More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1110 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1110  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 		 196 aa  389  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820134  normal  0.240411 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0171  hypothetical protein  46.46 
 
 		 166 aa  117  9e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3296  hypothetical protein  44.6 
 
 		 164 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1451  hypothetical protein  47.15 
 
 		 156 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.813641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0194  ABC transporter substrate-binding protein  49.55 
 
 		 156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.176856  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1827  hypothetical protein  48.65 
 
 		 156 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.607055 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1268  hypothetical protein  48.6 
 
 		 155 aa  106  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1521  hypothetical protein  42.14 
 
 		 150 aa  104  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.661029  normal  0.423884 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1391  hypothetical protein  40 
 
 		 148 aa  102  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0160  mce-related protein  35.17 
 
 		 152 aa  102  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0339  Mammalian cell entry related domain protein  35.17 
 
 		 152 aa  102  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.620596 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2438  hypothetical protein  39.58 
 
 		 151 aa  100  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.284994  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0739  Mammalian cell entry related domain protein  39.04 
 
 		 152 aa  97.1  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.942465  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0761  Mammalian cell entry related domain protein  39.29 
 
 		 145 aa  96.3  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2784  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component  40.28 
 
 		 155 aa  96.3  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162084  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2719  hypothetical protein  38.13 
 
 		 151 aa  94  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.46934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1750  hypothetical protein  38 
 
 		 178 aa  92.4  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4445  mce-related protein  44.14 
 
 		 155 aa  92  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4139  hypothetical protein  43.24 
 
 		 155 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0534  Mammalian cell entry related domain protein  39.71 
 
 		 150 aa  91.3  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0384  Mammalian cell entry related domain protein  38.57 
 
 		 152 aa  90.5  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.214826 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3400  hypothetical protein  41.67 
 
 		 156 aa  90.5  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0865  hypothetical protein  45.05 
 
 		 155 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1007  Mammalian cell entry related domain protein  29.14 
 
 		 152 aa  90.9  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.063355  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0021  Mammalian cell entry related domain protein  41.54 
 
 		 155 aa  90.5  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.579673  normal  0.0449568 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2554  hypothetical protein  40.38 
 
 		 164 aa  90.1  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  38.06 
 
 		 148 aa  89.4  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0967  hypothetical protein  42.34 
 
 		 161 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0960  hypothetical protein  42.34 
 
 		 161 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0981  hypothetical protein  34 
 
 		 158 aa  87.4  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0999  hypothetical protein  42.34 
 
 		 160 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0449  ABC-type transport system protein  31.94 
 
 		 148 aa  87  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.58514e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2747  hypothetical protein  34.48 
 
 		 161 aa  86.7  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4018  Mammalian cell entry related domain protein  36.3 
 
 		 174 aa  85.9  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.129238  normal  0.186584 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4255  hypothetical protein  41.44 
 
 		 161 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1330  hypothetical protein  36.5 
 
 		 168 aa  85.5  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.519307  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2960  signal peptide protein  36.55 
 
 		 173 aa  85.1  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2411  hypothetical protein  36.17 
 
 		 154 aa  84.7  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108225  normal  0.153742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5026  hypothetical protein  39.64 
 
 		 157 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57850  hypothetical protein  39.64 
 
 		 157 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2937  hypothetical protein  39.29 
 
 		 162 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.887715  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0854  Mammalian cell entry related domain protein  40 
 
 		 148 aa  84  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.102404 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0878  hypothetical protein  38.4 
 
 		 156 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.600632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0239  hypothetical protein  34.93 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.852395 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12870  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, substrate binding protein  39.64 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1576  hypothetical protein  38.81 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.667817  normal  0.289363 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2118  hypothetical protein  35.62 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2707  hypothetical protein  35.66 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3120  hypothetical protein  33.79 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771354  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2221  hypothetical protein  35.81 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.693824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2891  Mammalian cell entry related domain protein  33.79 
 
 		 175 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0687  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0815  mce-related protein  35.17 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2439  hypothetical protein  41.12 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0222447  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0098  hypothetical protein  37.96 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.334829  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1818  toluene tolerance protein  39.16 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2218  hypothetical protein  36.99 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3238  Mammalian cell entry related domain protein  33.1 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1818  hypothetical protein  36.99 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2768  hypothetical protein  39.81 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0097  Mammalian cell entry related domain protein  37.04 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000148019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3183  Mammalian cell entry related domain protein  37.07 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1967  hypothetical protein  34.72 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.539275  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0890  Mammalian cell entry related domain protein  33.33 
 
 		 156 aa  77.4  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2691  hypothetical protein  36.05 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0995365  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0395  hypothetical protein  36.05 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3702  hypothetical protein  30.5 
 
 		 149 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0416  hypothetical protein  36.05 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249405  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0319  hypothetical protein  39.81 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0287402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03209  toluene tolerance protein  39.45 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1105  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  29.66 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.165504  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2399  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  77  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0403  hypothetical protein  32.64 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1156  Mammalian cell entry related domain protein  33.1 
 
 		 163 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482142  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0343  hypothetical protein  36.05 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.908048  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3569  Mammalian cell entry related domain protein  37.96 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424468  hitchhiker  0.0000173433 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1015  hypothetical protein  36.61 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1898  putative ABC transporter substrate-binding protein  32.94 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1041  hypothetical protein  34.53 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3514  ABC transporter, inner membrane subunit  35.37 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.531635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0334  hypothetical protein  36.05 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0389  putative signal peptide protein, toluene tolerance Ttg2C-like  37.96 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3257  hypothetical protein  33.93 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3392  hypothetical protein  36.51 
 
 		 160 aa  74.3  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3002  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.96 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.784047  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3503  Mce family protein  32.43 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.869463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0795  hypothetical protein  37.04 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3670  Mce family protein  32.43 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0296035 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0718  Mammalian cell entry related domain protein  35.19 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3501  Mce family protein  32.43 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0513461  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3608  Mce family protein  32.43 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.345737 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3572  Mce family protein  32.43 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2724  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.96 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3702  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.96 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2774  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.96 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3675  mce family protein  37.96 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.090883  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0750  hypothetical protein  35.19 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3733  mce family protein  37.96 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.96 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42671  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1779  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.96 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>