290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2891 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2891  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 		 175 aa  347  6e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3238  Mammalian cell entry related domain protein  97.71 
 
 		 175 aa  340  8e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2960  signal peptide protein  88.95 
 
 		 173 aa  284  5.999999999999999e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0389  putative signal peptide protein, toluene tolerance Ttg2C-like  72.08 
 
 		 181 aa  238  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3120  hypothetical protein  75 
 
 		 173 aa  236  9e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771354  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2768  hypothetical protein  74.34 
 
 		 184 aa  236  9e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3569  Mammalian cell entry related domain protein  72.26 
 
 		 186 aa  233  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424468  hitchhiker  0.0000173433 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0343  hypothetical protein  72.55 
 
 		 187 aa  231  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.908048  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0334  hypothetical protein  71.9 
 
 		 187 aa  228  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3514  ABC transporter, inner membrane subunit  71.62 
 
 		 184 aa  221  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.531635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2691  hypothetical protein  70.95 
 
 		 189 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0995365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0416  hypothetical protein  70.95 
 
 		 189 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249405  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0395  hypothetical protein  70.95 
 
 		 187 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2937  hypothetical protein  63.52 
 
 		 162 aa  210  7e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.887715  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0098  hypothetical protein  68.63 
 
 		 160 aa  207  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.334829  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0319  hypothetical protein  71.52 
 
 		 187 aa  206  9e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0287402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1898  putative ABC transporter substrate-binding protein  65.56 
 
 		 155 aa  206  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3257  hypothetical protein  73.65 
 
 		 179 aa  206  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0097  Mammalian cell entry related domain protein  67.32 
 
 		 160 aa  205  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000148019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3002  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  71.62 
 
 		 176 aa  204  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.784047  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0795  hypothetical protein  68.21 
 
 		 168 aa  203  9e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0687  hypothetical protein  59.2 
 
 		 169 aa  202  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  70.27 
 
 		 186 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42671  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3702  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  70.27 
 
 		 188 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1779  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  70.27 
 
 		 186 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3733  mce family protein  70.27 
 
 		 186 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2774  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  70.27 
 
 		 186 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3675  mce family protein  70.27 
 
 		 189 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.090883  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2724  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  70.27 
 
 		 184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1156  Mammalian cell entry related domain protein  63.35 
 
 		 163 aa  199  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482142  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0890  Mammalian cell entry related domain protein  61.04 
 
 		 156 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2399  hypothetical protein  62.09 
 
 		 156 aa  194  6e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0718  Mammalian cell entry related domain protein  60 
 
 		 161 aa  193  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3099  putative ABC transport system substrate-binding protein  65.38 
 
 		 160 aa  192  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.369391  normal  0.460198 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3392  hypothetical protein  69.03 
 
 		 160 aa  191  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5534  hypothetical protein  59.12 
 
 		 161 aa  190  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.264569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0750  hypothetical protein  59.39 
 
 		 161 aa  189  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0239  hypothetical protein  56.25 
 
 		 164 aa  189  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.852395 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2747  hypothetical protein  55.19 
 
 		 161 aa  186  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3400  hypothetical protein  59.6 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1015  hypothetical protein  62.33 
 
 		 163 aa  164  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1171  hypothetical protein  54.97 
 
 		 168 aa  161  4.0000000000000004e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0981  hypothetical protein  51.28 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2784  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component  51.97 
 
 		 155 aa  153  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162084  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1967  hypothetical protein  43.75 
 
 		 166 aa  149  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.539275  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0339  Mammalian cell entry related domain protein  46 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.620596 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0160  mce-related protein  46 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2221  hypothetical protein  48.3 
 
 		 153 aa  144  8.000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.693824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0384  Mammalian cell entry related domain protein  45.39 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.214826 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2118  hypothetical protein  45.95 
 
 		 151 aa  142  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3648  Mammalian cell entry related domain protein  44.31 
 
 		 190 aa  141  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1144  hypothetical protein  41.99 
 
 		 185 aa  140  7e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0514  hypothetical protein  41.99 
 
 		 185 aa  140  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449918  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0450  mce family protein  41.99 
 
 		 185 aa  140  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.132036  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0761  Mammalian cell entry related domain protein  51.41 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002411  uncharacterized ABC transporter, periplasmic component YrbD  49.33 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03656  hypothetical protein  46.58 
 
 		 165 aa  138  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0283  Mammalian cell entry related domain protein  41.34 
 
 		 188 aa  137  7.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0290  Mammalian cell entry related domain protein  41.86 
 
 		 188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.151432  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03058  predicted ABC-type organic solvent transporter  43.72 
 
 		 183 aa  135  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0328967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0514  Mammalian cell entry related domain protein  43.72 
 
 		 183 aa  135  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0145877  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03009  hypothetical protein  43.72 
 
 		 183 aa  135  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0277207  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3386  Mce family protein  43.72 
 
 		 183 aa  135  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000578801  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3489  Mce family protein  43.72 
 
 		 183 aa  135  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0507  hypothetical protein  43.72 
 
 		 183 aa  135  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.945849  normal  0.16691 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3577  Mce family protein  43.72 
 
 		 183 aa  135  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.45422  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3681  Mce family protein  43.72 
 
 		 183 aa  135  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0116721  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4515  Mce family protein  43.72 
 
 		 183 aa  135  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0766033  normal  0.489861 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2411  hypothetical protein  48.98 
 
 		 154 aa  134  9e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108225  normal  0.153742 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0739  Mammalian cell entry related domain protein  46.94 
 
 		 152 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.942465  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3670  Mce family protein  44.81 
 
 		 183 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0296035 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3572  Mce family protein  44.81 
 
 		 183 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3503  Mce family protein  44.81 
 
 		 183 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.869463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3501  Mce family protein  44.81 
 
 		 183 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0513461  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3608  Mce family protein  44.81 
 
 		 183 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.345737 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3806  Mammalian cell entry related domain protein  39.9 
 
 		 214 aa  131  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0010771  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4358  hypothetical protein  44.74 
 
 		 183 aa  131  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52116  normal  0.0531845 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2885  hypothetical protein  45.03 
 
 		 160 aa  127  8.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.827962  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3629  hypothetical protein  41.44 
 
 		 187 aa  121  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.271767  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3079  mce-related protein  52.74 
 
 		 156 aa  121  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.185697 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1750  hypothetical protein  41.22 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3368  hypothetical protein  48.32 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.150445  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0715  Mammalian cell entry related domain protein  52.74 
 
 		 157 aa  117  7e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425168 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4231  hypothetical protein  50 
 
 		 155 aa  117  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0707498  hitchhiker  0.000253037 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0878  hypothetical protein  46.62 
 
 		 156 aa  117  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.600632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0724  hypothetical protein  52.74 
 
 		 157 aa  117  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.150028 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3660  hypothetical protein  52.74 
 
 		 157 aa  117  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0108071  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0694  hypothetical protein  52.74 
 
 		 157 aa  117  7e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2218  hypothetical protein  42.11 
 
 		 154 aa  117  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2100  hypothetical protein  47.95 
 
 		 163 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3952  mce-related protein  50.68 
 
 		 157 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0681  hypothetical protein  50.68 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.726556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3341  hypothetical protein  50.68 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.480692 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0680  hypothetical protein  50 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.0968495 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3302  hypothetical protein  50 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.132932 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0559  hypothetical protein  50.68 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03184  mce family protein  46.45 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0723  hypothetical protein  50 
 
 		 157 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3607  hypothetical protein  48.34 
 
 		 156 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0735  virulence factor MCE-like protein  48.7 
 
 		 156 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.310055 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>