172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2066 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2066  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 
388 aa  782    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3514  ABC transporter, inner membrane subunit  30.23 
 
 
184 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.531635  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0389  putative signal peptide protein, toluene tolerance Ttg2C-like  30.23 
 
 
181 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0343  hypothetical protein  30.23 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.908048  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2891  Mammalian cell entry related domain protein  31.78 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3238  Mammalian cell entry related domain protein  31.78 
 
 
175 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.303674  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2691  hypothetical protein  30.23 
 
 
189 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0995365  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0334  hypothetical protein  30.23 
 
 
187 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0416  hypothetical protein  30.23 
 
 
189 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249405  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0395  hypothetical protein  30.23 
 
 
187 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147868  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3569  Mammalian cell entry related domain protein  30.65 
 
 
186 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424468  hitchhiker  0.0000173433 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2768  hypothetical protein  30.23 
 
 
184 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422541  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2747  hypothetical protein  30.47 
 
 
161 aa  67.4  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3120  hypothetical protein  27.91 
 
 
173 aa  67  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771354  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0339  Mammalian cell entry related domain protein  31.78 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.620596 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0160  mce-related protein  31.78 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2960  signal peptide protein  29.46 
 
 
173 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432073  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2724  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.46 
 
 
184 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3702  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.46 
 
 
188 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.46 
 
 
186 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42671  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1779  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.46 
 
 
186 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3675  mce family protein  29.46 
 
 
189 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.090883  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3733  mce family protein  29.46 
 
 
186 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2774  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.46 
 
 
186 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1750  hypothetical protein  32.65 
 
 
178 aa  63.5  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1841  hypothetical protein  26.22 
 
 
313 aa  63.5  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3307  Mammalian cell entry related domain protein  23.63 
 
 
339 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185146  normal  0.246163 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3257  hypothetical protein  30.23 
 
 
179 aa  62  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2399  hypothetical protein  31.67 
 
 
156 aa  61.6  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2344  Mammalian cell entry related domain protein  25.44 
 
 
314 aa  62  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0838  virulence factor Mce family protein  21.39 
 
 
523 aa  61.2  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2784  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component  32.28 
 
 
155 aa  60.8  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162084  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0926  mce-related protein  25.54 
 
 
360 aa  60.1  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2937  hypothetical protein  30 
 
 
162 aa  60.1  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.887715  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6192  Mammalian cell entry related domain protein  22.49 
 
 
332 aa  60.1  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0097  Mammalian cell entry related domain protein  27.91 
 
 
160 aa  60.1  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000148019  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0495  Mammalian cell entry related domain protein  24.93 
 
 
360 aa  60.1  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1898  putative ABC transporter substrate-binding protein  28.46 
 
 
155 aa  59.7  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2541  virulence factor MCE-like protein-related protein  24.18 
 
 
360 aa  59.7  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143277  hitchhiker  0.00000000000784881 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0384  Mammalian cell entry related domain protein  30.95 
 
 
152 aa  59.3  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.214826 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0239  hypothetical protein  28 
 
 
164 aa  58.9  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.852395 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2513  virulence factor Mce family protein  26.1 
 
 
564 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.444181 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0718  Mammalian cell entry related domain protein  29.46 
 
 
161 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0098  hypothetical protein  26.36 
 
 
160 aa  58.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.334829  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2221  hypothetical protein  28.68 
 
 
153 aa  57.4  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.693824  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1818  toluene tolerance protein  34.91 
 
 
178 aa  57.4  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1330  hypothetical protein  32.17 
 
 
168 aa  56.6  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.519307  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0739  Mammalian cell entry related domain protein  30.23 
 
 
152 aa  57  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.942465  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0750  hypothetical protein  29.46 
 
 
161 aa  56.2  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0795  hypothetical protein  28.57 
 
 
168 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10606  MCE-family protein mce2F  28.12 
 
