257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1899 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1899  virulence factor Mce family protein  100 
 
 
349 aa  689    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1272  virulence factor MCE-like protein-related protein  77.23 
 
 
347 aa  550  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.821992  hitchhiker  0.0000000117847 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  67.62 
 
 
349 aa  495  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1508  Mammalian cell entry related domain protein  63.76 
 
 
356 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.577537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2733  Mammalian cell entry related domain protein  63.48 
 
 
356 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0687  hypothetical protein  30.99 
 
 
332 aa  171  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4517  hypothetical protein  28.01 
 
 
359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  27.17 
 
 
529 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3214  hypothetical protein  27.55 
 
 
360 aa  99.8  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0926  mce-related protein  27.38 
 
 
360 aa  97.1  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2541  virulence factor MCE-like protein-related protein  26.57 
 
 
360 aa  96.7  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143277  hitchhiker  0.00000000000784881 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0495  Mammalian cell entry related domain protein  28.32 
 
 
360 aa  95.5  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1243  hypothetical protein  25.61 
 
 
360 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0838  virulence factor Mce family protein  25.14 
 
 
523 aa  94  4e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  24.49 
 
 
515 aa  80.5  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2113  Mammalian cell entry related domain protein  25.59 
 
 
316 aa  78.2  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202192  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  23.72 
 
 
337 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4901  Mammalian cell entry related domain protein  24.78 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.374077  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2344  Mammalian cell entry related domain protein  25.32 
 
 
314 aa  73.9  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3022  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component-like protein  30.99 
 
 
355 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6192  Mammalian cell entry related domain protein  26.62 
 
 
332 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  26.85 
 
 
430 aa  70.9  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3636  Mammalian cell entry related domain protein  25.99 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.676726 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0795  Mammalian cell entry related domain protein  24.76 
 
 
328 aa  68.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0751  ABC transporter permease  27.33 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221313  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3827  virulence factor Mce family protein  29.94 
 
 
364 aa  67  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1867  Mammalian cell entry related domain protein  24.5 
 
 
316 aa  67  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.449047  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0661  hypothetical protein  23.55 
 
 
292 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1810  Mammalian cell entry related domain protein  25.65 
 
 
341 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0110  virulence factor Mce family protein  26.54 
 
 
528 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.434607  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2984  ABC transporter, permease component  22.08 
 
 
325 aa  64.3  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395413  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2985  virulence factor Mce family protein  36.36 
 
 
344 aa  63.5  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0120  virulence factor MCE-like protein  26.15 
 
 
528 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5281  Mammalian cell entry related domain protein  22.74 
 
 
340 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.192594 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0161  Mammalian cell entry related domain protein  23.38 
 
 
334 aa  63.2  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0129  virulence factor Mce family protein  26.15 
 
 
528 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.54103  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0031  hypothetical protein  20.66 
 
 
305 aa  62.8  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.929118  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0709  virulence factor Mce family protein  25.09 
 
 
523 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.936925  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  28.81 
 
 
579 aa  62.4  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0009  virulence factor Mce family protein  22.85 
 
 
351 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629178  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  25.97 
 
 
307 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  24.9 
 
 
333 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0705  virulence factor Mce family protein  27.09 
 
 
321 aa  61.6  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1873  Mammalian cell entry related domain protein  22.15 
 
 
293 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  25.66 
 
 
308 aa  61.6  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4168  virulence factor Mce family protein  23.57 
 
 
444 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375234  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3307  Mammalian cell entry related domain protein  24.46 
 
 
339 aa  59.7  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185146  normal  0.246163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4603  virulence factor Mce family protein  26.13 
 
 
346 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3021  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component-like protein  26.05 
 
 
340 aa  59.7  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1818  hypothetical protein  32.09 
 
 
148 aa  59.3  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3947  virulence factor Mce family protein  28.1 
 
 
419 aa  59.3  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09350  virulence factor Mce family protein  28.82 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.960251 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11078  hypothetical protein  24.16 
 
 
316 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  27.6 
 
 
296 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0449  ABC-type transport system protein  30.43 
 
 
148 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.58514e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0960  virulence factor Mce family protein  30.4 
 
 
351 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4148  virulence factor Mce family protein  24.68 
 
 
367 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4398  virulence factor Mce family protein  27.4 
 
 
342 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1639  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  27.6 
 
 
296 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2254  Mammalian cell entry related domain protein  25.71 
 
 
292 aa  57.8  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.371924  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1049  hypothetical protein  23.55 
 
 
292 aa  57.8  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460957 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2008  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  28.24 
 
 
296 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  23.89 
 
 
308 aa  57  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.89 
 
 
308 aa  57  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0923  virulence factor Mce family protein  26.61 
 
 
343 aa  57  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.771537 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  30.47 
 
 
148 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1110  Mammalian cell entry related domain protein  41.77 
 
 
196 aa  56.6  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820134  normal  0.240411 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0517  virulence factor Mce family protein  24.38 
 
 
355 aa  56.6  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4584  hypothetical protein  23.41 
 
 
321 aa  56.2  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0403  hypothetical protein  33.61 
 
 
146 aa  56.2  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304841  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  28.35 
 
 
378 aa  55.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2510  virulence factor Mce family protein  26.22 
 
 
367 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0135  virulence factor Mce family protein  23.2 
 
 
343 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0815  mce-related protein  28.46 
 
 
149 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1888  Mammalian cell entry related domain protein  23.94 
 
 
529 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1243  virulence factor Mce family protein  27.82 
 
 
344 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0707  Mammalian cell entry related domain protein  22.59 
 
 
362 aa  54.7  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.886561  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0837  hypothetical protein  23.74 
 
 
319 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866105  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0516  virulence factor Mce family protein  27.22 
 
 
345 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0136  virulence factor Mce family protein  25.17 
 
 
523 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.6 
 
 
275 aa  54.7  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0119  virulence factor MCE-like protein  31.19 
 
 
343 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.410781  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4616  virulence factor MCE-like protein  31.67 
 
 
344 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.978929  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4169  virulence factor Mce family protein  25.64 
 
 
342 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0128  virulence factor Mce family protein  31.19 
 
 
343 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284372  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4704  virulence factor Mce family protein  31.67 
 
 
344 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112748  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3183  Mammalian cell entry related domain protein  30.77 
 
 
150 aa  54.7  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10601  MCE-family protein mce2B  31.97 
 
 
275 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0109  virulence factor Mce family protein  31.19 
 
 
343 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.971857  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11998  MCE-family protein mce3B  35.23 
 
 
342 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000434194  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03730  virulence factor Mce family protein  23.37 
 
 
343 aa  53.9  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.918695  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3316  Mammalian cell entry related domain protein  25 
 
 
266 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635964  hitchhiker  0.0000217652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13531  MCE-family protein mce4C  24.92 
 
 
357 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185056 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0854  Mammalian cell entry related domain protein  30.6 
 
 
148 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.102404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0364  virulence factor Mce family protein  26.27 
 
 
342 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4397  virulence factor Mce family protein  28.22 
 
 
430 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  22.66 
 
 
308 aa  53.1  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4164  virulence factor Mce family protein  23.59 
 
 
386 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  26.53 
 
 
308 aa  53.1  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2159  virulence factor Mce family protein  26.02 
 
 
321 aa  52.8  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0878447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>