More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0854 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0854  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 		 148 aa  291  3e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.102404 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1818  hypothetical protein  81.08 
 
 		 148 aa  241  3e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  74.32 
 
 		 148 aa  221  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0534  Mammalian cell entry related domain protein  65.52 
 
 		 150 aa  187  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0815  mce-related protein  54.73 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1041  hypothetical protein  57.72 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0786  virulence factor MCE-like protein-related protein  57.05 
 
 		 150 aa  158  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3183  Mammalian cell entry related domain protein  54.36 
 
 		 150 aa  156  9e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0449  ABC-type transport system protein  49.66 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.58514e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0560  hypothetical protein  53.15 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000625618  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0403  hypothetical protein  48.97 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1007  Mammalian cell entry related domain protein  43.06 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.063355  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0474  hypothetical protein  45.27 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000014845  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3702  hypothetical protein  41.38 
 
 		 149 aa  117  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2691  hypothetical protein  41.78 
 
 		 189 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0995365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0416  hypothetical protein  41.78 
 
 		 189 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249405  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0395  hypothetical protein  41.78 
 
 		 187 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2768  hypothetical protein  39.73 
 
 		 184 aa  104  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0384  Mammalian cell entry related domain protein  41.1 
 
 		 152 aa  104  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.214826 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0343  hypothetical protein  40.41 
 
 		 187 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.908048  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0160  mce-related protein  36.3 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0339  Mammalian cell entry related domain protein  36.3 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.620596 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2960  signal peptide protein  41.1 
 
 		 173 aa  101  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0389  putative signal peptide protein, toluene tolerance Ttg2C-like  39.04 
 
 		 181 aa  101  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3514  ABC transporter, inner membrane subunit  40.41 
 
 		 184 aa  101  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.531635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0334  hypothetical protein  40.41 
 
 		 187 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0098  hypothetical protein  43.15 
 
 		 160 aa  99.8  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.334829  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2118  hypothetical protein  41.1 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2891  Mammalian cell entry related domain protein  39.73 
 
 		 175 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3120  hypothetical protein  37.67 
 
 		 173 aa  98.2  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771354  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3569  Mammalian cell entry related domain protein  38.78 
 
 		 186 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424468  hitchhiker  0.0000173433 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0761  Mammalian cell entry related domain protein  40.58 
 
 		 145 aa  97.8  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3238  Mammalian cell entry related domain protein  39.73 
 
 		 175 aa  98.2  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2784  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component  39.01 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162084  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1967  hypothetical protein  36.49 
 
 		 166 aa  94.4  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.539275  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0718  Mammalian cell entry related domain protein  37.41 
 
 		 161 aa  94.4  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0750  hypothetical protein  37.41 
 
 		 161 aa  93.6  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0739  Mammalian cell entry related domain protein  38.89 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.942465  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4018  Mammalian cell entry related domain protein  47.27 
 
 		 174 aa  92.8  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.129238  normal  0.186584 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0097  Mammalian cell entry related domain protein  40.14 
 
 		 160 aa  93.2  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000148019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2399  hypothetical protein  35.37 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1750  hypothetical protein  38.46 
 
 		 178 aa  93.2  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2937  hypothetical protein  36.3 
 
 		 162 aa  91.7  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.887715  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1268  hypothetical protein  41.12 
 
 		 155 aa  91.7  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0795  hypothetical protein  38.36 
 
 		 168 aa  90.9  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2411  hypothetical protein  38.67 
 
 		 154 aa  90.9  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108225  normal  0.153742 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2218  hypothetical protein  36.17 
 
 		 154 aa  90.5  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0171  hypothetical protein  41.38 
 
 		 166 aa  90.1  9e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2747  hypothetical protein  36.99 
 
 		 161 aa  89.7  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03209  toluene tolerance protein  45.45 
 
 		 183 aa  89.7  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1898  putative ABC transporter substrate-binding protein  36.73 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3002  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.73 
 
 		 176 aa  89  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.784047  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3296  hypothetical protein  43.52 
 
 		 164 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  38.41 
 
 		 529 aa  89.4  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2724  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.73 
 
 		 184 aa  88.2  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3702  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.73 
 
 		 188 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3675  mce family protein  39.73 
 
 		 189 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.090883  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.73 
 
 		 186 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42671  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2774  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.73 
 
 		 186 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3733  mce family protein  39.73 
 
 		 186 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1779  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.73 
 
 		 186 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1156  Mammalian cell entry related domain protein  34.93 
 
 		 163 aa  87.8  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482142  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1818  toluene tolerance protein  43.64 
 
 		 178 aa  87  7e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0890  Mammalian cell entry related domain protein  37.67 
 
 		 156 aa  87  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0319  hypothetical protein  40.32 
 
 		 187 aa  87  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0287402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5534  hypothetical protein  34.69 
 
 		 161 aa  86.7  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.264569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3257  hypothetical protein  39.04 
 
 		 179 aa  85.5  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0021  Mammalian cell entry related domain protein  35.86 
 
 		 155 aa  84  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.579673  normal  0.0449568 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3099  putative ABC transport system substrate-binding protein  40.41 
 
 		 160 aa  84  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.369391  normal  0.460198 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1171  hypothetical protein  34.93 
 
 		 168 aa  84  7e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2707  hypothetical protein  34.46 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2221  hypothetical protein  35.46 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.693824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1110  Mammalian cell entry related domain protein  40 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820134  normal  0.240411 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0687  hypothetical protein  34.25 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0878  hypothetical protein  36 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.600632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3392  hypothetical protein  37.41 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0559  hypothetical protein  37.33 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0239  hypothetical protein  31.51 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.852395 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3400  hypothetical protein  37.41 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0999  hypothetical protein  41.74 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03058  predicted ABC-type organic solvent transporter  35.29 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0328967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0514  Mammalian cell entry related domain protein  35.29 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0145877  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3681  Mce family protein  35.29 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0116721  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0981  hypothetical protein  35.71 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4515  Mce family protein  35.29 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0766033  normal  0.489861 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3386  Mce family protein  35.29 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000578801  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3577  Mce family protein  35.29 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.45422  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3489  Mce family protein  35.29 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03009  hypothetical protein  35.29 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0277207  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0507  hypothetical protein  35.29 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.945849  normal  0.16691 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0967  hypothetical protein  41.74 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03184  mce family protein  34 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0960  hypothetical protein  40.87 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1827  hypothetical protein  36.7 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.607055 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3607  hypothetical protein  38.19 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4358  hypothetical protein  32.24 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52116  normal  0.0531845 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0450  mce family protein  32.03 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.132036  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0514  hypothetical protein  32.03 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449918  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1391  hypothetical protein  36.36 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12870  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, substrate binding protein  34.67 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>