2221  hypothetical protein  29.53 
 
 		 153 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.693824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0098  hypothetical protein  30.43 
 
 		 160 aa  44.3  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.334829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>