71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0661 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0661  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  580  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1739  Mammalian cell entry related domain protein  76.03 
 
 
292 aa  451  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2254  Mammalian cell entry related domain protein  70.89 
 
 
292 aa  434  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.371924  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0478  VpsC protein  69.86 
 
 
292 aa  426  1e-118  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.238955  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0440  VpsC protein  67.12 
 
 
292 aa  393  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1873  Mammalian cell entry related domain protein  59.73 
 
 
293 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1696  Mammalian cell entry related domain protein  58.36 
 
 
293 aa  355  3.9999999999999996e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1243  hypothetical protein  26.67 
 
 
360 aa  129  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0926  mce-related protein  26.39 
 
 
360 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4517  hypothetical protein  25.56 
 
 
359 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3214  hypothetical protein  26.65 
 
 
360 aa  123  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0495  Mammalian cell entry related domain protein  26.36 
 
 
360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2541  virulence factor MCE-like protein-related protein  23.89 
 
 
360 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143277  hitchhiker  0.00000000000784881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4901  Mammalian cell entry related domain protein  27.42 
 
 
328 aa  99.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.374077  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1867  Mammalian cell entry related domain protein  28.52 
 
 
316 aa  98.2  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.449047  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3636  Mammalian cell entry related domain protein  27.12 
 
 
321 aa  95.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.676726 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  28.85 
 
 
337 aa  89.7  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11078  hypothetical protein  27.6 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0795  Mammalian cell entry related domain protein  24.16 
 
 
328 aa  82  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4584  hypothetical protein  27.88 
 
 
321 aa  82  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6192  Mammalian cell entry related domain protein  27.33 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2344  Mammalian cell entry related domain protein  24.01 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1272  virulence factor MCE-like protein-related protein  23.63 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.821992  hitchhiker  0.0000000117847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1810  Mammalian cell entry related domain protein  28.06 
 
 
341 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4316  hypothetical protein  27.27 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209742  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  23.23 
 
 
349 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0751  ABC transporter permease  26.62 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221313  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1899  virulence factor Mce family protein  23.55 
 
 
349 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5281  Mammalian cell entry related domain protein  24.89 
 
 
340 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.192594 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0638  hypothetical protein  23.71 
 
 
306 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.498696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3316  Mammalian cell entry related domain protein  28.22 
 
 
266 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635964  hitchhiker  0.0000217652 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2984  ABC transporter, permease component  24.64 
 
 
325 aa  60.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395413  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  24.22 
 
 
430 aa  59.3  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2113  Mammalian cell entry related domain protein  28.06 
 
 
316 aa  58.5  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202192  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1049  hypothetical protein  34.19 
 
 
292 aa  57.4  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460957 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  22.36 
 
 
529 aa  57.4  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1508  Mammalian cell entry related domain protein  28.77 
 
 
356 aa  57  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.577537 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  22.66 
 
 
515 aa  56.6  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3566  hypothetical protein  26.05 
 
 
312 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46814  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2733  Mammalian cell entry related domain protein  27.4 
 
 
356 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0687  hypothetical protein  23.93 
 
 
332 aa  54.3  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3390  Mammalian cell entry related domain protein  23.9 
 
 
317 aa  53.9  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0881876 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0575  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  24.12 
 
 
288 aa  52.8  0.000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0707  Mammalian cell entry related domain protein  20.79 
 
 
362 aa  52.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.886561  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3702  hypothetical protein  30.43 
 
 
149 aa  52.4  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0384  Mammalian cell entry related domain protein  26.52 
 
 
152 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.214826 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  23.75 
 
 
312 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  23.75 
 
 
312 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1007  Mammalian cell entry related domain protein  32.09 
 
 
152 aa  50.8  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.063355  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0403  hypothetical protein  31.25 
 
 
146 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304841  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1156  Mammalian cell entry related domain protein  25.68 
 
 
313 aa  50.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3307  Mammalian cell entry related domain protein  22.9 
 
 
339 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185146  normal  0.246163 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0031  hypothetical protein  25.56 
 
 
305 aa  49.3  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.929118  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  24.6 
 
 
312 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0838  virulence factor Mce family protein  27.12 
 
 
523 aa  47.4  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1894  hypothetical protein  21.69 
 
 
324 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276188  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0449  ABC-type transport system protein  30.09 
 
 
148 aa  46.6  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.58514e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  24.03 
 
 
312 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  23.05 
 
 
312 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1015  hypothetical protein  29.25 
 
 
321 aa  46.6  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1818  hypothetical protein  29.92 
 
 
148 aa  45.8  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1967  hypothetical protein  30.43 
 
 
166 aa  45.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.539275  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1435  hypothetical protein  23.18 
 
 
313 aa  45.4  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0152442  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0475  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  23.23 
 
 
304 aa  44.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.848355  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0854  Mammalian cell entry related domain protein  26.67 
 
 
148 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.102404 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  30 
 
 
148 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2218  hypothetical protein  28.68 
 
 
154 aa  43.9  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2891  Mammalian cell entry related domain protein  29.82 
 
 
175 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  22.68 
 
 
305 aa  43.5  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0815  mce-related protein  25.66 
 
 
149 aa  42.7  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3569  Mammalian cell entry related domain protein  28.07 
 
 
186 aa  42.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424468  hitchhiker  0.0000173433 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>