More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1041 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1041  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  294  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0815  mce-related protein  74 
 
 		 149 aa  226  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0786  virulence factor MCE-like protein-related protein  76 
 
 		 150 aa  224  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0560  hypothetical protein  69.39 
 
 		 148 aa  212  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000625618  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3183  Mammalian cell entry related domain protein  69.33 
 
 		 150 aa  209  9e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1818  hypothetical protein  57.05 
 
 		 148 aa  164  4e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0854  Mammalian cell entry related domain protein  57.72 
 
 		 148 aa  159  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.102404 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  55.03 
 
 		 148 aa  157  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0534  Mammalian cell entry related domain protein  54.86 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0449  ABC-type transport system protein  50.68 
 
 		 148 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.58514e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0403  hypothetical protein  45.95 
 
 		 146 aa  134  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0474  hypothetical protein  46.67 
 
 		 164 aa  133  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000014845  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1007  Mammalian cell entry related domain protein  38.93 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.063355  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3702  hypothetical protein  41.89 
 
 		 149 aa  117  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2960  signal peptide protein  38.93 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2891  Mammalian cell entry related domain protein  38.67 
 
 		 175 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3238  Mammalian cell entry related domain protein  38.67 
 
 		 175 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  43.26 
 
 		 529 aa  100  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1967  hypothetical protein  37.91 
 
 		 166 aa  99.8  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.539275  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0384  Mammalian cell entry related domain protein  38.78 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.214826 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3120  hypothetical protein  38.26 
 
 		 173 aa  99.8  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771354  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2118  hypothetical protein  39.87 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0160  mce-related protein  34.9 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0339  Mammalian cell entry related domain protein  34.9 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.620596 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0098  hypothetical protein  38.67 
 
 		 160 aa  98.6  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.334829  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2691  hypothetical protein  36.24 
 
 		 189 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0995365  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0395  hypothetical protein  36.24 
 
 		 187 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0416  hypothetical protein  36.24 
 
 		 189 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249405  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0795  hypothetical protein  37.58 
 
 		 168 aa  94.7  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0097  Mammalian cell entry related domain protein  37.33 
 
 		 160 aa  94  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000148019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0761  Mammalian cell entry related domain protein  36.88 
 
 		 145 aa  92.8  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3514  ABC transporter, inner membrane subunit  35.57 
 
 		 184 aa  92.8  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.531635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1898  putative ABC transporter substrate-binding protein  38.93 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2747  hypothetical protein  37.58 
 
 		 161 aa  92.4  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0343  hypothetical protein  35.57 
 
 		 187 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.908048  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2937  hypothetical protein  34.9 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.887715  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0450  mce family protein  36.6 
 
 		 185 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.132036  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1144  hypothetical protein  36.6 
 
 		 185 aa  92  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3827  virulence factor Mce family protein  38.85 
 
 		 364 aa  92.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0514  hypothetical protein  36.6 
 
 		 185 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449918  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0334  hypothetical protein  35.57 
 
 		 187 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0739  Mammalian cell entry related domain protein  36.05 
 
 		 152 aa  90.9  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.942465  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2784  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component  33.1 
 
 		 155 aa  90.5  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162084  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2768  hypothetical protein  36.24 
 
 		 184 aa  89.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3257  hypothetical protein  40.94 
 
 		 179 aa  89.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5534  hypothetical protein  35.1 
 
 		 161 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.264569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0389  putative signal peptide protein, toluene tolerance Ttg2C-like  35.33 
 
 		 181 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2399  hypothetical protein  33.56 
 
 		 156 aa  88.2  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3569  Mammalian cell entry related domain protein  34.9 
 
 		 186 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424468  hitchhiker  0.0000173433 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0239  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  87.4  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.852395 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2218  hypothetical protein  35.17 
 
 		 154 aa  87.8  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2411  hypothetical protein  35.81 
 
 		 154 aa  87.4  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108225  normal  0.153742 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2221  hypothetical protein  35.66 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.693824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0890  Mammalian cell entry related domain protein  35.57 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0718  Mammalian cell entry related domain protein  34.44 
 
 		 161 aa  85.1  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4358  hypothetical protein  32.68 
 
 		 183 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52116  normal  0.0531845 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0687  hypothetical protein  32.67 
 
 		 169 aa  85.1  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1156  Mammalian cell entry related domain protein  34 
 
 		 163 aa  84.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482142  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0750  hypothetical protein  34.44 
 
 		 161 aa  84.7  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1750  hypothetical protein  34.69 
 
 		 178 aa  84.3  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3022  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component-like protein  37.12 
 
 		 355 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3296  hypothetical protein  34.48 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3099  putative ABC transport system substrate-binding protein  38.67 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.369391  normal  0.460198 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0319  hypothetical protein  36.67 
 
 		 187 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0287402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2707  hypothetical protein  31.33 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0878  hypothetical protein  34.21 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.600632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0517  virulence factor Mce family protein  35.56 
 
 		 355 aa  78.2  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  33.58 
 
 		 515 aa  78.6  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0283  Mammalian cell entry related domain protein  31.37 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2724  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.24 
 
 		 184 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3702  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.24 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3002  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.24 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.784047  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3733  mce family protein  36.24 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2774  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.24 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1779  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.24 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.24 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42671  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3675  mce family protein  36.24 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.090883  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0171  hypothetical protein  33.06 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0290  Mammalian cell entry related domain protein  31.37 
 
 		 188 aa  77.4  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.151432  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0119  virulence factor MCE-like protein  34.93 
 
 		 343 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.410781  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0109  virulence factor Mce family protein  34.93 
 
 		 343 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.971857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0128  virulence factor Mce family protein  34.93 
 
 		 343 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284372  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1818  toluene tolerance protein  35.37 
 
 		 178 aa  77  0.00000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3806  Mammalian cell entry related domain protein  32.28 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0010771  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3648  Mammalian cell entry related domain protein  33.33 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3392  hypothetical protein  36.67 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4445  mce-related protein  39.47 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4139  hypothetical protein  38.6 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1391  hypothetical protein  35.4 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1110  Mammalian cell entry related domain protein  35.78 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820134  normal  0.240411 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12870  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, substrate binding protein  32.89 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03058  predicted ABC-type organic solvent transporter  33.12 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0328967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0514  Mammalian cell entry related domain protein  33.12 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0145877  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3386  Mce family protein  33.12 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000578801  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03009  hypothetical protein  33.12 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0277207  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1171  hypothetical protein  32.45 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3489  Mce family protein  33.12 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0507  hypothetical protein  33.12 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.945849  normal  0.16691 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3577  Mce family protein  33.12 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.45422  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3681  Mce family protein  33.12 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0116721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>