241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0450 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1144  hypothetical protein  99.46 
 
 		 185 aa  379  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0514  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449918  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0450  mce family protein  100 
 
 		 185 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.132036  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0290  Mammalian cell entry related domain protein  69.84 
 
 		 188 aa  275  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.151432  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4358  hypothetical protein  80.62 
 
 		 183 aa  274  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52116  normal  0.0531845 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0283  Mammalian cell entry related domain protein  69.68 
 
 		 188 aa  273  8e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3648  Mammalian cell entry related domain protein  71.67 
 
 		 190 aa  268  2.9999999999999997e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3806  Mammalian cell entry related domain protein  79.11 
 
 		 214 aa  268  5e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0010771  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03058  predicted ABC-type organic solvent transporter  71.68 
 
 		 183 aa  248  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0328967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0514  Mammalian cell entry related domain protein  71.68 
 
 		 183 aa  248  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0145877  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03009  hypothetical protein  71.68 
 
 		 183 aa  248  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0277207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4515  Mce family protein  71.68 
 
 		 183 aa  248  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0766033  normal  0.489861 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3489  Mce family protein  71.68 
 
 		 183 aa  248  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0507  hypothetical protein  71.68 
 
 		 183 aa  248  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.945849  normal  0.16691 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3386  Mce family protein  71.68 
 
 		 183 aa  248  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000578801  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3681  Mce family protein  71.68 
 
 		 183 aa  248  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0116721  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3577  Mce family protein  71.68 
 
 		 183 aa  248  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.45422  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3629  hypothetical protein  66.29 
 
 		 187 aa  247  5e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.271767  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3572  Mce family protein  67.6 
 
 		 183 aa  245  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3501  Mce family protein  67.6 
 
 		 183 aa  245  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0513461  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3670  Mce family protein  67.6 
 
 		 183 aa  245  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0296035 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3503  Mce family protein  67.6 
 
 		 183 aa  245  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.869463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3608  Mce family protein  67.6 
 
 		 183 aa  245  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.345737 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1171  hypothetical protein  55.36 
 
 		 168 aa  192  3e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03656  hypothetical protein  53.61 
 
 		 165 aa  169  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002411  uncharacterized ABC transporter, periplasmic component YrbD  52.15 
 
 		 162 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0687  hypothetical protein  47.34 
 
 		 169 aa  155  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2885  hypothetical protein  48.1 
 
 		 160 aa  154  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.827962  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03184  mce family protein  51.59 
 
 		 157 aa  147  6e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2399  hypothetical protein  47.77 
 
 		 156 aa  147  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0343  hypothetical protein  48.73 
 
 		 187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.908048  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0334  hypothetical protein  48.1 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3569  Mammalian cell entry related domain protein  48.43 
 
 		 186 aa  143  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424468  hitchhiker  0.0000173433 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3514  ABC transporter, inner membrane subunit  50 
 
 		 184 aa  142  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.531635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5534  hypothetical protein  49.34 
 
 		 161 aa  141  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.264569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0559  hypothetical protein  51.32 
 
 		 154 aa  142  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2100  hypothetical protein  54.09 
 
 		 163 aa  140  7e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2937  hypothetical protein  44.3 
 
 		 162 aa  140  8e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.887715  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0389  putative signal peptide protein, toluene tolerance Ttg2C-like  46.25 
 
 		 181 aa  140  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2891  Mammalian cell entry related domain protein  41.99 
 
 		 175 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3079  mce-related protein  53.95 
 
 		 156 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.185697 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2691  hypothetical protein  50 
 
 		 189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0995365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0416  hypothetical protein  50 
 
 		 189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249405  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0395  hypothetical protein  49.34 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1156  Mammalian cell entry related domain protein  45.22 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482142  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3238  Mammalian cell entry related domain protein  44.31 
 
 		 175 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4231  hypothetical protein  53.5 
 
 		 155 aa  139  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0707498  hitchhiker  0.000253037 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2411  hypothetical protein  45.91 
 
 		 154 aa  139  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108225  normal  0.153742 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0795  hypothetical protein  45.86 
 
 		 168 aa  138  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2784  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component  43.04 
 
 		 155 aa  137  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162084  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0981  hypothetical protein  45.28 
 
 		 158 aa  137  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0735  virulence factor MCE-like protein  53.55 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.310055 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0498  hypothetical protein  51.61 
 
 		 157 aa  136  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000028229  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0680  hypothetical protein  55.92 
 
 		 157 aa  136  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.0968495 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2768  hypothetical protein  46.2 
 
 		 184 aa  136  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422541  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2960  signal peptide protein  45.39 
 
 		 173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432073  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3952  mce-related protein  55.92 
 
 		 157 aa  135  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0681  hypothetical protein  55.92 
 
 		 157 aa  135  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.726556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3341  hypothetical protein  55.92 
 
 		 157 aa  135  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.480692 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3120  hypothetical protein  46.05 
 
 		 173 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771354  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3607  hypothetical protein  51.95 
 
 		 156 aa  134  8e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0890  Mammalian cell entry related domain protein  44.38 
 
 		 156 aa  134  9e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0723  hypothetical protein  55.26 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1898  putative ABC transporter substrate-binding protein  46.58 
 
 		 155 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12870  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, substrate binding protein  46.1 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0098  hypothetical protein  48.1 
 
 		 160 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.334829  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0715  Mammalian cell entry related domain protein  55.26 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425168 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0694  hypothetical protein  55.26 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2221  hypothetical protein  41.94 
 
 		 153 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.693824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3368  hypothetical protein  50.32 
 
 		 157 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.150445  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3660  hypothetical protein  55.26 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0108071  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0724  hypothetical protein  55.26 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.150028 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0507  toluene tolerance protein Ttg2C  51.23 
 
 		 164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.418128  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2118  hypothetical protein  42.38 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3302  hypothetical protein  53.29 
 
 		 157 aa  129  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.132932 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0097  Mammalian cell entry related domain protein  46.71 
 
 		 160 aa  129  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000148019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2747  hypothetical protein  42.58 
 
 		 161 aa  127  6e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3099  putative ABC transport system substrate-binding protein  49.37 
 
 		 160 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.369391  normal  0.460198 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0750  hypothetical protein  43.42 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0718  Mammalian cell entry related domain protein  43.42 
 
 		 161 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3002  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  50 
 
 		 176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.784047  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4534  mce family protein  50.63 
 
 		 157 aa  125  5e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.623769  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0319  hypothetical protein  46.5 
 
 		 187 aa  125  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0287402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3257  hypothetical protein  48.03 
 
 		 179 aa  124  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0878  hypothetical protein  41.56 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.600632  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2724  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  48.68 
 
 		 184 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3702  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  49.35 
 
 		 188 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3675  mce family protein  49.35 
 
 		 189 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.090883  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3733  mce family protein  49.35 
 
 		 186 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2774  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  49.35 
 
 		 186 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  49.35 
 
 		 186 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42671  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1779  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  49.35 
 
 		 186 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0960  hypothetical protein  43.71 
 
 		 161 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4445  mce-related protein  45.7 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2218  hypothetical protein  46.36 
 
 		 154 aa  122  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4139  hypothetical protein  45.03 
 
 		 155 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0384  Mammalian cell entry related domain protein  38.22 
 
 		 152 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.214826 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1967  hypothetical protein  36.9 
 
 		 166 aa  120  9e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.539275  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0967  hypothetical protein  43.11 
 
 		 161 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3392  hypothetical protein  43.67 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>