 
516 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.466214 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03209  toluene tolerance protein  33.33 
 
 
183 aa  55.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2411  hypothetical protein  32.77 
 
 
154 aa  55.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108225  normal  0.153742 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2118  hypothetical protein  29.37 
 
 
151 aa  54.7  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0890  Mammalian cell entry related domain protein  31.2 
 
 
156 aa  55.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1156  Mammalian cell entry related domain protein  28.8 
 
 
163 aa  54.3  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482142  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5534  hypothetical protein  28.36 
 
 
161 aa  54.3  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.264569  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0474  hypothetical protein  27.56 
 
 
164 aa  53.9  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000014845  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0706  virulence factor Mce family protein  26.72 
 
 
520 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.900705  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1007  Mammalian cell entry related domain protein  22.7 
 
 
152 aa  53.9  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.063355  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1967  hypothetical protein  29.23 
 
 
166 aa  53.9  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.539275  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1015  hypothetical protein  29.79 
 
 
163 aa  53.5  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0761  Mammalian cell entry related domain protein  28.45 
 
 
145 aa  53.1  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1873  Mammalian cell entry related domain protein  20.74 
 
 
293 aa  53.1  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3400  hypothetical protein  27.91 
 
 
156 aa  52.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0171  hypothetical protein  40 
 
 
166 aa  52.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1243  hypothetical protein  22.95 
 
 
360 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11078  hypothetical protein  21.67 
 
 
316 aa  52  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3806  Mammalian cell entry related domain protein  29.1 
 
 
214 aa  51.6  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0010771  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1576  hypothetical protein  29.85 
 
 
172 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.667817  normal  0.289363 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5197  virulence factor Mce family protein  26.36 
 
 
564 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0737049  normal  0.144071 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3392  hypothetical protein  29.79 
 
 
160 aa  52.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  21.86 
 
 
515 aa  51.2  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3214  hypothetical protein  22.54 
 
 
360 aa  51.2  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0283  Mammalian cell entry related domain protein  29.85 
 
 
188 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4018  Mammalian cell entry related domain protein  33.04 
 
 
174 aa  51.2  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.129238  normal  0.186584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4997  virulence factor Mce family protein  26.53 
 
 
463 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.430498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4148  virulence factor Mce family protein  25.91 
 
 
367 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4584  hypothetical protein  23.59 
 
 
321 aa  50.4  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0290  Mammalian cell entry related domain protein  29.85 
 
 
188 aa  50.1  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.151432  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1529  virulence factor MCE-like protein  24.31 
 
 
479 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2554  hypothetical protein  34.95 
 
 
164 aa  49.7  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0751  ABC transporter permease  22.02 
 
 
308 aa  49.7  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221313  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1552  virulence factor Mce family protein  24.31 
 
 
479 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.977582  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4255  hypothetical protein  33.33 
 
 
161 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0707  Mammalian cell entry related domain protein  21.78 
 
 
362 aa  49.7  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.886561  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1552  hypothetical protein  23.78 
 
 
458 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394461  normal  0.189115 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3183  Mammalian cell entry related domain protein  29.01 
 
 
150 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2218  hypothetical protein  32 
 
 
154 aa  48.5  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4614  virulence factor MCE-like protein  26.19 
 
 
453 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1015  hypothetical protein  25.25 
 
 
321 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4702  virulence factor Mce family protein  26.19 
 
 
453 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2853  virulence factor Mce family protein  25.32 
 
 
360 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1888  Mammalian cell entry related domain protein  22.44 
 
 
529 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0878  hypothetical protein  31.78 
 
 
156 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.600632  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3666  virulence factor MCE-like protein  24.81 
 
 
564 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  28.68 
 
 
333 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3739  virulence factor Mce family protein  24.81 
 
 
564 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0924  virulence factor Mce family protein  25.43 
 
 
438 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10175  MCE-family protein mce1F  25.39 
 
 
515 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>