238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_4018 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_4018  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 
174 aa  344  4e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.129238  normal  0.186584 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1750  hypothetical protein  76 
 
 
178 aa  239  1e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03209  toluene tolerance protein  78.26 
 
 
183 aa  230  6e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1818  toluene tolerance protein  76 
 
 
178 aa  219  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0160  mce-related protein  46.94 
 
 
152 aa  131  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0339  Mammalian cell entry related domain protein  46.94 
 
 
152 aa  131  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.620596 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1967  hypothetical protein  42.21 
 
 
166 aa  128  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.539275  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0384  Mammalian cell entry related domain protein  43.15 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.214826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3569  Mammalian cell entry related domain protein  43.71 
 
 
186 aa  124  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424468  hitchhiker  0.0000173433 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0761  Mammalian cell entry related domain protein  43.15 
 
 
145 aa  123  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0389  putative signal peptide protein, toluene tolerance Ttg2C-like  41.67 
 
 
181 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2768  hypothetical protein  42.38 
 
 
184 aa  121  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422541  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3238  Mammalian cell entry related domain protein  38.07 
 
 
175 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.303674  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2411  hypothetical protein  39.33 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108225  normal  0.153742 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0739  Mammalian cell entry related domain protein  41.26 
 
 
152 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.942465  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2891  Mammalian cell entry related domain protein  37.5 
 
 
175 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0981  hypothetical protein  39.35 
 
 
158 aa  117  7e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2221  hypothetical protein  42.07 
 
 
153 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.693824  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0890  Mammalian cell entry related domain protein  43.15 
 
 
156 aa  115  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2960  signal peptide protein  41.22 
 
 
173 aa  114  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432073  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2784  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component  39.22 
 
 
155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162084  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1898  putative ABC transporter substrate-binding protein  42.96 
 
 
155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2691  hypothetical protein  38.67 
 
 
189 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0995365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0416  hypothetical protein  38.67 
 
 
189 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249405  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0343  hypothetical protein  38.46 
 
 
187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.908048  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2118  hypothetical protein  41.26 
 
 
151 aa  110  7.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3120  hypothetical protein  39.86 
 
 
173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771354  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0239  hypothetical protein  38.12 
 
 
164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.852395 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0334  hypothetical protein  38.46 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0395  hypothetical protein  38.51 
 
 
187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147868  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2747  hypothetical protein  36.13 
 
 
161 aa  108  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3514  ABC transporter, inner membrane subunit  38.51 
 
 
184 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.531635  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0171  hypothetical protein  41.01 
 
 
166 aa  107  9.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1007  Mammalian cell entry related domain protein  34.23 
 
 
152 aa  106  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.063355  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0319  hypothetical protein  45.54 
 
 
187 aa  104  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0287402  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  42.55 
 
 
148 aa  104  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03656  hypothetical protein  36.36 
 
 
165 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3002  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40 
 
 
176 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.784047  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0878  hypothetical protein  39.86 
 
 
156 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.600632  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0449  ABC-type transport system protein  38.46 
 
 
148 aa  102  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.58514e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002411  uncharacterized ABC transporter, periplasmic component YrbD  35.67 
 
 
162 aa  102  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0718  Mammalian cell entry related domain protein  37.97 
 
 
161 aa  102  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3257  hypothetical protein  41.22 
 
 
179 aa  101  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5534  hypothetical protein  38.78 
 
 
161 aa  101  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.264569  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0750  hypothetical protein  37.97 
 
 
161 aa  101  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3702  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.67 
 
 
188 aa  101  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0724  hypothetical protein  42.67 
 
 
157 aa  101  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.150028 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0694  hypothetical protein  42.67 
 
 
157 aa  101  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2774  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.67 
 
 
186 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12870  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, substrate binding protein  39.86 
 
 
156 aa  101  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0715  Mammalian cell entry related domain protein  42.67 
 
 
157 aa  101  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425168 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3675  mce family protein  40.67 
 
 
189 aa  101  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.090883  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3733  mce family protein  40.67 
 
 
186 aa  101  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.67 
 
 
186 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42671  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1779  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.67 
 
 
186 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3660  hypothetical protein  42.67 
 
 
157 aa  101  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0108071  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0854  Mammalian cell entry related domain protein  42.66 
 
 
148 aa  100  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.102404 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3400  hypothetical protein  41.22 
 
 
156 aa  100  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2399  hypothetical protein  40 
 
 
156 aa  100  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3952  mce-related protein  42 
 
 
157 aa  99.8  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4445  mce-related protein  46.09 
 
 
155 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2724  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.54 
 
 
184 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1171  hypothetical protein  37.67 
 
 
168 aa  99.8  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0681  hypothetical protein  42 
 
 
157 aa  99.4  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.726556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3341  hypothetical protein  42 
 
 
157 aa  99.4  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.480692 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0680  hypothetical protein  42 
 
 
157 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.0968495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1156  Mammalian cell entry related domain protein  37.84 
 
 
163 aa  99.8  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482142  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0999  hypothetical protein  45.05 
 
 
160 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0723  hypothetical protein  42.67 
 
 
157 aa  99.8  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4255  hypothetical protein  45.87 
 
 
161 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4139  hypothetical protein  45.22 
 
 
155 aa  99  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4358  hypothetical protein  40 
 
 
183 aa  99  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52116  normal  0.0531845 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0687  hypothetical protein  39.26 
 
 
169 aa  99  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5026  hypothetical protein  41.96 
 
 
157 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57850  hypothetical protein  41.96 
 
 
157 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3296  hypothetical protein  41.13 
 
 
164 aa  98.2  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0960  hypothetical protein  44.14 
 
 
161 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3079  mce-related protein  41.33 
 
 
156 aa  97.4  9e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.185697 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03184  mce family protein  38 
 
 
157 aa  97.1  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3806  Mammalian cell entry related domain protein  33.73 
 
 
214 aa  97.1  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0010771  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2937  hypothetical protein  38.03 
 
 
162 aa  97.1  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.887715  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0967  hypothetical protein  44.14 
 
 
161 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1818  hypothetical protein  40.56 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0534  Mammalian cell entry related domain protein  39.31 
 
 
150 aa  96.3  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2707  hypothetical protein  38.13 
 
 
149 aa  96.3  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3607  hypothetical protein  41.33 
 
 
156 aa  95.5  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0097  Mammalian cell entry related domain protein  40.83 
 
 
160 aa  95.9  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000148019  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0795  hypothetical protein  39.44 
 
 
168 aa  94.7  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0865  hypothetical protein  44.14 
 
 
155 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3648  Mammalian cell entry related domain protein  34.29 
 
 
190 aa  94.4  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0474  hypothetical protein  39.29 
 
 
164 aa  93.2  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000014845  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0098  hypothetical protein  40.87 
 
 
160 aa  93.6  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.334829  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0559  hypothetical protein  40.82 
 
 
154 aa  93.2  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2885  hypothetical protein  38.41 
 
 
160 aa  92.4  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.827962  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1268  hypothetical protein  45.37 
 
 
155 aa  91.7  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1015  hypothetical protein  43.12 
 
 
163 aa  90.9  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4231  hypothetical protein  39.6 
 
 
155 aa  90.5  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0707498  hitchhiker  0.000253037 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2218  hypothetical protein  34.25 
 
 
154 aa  89.7  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0283  Mammalian cell entry related domain protein  33.72 
 
 
188 aa  88.6  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1576  hypothetical protein  45.37 
 
 
172 aa  88.2  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.667817  normal  0.289363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>