244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0290 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0290  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 
188 aa  386  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.151432  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0283  Mammalian cell entry related domain protein  96.28 
 
 
188 aa  373  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3648  Mammalian cell entry related domain protein  75.79 
 
 
190 aa  299  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3806  Mammalian cell entry related domain protein  86.06 
 
 
214 aa  295  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0010771  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4358  hypothetical protein  81.48 
 
 
183 aa  277  8e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52116  normal  0.0531845 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1144  hypothetical protein  69.84 
 
 
185 aa  275  3e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0450  mce family protein  69.84 
 
 
185 aa  275  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.132036  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0514  hypothetical protein  69.84 
 
 
185 aa  275  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449918  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03058  predicted ABC-type organic solvent transporter  70.65 
 
 
183 aa  257  6e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0328967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0514  Mammalian cell entry related domain protein  70.65 
 
 
183 aa  257  6e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0145877  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3386  Mce family protein  70.65 
 
 
183 aa  257  6e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000578801  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03009  hypothetical protein  70.65 
 
 
183 aa  257  6e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0277207  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3489  Mce family protein  70.65 
 
 
183 aa  257  6e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4515  Mce family protein  70.65 
 
 
183 aa  257  6e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0766033  normal  0.489861 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3681  Mce family protein  70.65 
 
 
183 aa  257  6e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0116721  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0507  hypothetical protein  70.65 
 
 
183 aa  257  6e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.945849  normal  0.16691 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3577  Mce family protein  70.65 
 
 
183 aa  257  6e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.45422  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3629  hypothetical protein  69.73 
 
 
187 aa  257  9e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.271767  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3572  Mce family protein  67.74 
 
 
183 aa  248  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3501  Mce family protein  67.74 
 
 
183 aa  248  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0513461  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3670  Mce family protein  67.74 
 
 
183 aa  248  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0296035 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3608  Mce family protein  67.74 
 
 
183 aa  248  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.345737 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3503  Mce family protein  67.74 
 
 
183 aa  248  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.869463  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1171  hypothetical protein  55.95 
 
 
168 aa  196  2.0000000000000003e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03656  hypothetical protein  56.25 
 
 
165 aa  176  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002411  uncharacterized ABC transporter, periplasmic component YrbD  56.25 
 
 
162 aa  175  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2885  hypothetical protein  51.32 
 
 
160 aa  160  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.827962  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0687  hypothetical protein  47.93 
 
 
169 aa  159  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03184  mce family protein  50.94 
 
 
157 aa  150  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2100  hypothetical protein  55 
 
 
163 aa  149  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5534  hypothetical protein  48.45 
 
 
161 aa  145  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.264569  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2937  hypothetical protein  46.63 
 
 
162 aa  144  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.887715  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0981  hypothetical protein  45.96 
 
 
158 aa  142  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2399  hypothetical protein  44.1 
 
 
156 aa  143  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0795  hypothetical protein  46.5 
 
 
168 aa  142  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2784  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component  46.84 
 
 
155 aa  142  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162084  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3079  mce-related protein  52.26 
 
 
156 aa  142  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.185697 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0723  hypothetical protein  53.46 
 
 
157 aa  142  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3952  mce-related protein  53.46 
 
 
157 aa  141  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1156  Mammalian cell entry related domain protein  44.91 
 
 
163 aa  141  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482142  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0681  hypothetical protein  53.46 
 
 
157 aa  141  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.726556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3341  hypothetical protein  53.46 
 
 
157 aa  141  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.480692 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0559  hypothetical protein  52.63 
 
 
154 aa  141  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0098  hypothetical protein  47.37 
 
 
160 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.334829  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3607  hypothetical protein  51.61 
 
 
156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0680  hypothetical protein  52.2 
 
 
157 aa  139  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.0968495 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0715  Mammalian cell entry related domain protein  52.2 
 
 
157 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425168 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3660  hypothetical protein  52.2 
 
