More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1818 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1818  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  291  3e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0854  Mammalian cell entry related domain protein  81.08 
 
 		 148 aa  241  3e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.102404 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  66.89 
 
 		 148 aa  204  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0534  Mammalian cell entry related domain protein  63.7 
 
 		 150 aa  180  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1041  hypothetical protein  57.05 
 
 		 150 aa  164  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0815  mce-related protein  54.73 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3183  Mammalian cell entry related domain protein  51.68 
 
 		 150 aa  154  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0449  ABC-type transport system protein  51.03 
 
 		 148 aa  154  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.58514e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0786  virulence factor MCE-like protein-related protein  53.69 
 
 		 150 aa  153  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0560  hypothetical protein  51.75 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000625618  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1007  Mammalian cell entry related domain protein  43.54 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.063355  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0403  hypothetical protein  48.97 
 
 		 146 aa  130  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0474  hypothetical protein  48.99 
 
 		 164 aa  127  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000014845  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3702  hypothetical protein  42.96 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2118  hypothetical protein  43.15 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2768  hypothetical protein  37.67 
 
 		 184 aa  102  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2691  hypothetical protein  39.04 
 
 		 189 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0995365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0416  hypothetical protein  39.04 
 
 		 189 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249405  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0395  hypothetical protein  39.04 
 
 		 187 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3569  Mammalian cell entry related domain protein  38.36 
 
 		 186 aa  100  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424468  hitchhiker  0.0000173433 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2960  signal peptide protein  38.36 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3514  ABC transporter, inner membrane subunit  37.67 
 
 		 184 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.531635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0389  putative signal peptide protein, toluene tolerance Ttg2C-like  36.99 
 
 		 181 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0343  hypothetical protein  37.67 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.908048  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0334  hypothetical protein  37.67 
 
 		 187 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2411  hypothetical protein  39.33 
 
 		 154 aa  98.6  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108225  normal  0.153742 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0384  Mammalian cell entry related domain protein  40 
 
 		 152 aa  98.2  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.214826 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0160  mce-related protein  36.99 
 
 		 152 aa  98.2  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0339  Mammalian cell entry related domain protein  36.99 
 
 		 152 aa  98.2  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.620596 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1967  hypothetical protein  36.49 
 
 		 166 aa  97.8  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.539275  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0761  Mammalian cell entry related domain protein  38.24 
 
 		 145 aa  95.9  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2891  Mammalian cell entry related domain protein  35.62 
 
 		 175 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3238  Mammalian cell entry related domain protein  35.62 
 
 		 175 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1750  hypothetical protein  37.76 
 
 		 178 aa  95.1  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2218  hypothetical protein  36.17 
 
 		 154 aa  94.4  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0098  hypothetical protein  37.67 
 
 		 160 aa  94.4  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.334829  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0097  Mammalian cell entry related domain protein  36.99 
 
 		 160 aa  93.2  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000148019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1898  putative ABC transporter substrate-binding protein  36.05 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2784  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component  36.88 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162084  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0171  hypothetical protein  40.52 
 
 		 166 aa  90.9  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3120  hypothetical protein  33.56 
 
 		 173 aa  90.9  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771354  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4018  Mammalian cell entry related domain protein  44.55 
 
 		 174 aa  89.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.129238  normal  0.186584 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2747  hypothetical protein  36.3 
 
 		 161 aa  89.4  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3296  hypothetical protein  40 
 
 		 164 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2937  hypothetical protein  33.56 
 
 		 162 aa  88.2  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.887715  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0718  Mammalian cell entry related domain protein  34.69 
 
 		 161 aa  87.4  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1818  toluene tolerance protein  40.91 
 
 		 178 aa  87.4  6e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0750  hypothetical protein  34.69 
 
 		 161 aa  87  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2399  hypothetical protein  31.97 
 
 		 156 aa  87  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0739  Mammalian cell entry related domain protein  36.11 
 
 		 152 aa  86.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.942465  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2724  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.67 
 
 		 184 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03209  toluene tolerance protein  41.82 
 
 		 183 aa  86.3  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3702  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.67 
 
 		 188 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3002  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.67 
 
 		 176 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.784047  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0795  hypothetical protein  34.93 
 
 		 168 aa  86.3  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.67 
 
 		 186 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42671  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2221  hypothetical protein  36.88 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.693824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3733  mce family protein  37.67 
 
 		 186 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3675  mce family protein  37.67 
 
 		 189 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.090883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2774  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.67 
 
 		 186 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1779  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.67 
 
 		 186 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0890  Mammalian cell entry related domain protein  35.62 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03184  mce family protein  38.41 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1268  hypothetical protein  38.32 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3257  hypothetical protein  36.99 
 
 		 179 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2707  hypothetical protein  35.14 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0319  hypothetical protein  38.71 
 
 		 187 aa  85.1  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0287402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5534  hypothetical protein  31.97 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.264569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1171  hypothetical protein  32.88 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0021  Mammalian cell entry related domain protein  34.93 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.579673  normal  0.0449568 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0878  hypothetical protein  34 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.600632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3392  hypothetical protein  34.25 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1156  Mammalian cell entry related domain protein  31.51 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482142  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  36.23 
 
 		 529 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3400  hypothetical protein  36.3 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0981  hypothetical protein  34.29 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0999  hypothetical protein  39.64 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57850  hypothetical protein  37.84 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5026  hypothetical protein  37.84 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4445  mce-related protein  41.44 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0239  hypothetical protein  30.14 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.852395 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0960  hypothetical protein  38.74 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4139  hypothetical protein  40.54 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1330  hypothetical protein  38.3 
 
 		 168 aa  76.6  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.519307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3099  putative ABC transport system substrate-binding protein  34.93 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.369391  normal  0.460198 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0967  hypothetical protein  38.74 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12870  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, substrate binding protein  37.84 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2885  hypothetical protein  31.33 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.827962  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1391  hypothetical protein  34.55 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1576  hypothetical protein  41.75 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.667817  normal  0.289363 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1110  Mammalian cell entry related domain protein  36.36 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820134  normal  0.240411 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0865  hypothetical protein  38.74 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0450  mce family protein  30.26 
 
 		 185 aa  74.3  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.132036  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4255  hypothetical protein  38.74 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0514  hypothetical protein  30.26 
 
 		 185 aa  74.3  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449918  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1015  hypothetical protein  37.04 
 
 		 163 aa  73.9  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1144  hypothetical protein  30.26 
 
 		 185 aa  73.9  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1521  hypothetical protein  30.61 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.661029  normal  0.423884 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3806  Mammalian cell entry related domain protein  30.26 
 
 		 214 aa  73.6  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0010771  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0559  hypothetical protein  36 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>