276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1451 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1451  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  302  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.813641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0194  ABC transporter substrate-binding protein  89.54 
 
 		 156 aa  249  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.176856  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1827  hypothetical protein  88.89 
 
 		 156 aa  248  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.607055 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1521  hypothetical protein  64.19 
 
 		 150 aa  185  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.661029  normal  0.423884 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1391  hypothetical protein  61.81 
 
 		 148 aa  183  8e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1268  hypothetical protein  59.03 
 
 		 155 aa  149  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2719  hypothetical protein  53.47 
 
 		 151 aa  140  7e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.46934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3296  hypothetical protein  47.48 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1330  hypothetical protein  43.17 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.519307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1576  hypothetical protein  41.73 
 
 		 172 aa  110  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.667817  normal  0.289363 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1110  Mammalian cell entry related domain protein  47.15 
 
 		 196 aa  110  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820134  normal  0.240411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2554  hypothetical protein  40 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2438  hypothetical protein  40.88 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.284994  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0171  hypothetical protein  39.74 
 
 		 166 aa  87  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0339  Mammalian cell entry related domain protein  36.09 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.620596 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0160  mce-related protein  36.09 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1750  hypothetical protein  37.24 
 
 		 178 aa  84  7e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0021  Mammalian cell entry related domain protein  39.1 
 
 		 155 aa  83.6  9e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.579673  normal  0.0449568 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1818  toluene tolerance protein  41.82 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3702  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2707  hypothetical protein  33.79 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2439  hypothetical protein  36 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0222447  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2118  hypothetical protein  34.46 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0449  ABC-type transport system protein  35.51 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.58514e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2411  hypothetical protein  30.92 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108225  normal  0.153742 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0854  Mammalian cell entry related domain protein  31.54 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.102404 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1818  hypothetical protein  33.55 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0534  Mammalian cell entry related domain protein  37.17 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2784  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component  33.11 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162084  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0687  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0384  Mammalian cell entry related domain protein  30.71 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.214826 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  34.91 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2937  hypothetical protein  32.21 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.887715  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0761  Mammalian cell entry related domain protein  36.36 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0815  mce-related protein  33.04 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1105  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  32.09 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.165504  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2221  hypothetical protein  37.72 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.693824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5534  hypothetical protein  31.33 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.264569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03209  toluene tolerance protein  37.07 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1015  hypothetical protein  33.56 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1007  Mammalian cell entry related domain protein  32.71 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.063355  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4445  mce-related protein  39.09 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4139  hypothetical protein  38.18 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1156  Mammalian cell entry related domain protein  30.87 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482142  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0865  hypothetical protein  38.05 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0739  Mammalian cell entry related domain protein  35.51 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.942465  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0795  hypothetical protein  31.54 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0718  Mammalian cell entry related domain protein  31.79 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2399  hypothetical protein  29.66 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2885  hypothetical protein  31.13 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.827962  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0750  hypothetical protein  31.79 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4018  Mammalian cell entry related domain protein  38.53 
 
 		 174 aa  67.4  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.129238  normal  0.186584 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0960  hypothetical protein  36.36 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12870  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, substrate binding protein  35.65 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3183  Mammalian cell entry related domain protein  32.41 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3392  hypothetical protein  33.9 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002411  uncharacterized ABC transporter, periplasmic component YrbD  29.79 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1041  hypothetical protein  31.78 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2960  signal peptide protein  31.97 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57850  hypothetical protein  36.11 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5026  hypothetical protein  36.11 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03656  hypothetical protein  28.87 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0999  hypothetical protein  35.45 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0967  hypothetical protein  35.45 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0527  mce-related protein  28.26 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2891  Mammalian cell entry related domain protein  30.26 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4255  hypothetical protein  36.36 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3238  Mammalian cell entry related domain protein  30.26 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2768  hypothetical protein  29.53 
 
 		 184 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3569  Mammalian cell entry related domain protein  33.33 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424468  hitchhiker  0.0000173433 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0981  hypothetical protein  30.14 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0343  hypothetical protein  35.96 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.908048  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0098  hypothetical protein  32.43 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.334829  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0786  virulence factor MCE-like protein-related protein  33.33 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0389  putative signal peptide protein, toluene tolerance Ttg2C-like  33.33 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0878  hypothetical protein  36.11 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.600632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0319  hypothetical protein  34.23 
 
 		 187 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0287402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2691  hypothetical protein  35.78 
 
 		 189 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0995365  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0395  hypothetical protein  35.78 
 
 		 187 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0416  hypothetical protein  35.78 
 
 		 189 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249405  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0687  hypothetical protein  31.41 
 
 		 332 aa  61.6  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1967  hypothetical protein  33.04 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.539275  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2218  hypothetical protein  33.56 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0334  hypothetical protein  35.96 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0403  hypothetical protein  31.48 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0474  hypothetical protein  33.88 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000014845  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0560  hypothetical protein  29.46 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000625618  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0239  hypothetical protein  31.36 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.852395 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0097  Mammalian cell entry related domain protein  29.73 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000148019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3002  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.94 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.784047  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0559  hypothetical protein  29.14 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3120  hypothetical protein  30.14 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771354  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3514  ABC transporter, inner membrane subunit  34.86 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.531635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2854  virulence factor Mce family protein  40.54 
 
 		 491 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370612  normal  0.383005 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2100  hypothetical protein  32.88 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3099  putative ABC transport system substrate-binding protein  32.48 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.369391  normal  0.460198 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4358  hypothetical protein  27.15 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52116  normal  0.0531845 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.94 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42671  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2724  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.94 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3733  mce family protein  33.94 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>