 
157 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0108071  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0724  hypothetical protein  52.2 
 
 
157 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.150028 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0694  hypothetical protein  52.2 
 
 
157 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3238  Mammalian cell entry related domain protein  40.44 
 
 
175 aa  137  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.303674  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3569  Mammalian cell entry related domain protein  46.5 
 
 
186 aa  137  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424468  hitchhiker  0.0000173433 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0735  virulence factor MCE-like protein  51.95 
 
 
156 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.310055 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3120  hypothetical protein  46.71 
 
 
173 aa  136  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771354  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2891  Mammalian cell entry related domain protein  41.86 
 
 
175 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0718  Mammalian cell entry related domain protein  43.37 
 
 
161 aa  135  5e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2411  hypothetical protein  42.77 
 
 
154 aa  134  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108225  normal  0.153742 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1967  hypothetical protein  42.6 
 
 
166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.539275  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0343  hypothetical protein  45.57 
 
 
187 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.908048  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2960  signal peptide protein  46.05 
 
 
173 aa  134  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432073  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2221  hypothetical protein  43.59 
 
 
153 aa  134  7.000000000000001e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.693824  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0498  hypothetical protein  50.66 
 
 
157 aa  134  8e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000028229  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0097  Mammalian cell entry related domain protein  46.47 
 
 
160 aa  134  8e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000148019  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2691  hypothetical protein  48.7 
 
 
189 aa  134  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0995365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0416  hypothetical protein  48.7 
 
 
189 aa  134  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249405  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3514  ABC transporter, inner membrane subunit  47.37 
 
 
184 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.531635  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0334  hypothetical protein  45.57 
 
 
187 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4231  hypothetical protein  50.65 
 
 
155 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0707498  hitchhiker  0.000253037 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0750  hypothetical protein  43.37 
 
 
161 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0395  hypothetical protein  47.37 
 
 
187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147868  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0389  putative signal peptide protein, toluene tolerance Ttg2C-like  44.94 
 
 
181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4534  mce family protein  53.46 
 
 
157 aa  132  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.623769  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3368  hypothetical protein  49.34 
 
 
157 aa  131  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.150445  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0507  toluene tolerance protein Ttg2C  51.55 
 
 
164 aa  131  6e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.418128  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12870  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, substrate binding protein  46.75 
 
 
156 aa  130  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2747  hypothetical protein  42.07 
 
 
161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2768  hypothetical protein  44.3 
 
 
184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422541  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3302  hypothetical protein  52.63 
 
 
157 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.132932 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2118  hypothetical protein  43.71 
 
 
151 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1898  putative ABC transporter substrate-binding protein  42.07 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3099  putative ABC transport system substrate-binding protein  47.85 
 
 
160 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.369391  normal  0.460198 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4445  mce-related protein  44.81 
 
 
155 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4139  hypothetical protein  45.45 
 
 
155 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0878  hypothetical protein  41.61 
 
 
156 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.600632  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0890  Mammalian cell entry related domain protein  42.41 
 
 
156 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3257  hypothetical protein  49.34 
 
 
179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0960  hypothetical protein  44.87 
 
 
161 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0384  Mammalian cell entry related domain protein  40.13 
 
 
152 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.214826 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3392  hypothetical protein  44.94 
 
 
160 aa  122  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2707  hypothetical protein  42.67 
 
 
149 aa  121  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0319  hypothetical protein  45.86 
 
 
187 aa  121  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0287402  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3400  hypothetical protein  47.74 
 
 
156 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3002  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  48.7 
 
 
176 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.784047  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0967  hypothetical protein  43.59 
 
 
161 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1015  hypothetical protein  46.71 
 
 
163 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0865  hypothetical protein  43.51 
 
 
155 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4255  hypothetical protein  41.98 
 
 
161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0999  hypothetical protein  44.23 
 
 
160 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3733  mce family protein  48.05 
 
 
186 aa  117  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  48.05 
 
 
186 aa  117  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>