214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2733 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2733  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 		 356 aa  691    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1508  Mammalian cell entry related domain protein  96.63 
 
 		 356 aa  675    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.577537 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  69.1 
 
 		 349 aa  502  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1899  virulence factor Mce family protein  63.48 
 
 		 349 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1272  virulence factor MCE-like protein-related protein  63.56 
 
 		 347 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.821992  hitchhiker  0.0000000117847 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0687  hypothetical protein  26.08 
 
 		 332 aa  139  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4517  hypothetical protein  25.57 
 
 		 359 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  25.14 
 
 		 529 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0838  virulence factor Mce family protein  25.5 
 
 		 523 aa  108  2e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3214  hypothetical protein  28.24 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4901  Mammalian cell entry related domain protein  27.52 
 
 		 328 aa  99.8  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.374077  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0926  mce-related protein  28.31 
 
 		 360 aa  98.6  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1243  hypothetical protein  25.9 
 
 		 360 aa  97.1  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0495  Mammalian cell entry related domain protein  27.35 
 
 		 360 aa  91.3  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3636  Mammalian cell entry related domain protein  27.89 
 
 		 321 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.676726 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2541  virulence factor MCE-like protein-related protein  25.35 
 
 		 360 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143277  hitchhiker  0.00000000000784881 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  24.63 
 
 		 515 aa  80.9  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  22.82 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5281  Mammalian cell entry related domain protein  24.06 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.192594 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0795  Mammalian cell entry related domain protein  22.47 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1810  Mammalian cell entry related domain protein  22.33 
 
 		 341 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2984  ABC transporter, permease component  22.78 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  28.95 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6192  Mammalian cell entry related domain protein  23.55 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0854  Mammalian cell entry related domain protein  36.52 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.102404 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  24.43 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2985  virulence factor Mce family protein  33.88 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1867  Mammalian cell entry related domain protein  23.28 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.449047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3316  Mammalian cell entry related domain protein  25.89 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635964  hitchhiker  0.0000217652 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  26.76 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0440  VpsC protein  31.11 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09350  virulence factor Mce family protein  25.09 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.960251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0009  virulence factor Mce family protein  32.74 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2113  Mammalian cell entry related domain protein  26.81 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202192  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0707  Mammalian cell entry related domain protein  22.76 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.886561  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  31.19 
 
 		 148 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0960  virulence factor Mce family protein  31.86 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  25.63 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  31.37 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0403  hypothetical protein  30.71 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3183  Mammalian cell entry related domain protein  33.08 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1639  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  27.64 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0751  ABC transporter permease  25.39 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0710  virulence factor Mce family protein  28.81 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.476442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4584  hypothetical protein  23.02 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2344  Mammalian cell entry related domain protein  22.59 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3307  Mammalian cell entry related domain protein  23.75 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185146  normal  0.246163 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0815  mce-related protein  29.37 
 
 		 149 aa  57  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  29.8 
 
 		 307 aa  57  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2008  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  30.39 
 
 		 296 aa  57  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4316  hypothetical protein  23.83 
 
 		 279 aa  57  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209742  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1873  Mammalian cell entry related domain protein  20.6 
 
 		 293 aa  57  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0923  virulence factor Mce family protein  29.84 
 
 		 343 aa  57  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.771537 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4603  virulence factor Mce family protein  31.62 
 
 		 346 aa  57  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0135  virulence factor Mce family protein  27.97 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0705  virulence factor Mce family protein  23.41 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0364  virulence factor Mce family protein  29.41 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3827  virulence factor Mce family protein  26.19 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3022  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component-like protein  24.02 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  28.5 
 
 		 307 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03181  ABC transporter substrate-binding protein  27.71 
 
 		 308 aa  55.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721062  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0161  Mammalian cell entry related domain protein  21.38 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0090  mce related protein  24.7 
 
 		 313 aa  55.8  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2102  virulence factor Mce family protein  28.24 
 
 		 343 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0525635  normal  0.778813 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1894  hypothetical protein  26.54 
 
 		 324 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276188  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0661  hypothetical protein  27.66 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  22.08 
 
 		 579 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1557  virulence factor Mce family protein  30.77 
 
 		 343 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0110  virulence factor Mce family protein  28.18 
 
 		 528 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.434607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0709  virulence factor Mce family protein  26.85 
 
 		 523 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.936925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0893  hypothetical protein  24 
 
 		 360 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.932259  normal  0.840241 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0786  virulence factor MCE-like protein-related protein  29.37 
 
 		 150 aa  53.9  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0853  Mammalian cell entry related domain protein  24 
 
 		 360 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.0740756 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4169  virulence factor Mce family protein  28.46 
 
 		 342 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0120  virulence factor MCE-like protein  28.18 
 
 		 528 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11078  hypothetical protein  21.73 
 
 		 316 aa  53.5  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0129  virulence factor Mce family protein  28.18 
 
 		 528 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.54103  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1110  Mammalian cell entry related domain protein  33.33 
 
 		 196 aa  53.1  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820134  normal  0.240411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0819  Mammalian cell entry related domain protein  23.64 
 
 		 360 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.940856  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4398  virulence factor Mce family protein  28 
 
 		 342 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  29.89 
 
 		 310 aa  53.1  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  24.01 
 
 		 308 aa  53.1  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  24.01 
 
 		 308 aa  52.8  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4615  virulence factor MCE-like protein  21.68 
 
 		 352 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4703  virulence factor Mce family protein  21.68 
 
 		 352 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.293736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1015  hypothetical protein  29.57 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10171  MCE-family protein mce1B  22.81 
 
 		 346 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5201  virulence factor Mce family protein  24.64 
 
 		 341 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.922675  normal  0.183603 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2254  Mammalian cell entry related domain protein  24.57 
 
 		 292 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.371924  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1049  hypothetical protein  20.33 
 
 		 292 aa  51.6  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460957 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13532  MCE-family protein mce4B  30.51 
 
 		 350 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717957 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1526  hypothetical protein  21.86 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0265226  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10172  MCE-family protein mce1C  28.57 
 
 		 515 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30 
 
 		 275 aa  52  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  23.36 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3743  virulence factor Mce family protein  24.18 
 
 		 341 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03730  virulence factor Mce family protein  33.71 
 
 		 343 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.918695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1696  Mammalian cell entry related domain protein  24.38 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3683  virulence factor Mce family protein  24.18 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.264066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4997  virulence factor Mce family protein  22.05 
 
 		 463 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.430498 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>