178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2344 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2344  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 		 314 aa  619  1e-176  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3636  Mammalian cell entry related domain protein  26.67 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.676726 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4901  Mammalian cell entry related domain protein  28.48 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.374077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6192  Mammalian cell entry related domain protein  25.47 
 
 		 332 aa  96.7  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2113  Mammalian cell entry related domain protein  26.56 
 
 		 316 aa  94  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202192  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11078  hypothetical protein  25.57 
 
 		 316 aa  90.1  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0838  virulence factor Mce family protein  22.7 
 
 		 523 aa  88.6  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1049  hypothetical protein  23.39 
 
 		 292 aa  87  4e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460957 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0638  hypothetical protein  24.1 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.498696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4584  hypothetical protein  23.05 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1867  Mammalian cell entry related domain protein  23.05 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.449047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  23.28 
 
 		 515 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1899  virulence factor Mce family protein  25.32 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0751  ABC transporter permease  24.61 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  22.67 
 
 		 529 aa  73.2  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1696  Mammalian cell entry related domain protein  22.37 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0926  mce-related protein  24.29 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0440  VpsC protein  25.09 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1873  Mammalian cell entry related domain protein  21.9 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  26.22 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1888  Mammalian cell entry related domain protein  27.6 
 
 		 529 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1739  Mammalian cell entry related domain protein  21.86 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0687  hypothetical protein  21.41 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1508  Mammalian cell entry related domain protein  23.33 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.577537 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2254  Mammalian cell entry related domain protein  21.12 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.371924  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0495  Mammalian cell entry related domain protein  24.39 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2066  Mammalian cell entry related domain protein  25.44 
 
 		 388 aa  62  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0517  virulence factor Mce family protein  27.65 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  23.9 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10171  MCE-family protein mce1B  24.91 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3214  hypothetical protein  22.63 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0661  hypothetical protein  24.01 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1243  hypothetical protein  21.35 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  25.25 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  26.3 
 
 		 433 aa  59.3  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  27.15 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4603  virulence factor Mce family protein  26.17 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1272  virulence factor MCE-like protein-related protein  21.22 
 
 		 347 aa  57  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.821992  hitchhiker  0.0000000117847 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2541  virulence factor MCE-like protein-related protein  22.57 
 
 		 360 aa  57  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143277  hitchhiker  0.00000000000784881 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  24.67 
 
 		 312 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11998  MCE-family protein mce3B  26.8 
 
 		 342 aa  57  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000434194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0515  virulence factor Mce family protein  25.23 
 
 		 342 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3021  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component-like protein  37.37 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  24.19 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0478  VpsC protein  20.72 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.238955  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0893  hypothetical protein  25.63 
 
 		 360 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.932259  normal  0.840241 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3948  virulence factor Mce family protein  28.35 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0710  virulence factor Mce family protein  25.23 
 
 		 343 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.476442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  28.76 
 
 		 305 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04760  MCE domain protein  25 
 
 		 312 aa  55.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  24.52 
 
 		 312 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0853  Mammalian cell entry related domain protein  24.09 
 
 		 360 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.0740756 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2822  virulence factor Mce family protein  24.9 
 
 		 329 aa  54.3  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.883459  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0479  hypothetical protein  24.81 
 
 		 313 aa  53.5  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0772873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2733  Mammalian cell entry related domain protein  22.22 
 
 		 356 aa  53.5  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03740  virulence factor Mce family protein  29.41 
 
 		 328 aa  53.1  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0184  hypothetical protein  29.47 
 
 		 310 aa  53.5  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.683235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0161  Mammalian cell entry related domain protein  23.38 
 
 		 334 aa  53.1  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0501  virulence factor Mce family protein  31.67 
 
 		 278 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3019  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component-like protein  28.15 
 
 		 339 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1171  virulence factor Mce family protein  26.15 
 
 		 369 aa  52.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.919732 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2744  hypothetical protein  30.65 
 
 		 315 aa  52.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811657 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1655  virulence factor MCE-like protein  31.67 
 
 		 342 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1679  virulence factor Mce family protein  31.67 
 
 		 342 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.859349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1628  virulence factor Mce family protein  31.67 
 
 		 342 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0651  virulence factor Mce family protein  31.67 
 
 		 342 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2719  hypothetical protein  32.14 
 
 		 151 aa  52.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.46934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1657  virulence factor MCE-like protein  25.76 
 
 		 448 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1681  virulence factor Mce family protein  25.76 
 
 		 448 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0135  virulence factor Mce family protein  24.18 
 
 		 343 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0516  virulence factor Mce family protein  25.76 
 
 		 448 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.202539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3809  Mammalian cell entry related domain protein  27.69 
 
 		 404 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.622643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1630  virulence factor Mce family protein  25.76 
 
 		 448 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0649  virulence factor Mce family protein  25.76 
 
 		 448 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  23.57 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0232  hypothetical protein  27.12 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0119  virulence factor MCE-like protein  24.18 
 
 		 343 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.410781  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0246  Mammalian cell entry related domain protein  26.38 
 
 		 325 aa  51.2  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0128  virulence factor Mce family protein  24.18 
 
 		 343 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284372  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3307  Mammalian cell entry related domain protein  24.35 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185146  normal  0.246163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0109  virulence factor Mce family protein  24.18 
 
 		 343 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.971857  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  24.2 
 
 		 312 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1506  virulence factor Mce family protein  29.55 
 
 		 339 aa  50.4  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3792  Mammalian cell entry related domain protein  36.52 
 
 		 332 aa  50.4  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170276  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5200  virulence factor Mce family protein  25 
 
 		 355 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.168356  normal  0.194199 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1854  Mammalian cell entry related domain protein  23.18 
 
 		 318 aa  50.4  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000329704  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  21.24 
 
 		 430 aa  50.4  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0252  hypothetical protein  26.38 
 
 		 325 aa  50.1  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0686058 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0707  Mammalian cell entry related domain protein  26.19 
 
 		 362 aa  50.1  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.886561  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4615  virulence factor MCE-like protein  26.72 
 
 		 352 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4703  virulence factor Mce family protein  26.72 
 
 		 352 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.293736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  24.91 
 
 		 579 aa  49.7  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0021  Mammalian cell entry related domain protein  40.79 
 
 		 155 aa  49.3  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.579673  normal  0.0449568 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  21.57 
 
 		 337 aa  49.7  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0364  virulence factor Mce family protein  26.28 
 
 		 342 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1558  virulence factor Mce family protein  26.72 
 
 		 352 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2509  virulence factor Mce family protein  31.97 
 
 		 341 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31094  normal  0.638978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0819  Mammalian cell entry related domain protein  23.36 
 
 		 360 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.940856  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11999  MCE-family protein mce3C  22.86 
 
 		 410 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000102981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1208  hypothetical protein  24.35 
 
 		 308 aa  49.3  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>