More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3183 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3183  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 
150 aa  292  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0560  hypothetical protein  75.51 
 
 
148 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000625618  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0786  virulence factor MCE-like protein-related protein  68.67 
 
 
150 aa  210  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1041  hypothetical protein  69.33 
 
 
150 aa  209  9e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0815  mce-related protein  66.67 
 
 
149 aa  209  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  52.35 
 
 
148 aa  156  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0854  Mammalian cell entry related domain protein  54.36 
 
 
148 aa  156  9e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.102404 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1818  hypothetical protein  51.68 
 
 
148 aa  154  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0474  hypothetical protein  49.33 
 
 
164 aa  149  8.999999999999999e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000014845  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0449  ABC-type transport system protein  52.03 
 
 
148 aa  149  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.58514e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0534  Mammalian cell entry related domain protein  48.61 
 
 
150 aa  138  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0403  hypothetical protein  46.62 
 
 
146 aa  137  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304841  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1007  Mammalian cell entry related domain protein  40.27 
 
 
152 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.063355  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3702  hypothetical protein  39.86 
 
 
149 aa  115  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0098  hypothetical protein  40 
 
 
160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.334829  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  41.73 
 
 
529 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0097  Mammalian cell entry related domain protein  40.94 
 
 
160 aa  107  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000148019  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1967  hypothetical protein  39.22 
 
 
166 aa  106  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.539275  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1898  putative ABC transporter substrate-binding protein  38.93 
 
 
155 aa  104  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0160  mce-related protein  36.91 
 
 
152 aa  103  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0339  Mammalian cell entry related domain protein  36.91 
 
 
152 aa  103  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.620596 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3514  ABC transporter, inner membrane subunit  36.24 
 
 
184 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.531635  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2691  hypothetical protein  36.24 
 
 
189 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0995365  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0395  hypothetical protein  36.91 
 
 
187 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147868  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0334  hypothetical protein  36.24 
 
 
187 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0416  hypothetical protein  36.24 
 
 
189 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249405  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0343  hypothetical protein  36.24 
 
 
187 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.908048  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2399  hypothetical protein  36.24 
 
 
156 aa  101  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3569  Mammalian cell entry related domain protein  37.58 
 
 
186 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424468  hitchhiker  0.0000173433 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5534  hypothetical protein  36.42 
 
 
161 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.264569  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3120  hypothetical protein  35.57 
 
 
173 aa  99.4  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771354  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2960  signal peptide protein  34.9 
 
 
173 aa  98.6  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432073  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0389  putative signal peptide protein, toluene tolerance Ttg2C-like  37.09 
 
 
181 aa  98.2  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2768  hypothetical protein  36.24 
 
 
184 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422541  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2784  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component  36.24 
 
 
155 aa  97.4  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162084  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2118  hypothetical protein  35.53 
 
 
151 aa  97.4  6e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2411  hypothetical protein  36.49 
 
 
154 aa  96.3  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108225  normal  0.153742 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0718  Mammalian cell entry related domain protein  33.77 
 
 
161 aa  95.1  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2891  Mammalian cell entry related domain protein  34.67 
 
 
175 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2937  hypothetical protein  34.23 
 
 
162 aa  94.4  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.887715  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0750  hypothetical protein  33.77 
 
 
161 aa  94.4  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3238  Mammalian cell entry related domain protein  34.9 
 
 
175 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.303674  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2218  hypothetical protein  35.37 
 
 
154 aa  94  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2747  hypothetical protein  37.58 
 
 
161 aa  93.2  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0795  hypothetical protein  34.9 
 
 
168 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1156  Mammalian cell entry related domain protein  32.67 
 
 
163 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482142  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2707  hypothetical protein  34.67 
 
 
149 aa  90.1  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0761  Mammalian cell entry related domain protein  35.21 
 
 
145 aa  89.4  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0239  hypothetical protein  31.54 
 
 
164 aa  89  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.852395 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0384  Mammalian cell entry related domain protein  34.51 
 
 
152 aa  88.6  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.214826 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3733  mce family protein  37.58 
 
 
186 aa  88.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1779  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.58 
 
 
186 aa  88.2  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3702  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.58 
 
 
188 aa  88.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3002  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.91 
 
 
176 aa  88.2  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.784047  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3675  mce family protein  37.58 
 
 
189 aa  88.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.090883  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.58 
 
 
186 aa  88.2  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42671  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2774  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.58 
 
 
186 aa  88.2  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0450  mce family protein  35.03 
 
 
185 aa  88.2  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.132036  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2724  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.58 
 
 
184 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0514  hypothetical protein  35.03 
 
 
185 aa  88.2  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449918  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4358  hypothetical protein  34.64 
 
 
183 aa  87.8  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52116  normal  0.0531845 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0687  hypothetical protein  32.67 
 
 
169 aa  87.8  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0890  Mammalian cell entry related domain protein  34.9 
 
 
156 aa  87.8  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1144  hypothetical protein  35.03 
 
 
185 aa  87.4  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3099  putative ABC transport system substrate-binding protein  36.91 
 
 
160 aa  87.4  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.369391  normal  0.460198 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0319  hypothetical protein  37.69 
 
 
187 aa  87  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0287402  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3827  virulence factor Mce family protein  33.33 
 
 
364 aa  86.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0878  hypothetical protein  34.21 
 
 
156 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.600632  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0739  Mammalian cell entry related domain protein  33.33 
 
 
152 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.942465  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0283  Mammalian cell entry related domain protein  33.99 
 
 
188 aa  84.7  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2221  hypothetical protein  32.21 
 
 
153 aa  83.6  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.693824  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3648  Mammalian cell entry related domain protein  33.33 
 
 
190 aa  83.6  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0290  Mammalian cell entry related domain protein  33.99 
 
 
188 aa  83.6  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.151432  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3806  Mammalian cell entry related domain protein  34.64 
 
 
214 aa  83.2  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0010771  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1750  hypothetical protein  32.65 
 
 
178 aa  82.4  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12870  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, substrate binding protein  36.18 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4139  hypothetical protein  38.6 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0981  hypothetical protein  33.33 
 
 
158 aa  80.1  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1391  hypothetical protein  35.33 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230903  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3392  hypothetical protein  35.33 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4445  mce-related protein  37.72 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0171  hypothetical protein  34.71 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1171  hypothetical protein  34.44 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0119  virulence factor MCE-like protein  35.97 
 
 
343 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.410781  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0109  virulence factor Mce family protein  35.97 
 
 
343 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.971857  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0128  virulence factor Mce family protein  35.97 
 
 
343 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284372  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0967  hypothetical protein  37.72 
 
 
161 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3400  hypothetical protein  34.9 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1110  Mammalian cell entry related domain protein  37.07 
 
 
196 aa  77  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820134  normal  0.240411 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2885  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  77  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.827962  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0960  hypothetical protein  36.84 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3257  hypothetical protein  35.14 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1521  hypothetical protein  37.07 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.661029  normal  0.423884 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3296  hypothetical protein  29.66 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0999  hypothetical protein  36.84 
 
 
160 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3022  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component-like protein  31.58 
 
 
355 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1818  toluene tolerance protein  33.33 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0865  hypothetical protein  36.84 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57850  hypothetical protein  36.21 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5026  hypothetical protein  36.21 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>